The utility F-box for protein destruction

A signature feature of all living organisms is their utilization of proteins to construct molecular machineries that undertake the complex network of cellular activities. The abundance of a protein element is temporally and spatially regulated in two opposing aspects: de novo synthesis to manufacture the required amount of the protein, and destruction of the protein when it is in excess or no longer needed. One major route of protein destruction is coordinated by a set of conserved molecules, the F-box proteins, which promote ubiquitination in the ubiquitin-proteasome pathway. Here we discuss the functions of F-box proteins in several cellular scenarios including cell cycle progression, synapse formation, plant hormone responses, and the circadian clock. We particularly emphasize the mechanisms whereby F-box proteins recruit specific substrates and regulate their abundance in the context of SCF E3 ligases. For some exceptions, we also review how F-box proteins function through non-SCF mechanisms.     

The three-fingered protein domain of the human genome

Extracellular domains of some cellular receptors expressed in the organisms at different levels of development belong to three-fingered protein (TFP) fold. The Homo sapiens genome encodes at least 45 genes containing from one to three TFP domains (TFPDs), namely diverse paralogues of the Ly6 gene, CD59 and the receptors of activins, bone morphogenetic proteins, Mullerian inhibiting substance and transforming growth factor-β. C4.4a and urokinase/plasminogen activatory receptor contain two and three TFPD repeats, respectively. These diverse proteins have a low overall sequence similarity with each other and their hydrophobicity levels vary to a considerable degree. It is suggested that sequence differentiation within the TFPD led to distinct groups of proteins whose attributes were optimized to fit both the physicochemical properties specific to their functional microenvironment and selective targeting of their highly diversified extracellular cofactors. Electronic supplementary material  The online version of this article (doi:) contains supplementary material, which is available to authorized users. Received 7 August 2008; accepted 29 August 2008     

恶性肿瘤中IGFBP-rP1的抑癌基因作用机制及其可能的临床实用价值

胰岛素样生长因子结合蛋白相关蛋白1(IGFBP-rP1)是近年来恶性肿瘤的研究热点.本文主要综述IGFBP-rP1在恶性肿瘤中的抑癌基因作用机制及可能的临床实用价值.IGFBP-rP1在恶性肿瘤中的作用广泛涉及细胞的增殖、衰老、凋亡、分化、血管生成等多方面,研究指出IGFBP-rP1可缩短细胞增殖周期并影响非停泊性生长从而抑制增殖,降低致瘤能力;调节BRAF-MEKERK信号通路及pRB、HSP60等相关蛋白的表达从而影响衰老及凋亡;主要通过IGF依赖方式抑制血管生成;而且IGFBP-rP1表达下降跟肿瘤细胞分化程度降低有关.研究显示IGFBP-rP1有一定的临床实用价值,如其表达量跟恶性肿瘤的进展相关,低表达提示某些化疗药物抵抗,可提示预后.而在恶性肿瘤中特异性地上调IGFBP-rP1,可抑制肿瘤增殖及血管生成、诱导细胞衰老凋亡、提高肿瘤分化程度及化疗敏感性,具有治疗意义,但研究者们还在努力探究,争取早日找到一种临床有效的靶向IGFBP-rP1的基因治疗方法.     

P16及COX-2蛋白在宫颈癌中表达及意义

目的 探讨P16及COX-2蛋白在宫颈癌中表达及意义.方法 收集宫颈活检或手术标本138例,采用免疫组织化学方法分别检测P16及COX-2蛋白的表达,并分析结果.结果 正常宫颈组织、宫颈低级别上皮内瘤变(LSIL)、宫颈高级别上皮内瘤变(HSIL)、宫颈癌中P16蛋白阳性表达分别为0％(0/30)、42.3％ (11/26)、71.9％(23/32)、92％(46/50).COX-2蛋白阳性表达分别为3.3％(1/30)、50％(13/26)、75％(24/32)、88％ (44/50).随着宫颈病变分级升高,P16及COX-2蛋白阳性率逐渐上升,统计学差异有显著性(p＜0.05);结论 P16及COX-2的高表达在宫颈癌的发生、发展中均起作用.     

外源性H2S通过调节β-位淀粉样前体蛋白裂解酶1表达对PC12细胞APP／Aβ代谢的影响

目的观察外源性硫化氢对嗜铬细胞瘤细胞β-位淀粉样前体蛋白裂解酶1（BACE1）的调节作用,进而探讨其对淀粉样前体蛋白／β-位淀粉样蛋白代谢途径的影响。方法用硫氢化钠作外源性H2s供体,实验设空白对照组、NaHs50μmol／L组、NaHS100μmol／L组和NariS200μmol／L组,按分组浓度处理PC12细胞24h后,RT-PCR和Western blot法检测细胞内BACE1 mRNA及蛋白表达,并用Western blot法继而检测APP代谢过程中关键蛋白APP、C99、C83表达变化,EusA法检测细胞培养液中AB40和AB42水平。结果NaHS在实验浓度范围内从基因与蛋白两个水平上呈剂量依赖性下调BACE1表达,并下调C99、Ap40和Ap42蛋白表达,上调C83蛋白,各NaHS组分别与对照组比较,差别均有统计学意义（P〈0．05）,而对APP蛋白表达没有影响,各组间比较差别无显著性（P〉0．05）。结论外源性H2s具有通过调节PC12细胞BACE1表达下调APP／Aβ代谢的作用。     

日粮蛋白质水平对鹅生长性能及肉质的影响

选取28日龄、体重相近的合浦灰鹅60只,随机分为3个组,采用精料 青料(黑麦草等)混合的方式进行饲喂试验,试验期为42天。第70d采血测定血清中尿素氮、转氨酶活性、血脂和脂蛋白等生化指标,并进行屠宰测定和肌肉营养成分含量测定。试验结果表明:(1)生长前期(28~49日龄),第2组日增重较高,各组间差异不显著(P>0.05);生长后期(50~70日龄)第1组日增重较高,各组间差异不显著(P>0.05)。(2)鹅的血清尿素氮含量随饲粮粗蛋白质水平的降低而下降(P<0.05);血清转氨酶活性、脂类和脂蛋白含量等组间无显著差异。(3)饲粮粗蛋白质水平对肉鹅屠宰性能无显著影响,鹅肉中的干物质、粗蛋白质、氨基酸总量、必需氨基酸总量、肌内脂肪、肌苷酸含量与蛋白质有正相关,各组间差异不显著(P>0.05),随着蛋白质水平提高,肌肉的营养和风味有改善的趋势。     

实时荧光定量PCR检测原发性肝癌中hNTKL-BP1基因的表达

分别提取手术切除人原发性HCC肝癌和癌旁肝组织总RNA并逆转录为cDNA,在hNTKL-BP1基因的高保守区设计相应引物和Taqman荧光探针,实时检测PCR产物的荧光强度,采用2-△△Ct方法分析比较该基因在人类肝癌组织和癌旁肝组织中的表达差异.结果是44例原发性HCC肝癌组织中hNTKL-BP1基因表达水平显著高于癌旁肝组织(t=2.69,P<0.01),肝癌组织与癌旁肝组织hNTKL-BP1基因表达差异和肿瘤大小有一定的相关性(P=0.028),hNTKL-BP1基因可能与肝癌的发生、发展有一定相关性.     

淋巴囊肿病病毒主要衣壳蛋白1.3 kb基因片段的原核表达

取淋巴囊肿病病毒感染牙鲆组织,蛋白酶K裂解,PCR法成功获得了淋巴囊肿病病毒主要衣壳蛋白1.3 kb基因片段.构建其原核表达载体,IPTG诱导表达.结果表明,该融合蛋白分子量约70 kD,可与抗LCDV多克隆血清特异反应.为LCDV基因工程疫苗的研制奠定了实验基础.     

用AFM观察小白鼠心肌核DNA片段的基因体外转录和垃圾DNA的相互作用

用AFM直接观察、体外转录等实验技术组合,发现小白鼠(Balb/C)心肌体外转录状态的核DNA片段上的各种基因,处于垃圾DNA的特定的“转录平台”上。“转录平台”上的各种核活性基因的两端的调控序列,分别与特定开关蛋白质复合体结合(即可解离的开关蛋白质),中间的编码序列分别以非共价键特异结合可完全解离的转录活性因子等多种蛋白质;这些与核基因转录相关的蛋白质均由垃圾DNA的专一性蛋白质通路分别进行特异性正负反馈调控。     

苏云金杆菌晶体蛋白Cyt1A对营养期杀虫蛋白Vip3A杀虫毒力的影响

为检测苏云金杆菌晶体蛋白Cyt1A对Vip3A表达和杀虫活性的影响,将p20和cyt1A基因与vip3A基因连接构建了重组质粒pHVC20,然后电激转化至苏云金杆菌无晶体突变株CryB中进行了共表达,以单独表达Vip3A蛋白的CryB(pHPT3)作为对照菌株。Westernblot结果显示,Vip3A蛋白在CryB(pHVC20)菌株中的最大表达量约为在CryB(pHPT3)菌株的2倍,这可能是由于前者中的辅助蛋白P20增加了Vip3A表达量的缘故,晶体蛋白Cyt1A的存在对Vip3A的正常表达没有影响。生物测定结果表明,CryB(pHVC20)和CryB(pHPT3)菌株对斜纹夜蛾初孵幼虫的LC50值分别为10.62!g/ml和78!g/ml,前者的毒力比后者提高了6倍,这表明Cyt1A蛋白和Vip3A蛋白对目标昆虫的毒力可能存在着协同增效作用。