施氏屋顶鼠和海南屋顶鼠的线粒体12S rRNA基因序列的歧异及其系统进化关系

屋顶鼠的两个亚种--施氏屋顶鼠和海南屋顶鼠的外形和毛色相似,在一些标本的测量记录中,它们间的主要区别特征之一的尾长与体长比却是不肯定的.在广东,海南屋顶鼠仅分布于粤西区,而施氏屋顶鼠则分布于其余区域.在我们的这项研究中,采用了9个分别来自于施氏屋顶鼠(龙门种群和香港种群)及海南屋顶鼠的样品进行了线粒体12S rRNA 基因的测序,在所分析的 385个核苷酸位点长度的片段中,包含有26个变异位点和14个简约信息点,观察到3个插入/缺失位点.通过邻接法和最大简约法重建这些鼠类样品的系统进化关系.相比于施氏屋顶鼠的香港种群,海南屋顶鼠与施氏屋顶鼠的龙门种群有着更紧密的亲缘关系.基于12S rRNA 基因片段的序列数据,本项分析不赞同把海南屋顶鼠分类成为一个亚种的观点,认为海南屋顶鼠的形态变化是自然选择的结果,并由此导致当地适应和地理隔离.     

一种优化的双向凝胶电泳方法

双向凝胶电泳技术是蛋白质组学研究的基础性技术平台 ,如何得到一张高质量的双向凝胶电泳图谱是进一步深化研究的关键 .该文利用人永生化食管上皮细胞系SHEE为材料 ,采用IPG DALT系统双向凝胶电泳技术 ,通过对样品的制备及预处理、第一向等电聚焦、平衡和两向间的转移等关键步骤进行改进和优化 ,获得了高分辨率、高重复性的双向凝胶电泳图谱     

珠鸡mtDNA的限制性图谱

应用AvaⅠ，BamHⅠ,BglⅠ,DraⅠ,EcoRⅠ,HpaⅠ,PvuⅡ,SacⅠ,SalⅠ,ScaⅠ和StuⅠ共11种限制酶对珠鸡（Acryllium vulturinum)mtDNA进行单酶切分析，结果表明，珠鸡mtDNA的分子量为16.7kb，另以其中除AvaⅠ和StuⅠ外的9种限制酶进行双酶切分析，构建了珠鸡mtDNA的限制性图谱，并与家鸡（Gallus gallus domesticus)比较，二者mtDNA序列歧异值为0.073。     

蛋白质组亲和分离研究(Ⅰ)蛋白质氨基生物素化反应条件的研究

运用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法,以马心肌红蛋白为代表研究蛋白质氨基生物素化的条件,包括蛋白质与生物素量的关系、反应物浓度、反应完全所需的时间以及蛋白质助溶剂对反应的影响等,为基于生物素—抗生物素蛋白质相互作用的亲和分离,简化复杂蛋白质组体系,实现蛋白质的分析鉴定奠定基础。     

羚牛线粒体DNA和系统进化研究

用8种限制酶分析了5种牛科动物，羚牛、黄牛、水牛、绵羊和山羊的线粒体DNA的多态性。依据数学模型计算这5种动物间的遗传距离，在此基础上构建了UPG和NJ两种分子系统进化树。结果表明：羚牛与牛和羊的分化时间分别为4．02Ma和3．72Ma，因此将羚牛归入羊亚科较为合理。     

冷驯化对中缅树鼩肝脏线粒体呼吸的影响

文章通过测定中缅树鼠句在冷驯化(1h,4h,8h,1d)中肝脏线粒体呼吸状态III和状态IV呼吸的变化情况,从而探讨中缅树鼠句对不同冷环境的适应情况及中缅树鼠句肝脏产热的机理及其与质子漏的产热的关系。     

雀科9种鸟类11个线粒体tRNA基因序列及二级结构比较研究

利用PCR方法对雀科9种鸟类11个线粒体基因组中3个主要的tRNA基因簇,即IQM(tRNAIle-tRNAGln-tRNAMet),WANCY(tRNATrp-tlRNAAla-tRNAsn-tRNACyB-tRNATyr)和HSL(tRNAHis-tRNASer(AGY)-tRNALeu(CUN))进行扩增和序列测定,这些tRNA基因序列中可变核苷酸位点占15%,其中59%出现在环区,且存在插入核苷酸;茎区相对保守,其中一些变异如双链的互补性碱基突变,G-u配对等对于维系tRNA二级结构的稳定性非常重要.利用11个线粒体tRNA基因全序列,以鹌鹑为外群构建了雀科9种鸟类的系统发育树,结果表明:黄雀与其它物种关系较远;鹀亚科中灰头鹀与雀亚科关系最近,而小鹀与三道眉草鹀比较特化,这与根据二级结构特征得出的结论相吻合.利用茎区序列构建的NJ树在鹀亚科物种的分类地位上存在分歧,可能是由于核苷酸数目较少,信息量小,在解决近缘物种间的分类地位时受到限制.结合线粒体tRNA基因二级结构特征比较和系统发育分析,初步认为线粒体tRNA基因二级结构特征对于推断雀科属间的分类地位具有较高的置信度.     

中华假磷虾线粒体DNA COI基因片段序列分析

采用苯酚-氯仿提取、异丙醇沉淀提取中华假磷虾基因组DNA;以相应引物经PCR扩增得到线粒体DNACOI片段;PCR产物采用化学法与载体(pGEM-TEasyVector)重组基因、热休克法转化重组质粒至感受态大肠杆菌(JM109)、氨苄LB培养基扩大培养;测序.结果表明,中华假磷虾线粒体COI碱基709bp,其碱基组成A、T、G、C含量分别为28 59%、35 35%、17 61%和18 45%(国际基因库索引号AY754819);与同科内其它3属10种磷虾的mtCOI基因片段核苷酸组成相似.     

中国两性生殖卤虫早期胚胎发育蛋白的双向电泳条件优化

采用双向电泳技术对中国卤虫胚胎发育到5 h时的蛋白组进行研究与分析.考察不同条件对双向电泳结果的影响,分别从上样量、染色方法、分离胶浓度等3方面进行研究.实验结果显示上样量为400 μg时图谱的斑点数较多;采用银染法所得实验结果优于考染;同时分离胶浓度为10%时所得蛋白斑点数较多.优化的实验条件为进一步研究中国卤虫蛋白组奠定基础.