我国药用价值地方鸡种的遗传多样性研究

通过选用30个多态性较好的微卫星标记,检测了9个药用价值地方鸡品种:郧阳白羽乌鸡、乌蒙乌骨鸡、盐津乌骨鸡、腾冲雪鸡、余干乌骨鸡、兴文乌骨鸡、石棉草科鸡、沐川乌骨鸡、泸宁鸡的遗传多样性。利用等位基因频率计算各群体平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的遗传距离(Ds)。结果表明:30个微卫星位点中有24个微卫星位点在9个鸡群体中PIC均为高度多态,可作为有效遗传标记用于各鸡品种的遗传多样性和系统发生关系的分析。在9个品种中,杂合度最低的是郧阳白羽乌鸡,为0.640;杂合度最高的是腾冲雪鸡,为0.690。因此药用价值地方品种鸡的H都偏高,据分析可能是这些药用价值地方品种鸡都产于交通闭塞的山区,形成了家禽品种的多种多型,而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性;对Ds的计算表明:体格较大的泸宁鸡与萁它品种距离较远;用UPGMA法进行聚类分析,结果9个鸡品种被聚为3类:郧阳白羽乌鸡、沐川乌骨鸡、盐津乌骨鸡和腾冲雪鸡聚为一类;余干乌骨鸡、兴文乌骨鸡、乌蒙乌骨鸡和石棉草科鸡聚为一类;泸宁鸡独自聚为一类。这与几个鸡品种的来源、分化、选育历史及地理分布是一致的。     

Chicken QTL mapping by multiplex PCR

To facilitate rapid determination of the chromosomal location of quantitative trait loci' the current approaches to gene mapping are improved using a multiplex PCR technique. The high-throughput linkage analysis method described here allows selection of 178 from 328 microsatellite markers through the multiplex PCR method combined with the semi-automatic fluorescence-labeled DNA analysis technology. Those polymorphism markers are distributed on 23 autosomes and one sex chromosome (chromosome Z). covering 3080cM genetic distance. The average marker density is 18cM. dispersed into 30 different sets. These selected polymorphism microsatellite markers segregate with the family members, following the Mendel's heritage laws, and are very useful for chicken linkage map analysis as well as for the research on some important economic quantitative characters of chicken.     

应用DNA分子遗传标记研究药用植物道地性的进展

从药用植物道地性研究中的DNA分子标记、DNA分子标记在道地药材鉴定以及道地性的形成机制研究中的应用等3个方面综述了近年来DNA分子遗传标记技术应用与药用植物道地性研究取得的主要进展,并提出了今后研究中值得注意的问题.     

深圳塘朗山桫椤孑遗种群的遗传分化研究

应用RRPD标记分析了深圳塘朗山桫椤孑遗种群全部57个个体的遗传变异和进化关系。50个引物共检测到171个位点，其中多态位点10个，多态位点比率5．85％。基于基因频率的Shannon多样性指数平均值为0.0165，Nei基因多样度指数平均值为0．0094，表明该种群的遗传多样性水平极低。对Jaccard相似性系数矩阵用UPGMA法进行聚类分析显示，57个个体可分为4个亚群。RAPD谱带表型的主成分分析(PCA)支持聚类分析结果。根据研究结果讨论了种群的管理和保护策略。     

水稻早熟基因显性抑制基因的遗传分析和分子标记定位

将明恢63，9311，IR68，献国和BG1639等5个迟热水稻品种与早籼核不育系6442S—7杂交，对F1，F2代以及三交F1群体进行抽穗期遗传分析．结果表明，9311，IR68，献国和BG1639等4个迟熟品种含有1对等位的显性抑制基因，可部分地抑制6442S—7显性早熟基因的表达．以6442S—7∥明恢63／9311三交F1群体为定位群体，利用微卫星标记将该抑制基因定位于水稻第8染色体短臂上．该抑制基因命名为Su—Ef-cd(t)，并认为该基因对于利用6442S—7早熟基因来培育不同熟期的早熟和中早熟品种具有重要意义．     

内皮前体细胞的分离与培养

骨髓、外周血和脐血中包含内皮前体细胞,具有分化为成熟内皮细胞的能力,在血管新生和血管修复中起到功能性重要作用,因此,内皮前体细胞的分离与体外培养对于血管疾病的治疗具有重要的意义。本文主要论述了内皮前体细胞的分离、培养、鉴定以及在血管生成治疗中的作用。     

Screening microsatellite markers from EST sequences of bay scallop Argopecten irradians

Seventy-five simple sequence repeats （SSRs） were identified by the bioinformatic analysis from 5008 expressed sequence tags （ESTs） of Argopecten irradians. Among the SSRs, the number of repeat nucleotide varied from 2 to 6. Dinucleotide and trinueleotide repeat motifs were dominant in EST-SSRs of bay scallop, with a proportion of 80% over the total screened SSRs. Twenty-nine pairs of primer were designed based on the flank sequences of the selected ESTs using the software of Primet 5, and verified under the given PCR reaction condition. Eighteen of the 29 primer pairs resulted in the expected products, while the remaining either failed to produce any fragments or yielded products over expected size. Thirteen of the 18 SSRs, accounting for 72%, were detected to show polymorphism in the examined scallop samples. A preliminary test in this study indicated that the majority of the identified SSRs were informative in the cultured bay scallops, making them suitable for the population and other genetic analysis. EST-SSR markers have more advantages than the traditional genomic-derived SSRs and there is a wide range of application in comparative mapping, functional gene cloning and marker assisted selection. This research provides a reference to the identification of EST-SSRs with relative bioinformatic analysis from aquaculture species, as well as to those with a large number of ESTs.     

基于TCGA分析GALNT14在肾透明细胞癌中的表达及预后意义

本研究拟探索N-acetylgalactosaminyltransferase 14 ( GALNT14)的表达水平对肾透明细胞癌(Kidney Renal Clear Cell Carcinoma, KIRC)的临床预后意义及其在疾病进展中的功能。从The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库获取肾透明细胞癌的临床信息和相应的mRNA表达数据,使用R语言进行差异表达分析和配对差异表达分析,检测 GALNT14在肾透明细胞癌的表达;通过Logistic回归分析、Kaplan-Meier生存分析和COX回归分析探究 GALNT14的表达量与肾透明细胞癌临床特征的相关性;从STRING数据库中获得GALNT14相互作用的蛋白质,通过Linkedomics和GeneMANIA数据库分析GALNT14的蛋白质-蛋白质相互关系;通过基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)探索 GALNT14在肾透明细胞癌中介导的生物信号通路。结果表明,肾透明细胞癌组织中 GALNT14的mRNA相对表达量显著高于癌旁组织;肾透明细胞癌 GALNT...     

中国美利奴羊(新疆军垦型)超细品系微卫星多态性的研究

选择分布在绵羊第6号染色体上的4个微卫星基因座OarDB6、BM1824、BM6438、BM6506,利用PAGE凝胶电泳检测微卫星在中国美利奴羊（新疆军垦型）超细品系中的等位基因数,计算等位基因频率（Pi）、遗传杂合度（H）和多态信息含量（PIC）,分析了中国美利奴羊（新疆军垦型） 微卫星DNA的多态性.4个微卫星位点OarDB6、BM1824、BM6438、BM6506在中国细毛羊品种超细品系中PIC平均值为0.6074,该4个微卫星位点可以用于中国细毛羊遗传多样性的评估.遗传杂合度平均值为0.86145,表明该品系绵羊遗传多态性丰富,群体遗传变异较大,并且4个微卫星基因座适用于绵羊的遗传连锁分析研究.     

中华绒螯蟹Eriocheir sinensis两个地理种群的微卫星DNA多态性分析

为了获取中华绒螯蟹群体遗传多态性的基本数据，寻找合适的遗传标记区分不同种类及不同水系的河蟹种群，采用微卫星DNA分型技术，对江苏地区两个地理种群（本地种与荷兰种）的中华绒螯蟹共计140个样本，通过DNA提取、PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染检测的方法，进行了两个微卫星基因座（Esin 67和Esin 87）的遗传多态性分析．结果表明：中华绒螯蟹本地种与荷兰种的两个微卫星基因座均有较好的多态性；在Esin 67基因座中，本地种和荷兰种绒螯蟹均有8个等位基因，两组的最高频率等位基因均为8重复序列；在Esin 87基因座中，本地种绒螯蟹有9个等位基因，荷兰种有7个等位基因，两组的最高频率等位基因均为9重复序列．同时中华绒螯蟹荷兰种这两个基因座的杂合度和多态性信息含量均高于本地种．这些结果提示了江苏本地的绒螯蟹可能受到其它地区河蟹的种质污染，基因多态性下降，因此需要加强对种质资源遗传变异的深入研究，以便采取措施对河蟹资源进行合理的管理、保护和开发利用．