MiRfilter:一个预测病毒microRNA的计算工具

采用生物信息学方法开发了一个预测病毒miRNA的计算机程序MiRfilter,通过提取已知的病毒miRNA的生物学特征,规定参数及参数范围,并以此为筛选标准,预测潜在的病毒miRNA.用EBV和RLCV两种病毒的正负样本对MiRfilter的预测精度进行检测.MiRfilter从39个EBV已知的miRNA中正确识别了30个,从116个负数据中检测到9个假阳性数据;从20个RLCV的miRNA中正确识别了15个,从108个负数据中检测到2个假阳性数据.用取自果蝇和线虫预测区域的186个负数据检测MiRfilter的特异性,在186个负数据中没有预测出假阳性序列.     

气相色谱法测定工业甘油含量

本文使用Ｃｈｒｏｍｏｓｏｒｂ—１０１固定相作为柱填料，采用气相色谱法测定水溶液中甘油。操作过程简便，测定结果准确。实验选择了最佳汽化温度、柱温和载气流速。     

非小细胞肺癌外周血有核细胞miRNA表达特点研究

miRNA在非小细胞肺癌的发生发展中发挥重要作用,为了解非小细胞肺癌患者外周血有核细胞的miRNA表达特征及其作用,采用第二代高通量测序技术对7例非小细胞肺癌患者和7例对照的外周血有核细胞miRNA表达水平进行检测,比较非小细胞肺癌患者与对照的外周血有核细胞miRNA表达特征,分析两者miRNA表达水平差异情况,共鉴定出非小细胞肺癌患者与对照的外周血有核细胞中有显著表达差异的miRNA 209种,其中肺癌样本miRNA表达上调的有138种,表达下调的有71种.研究结果显示非小细胞肺癌患者与对照样本的外周血有核细胞中miRNA表达具有显著差异,其中部分已被证实参与肿瘤发生、发展等过程.     

miRNA作用通路研究

后基因组时代的分子生物学研究需要从整体的角度,系统地阐述基因参与的生物调控过程,已有的通过构建基因调控网络的方式所做的系统生物学研究主要关注于蛋白编码基因之间的相互作用。随着近年来非编码RNA（noncoding RNA）,特别是miRNA研究的深入,显示生物体内存在着广泛的基因转录后调控。本论文通过建立综合蛋白质编码基因与miRNA基因相互作用关系的基因调控网络,分析了人类基因组中涉及miRNA的三类作用模式：（1）宿主基因与内含子miRNA共同作用于另一个蛋白编码基因。（2）miRNA簇中的不同miRNA分别作用于存在着相互作用的两个蛋白编码基因。（3）由两个宿主基因与其各自的内含子miRNA形成双向负调控回路。本研究的结果为进一步认识人类miRNA基因的功能特性提供了重要参考,研究所预测的数据为实验验证提供了依据。     

miRNA与肿瘤发生

肿瘤发生的机制是细胞出现失控性增殖。肿瘤的发生一直被广泛认为是由于一系列癌基因蛋白和抑癌基因蛋白的开放读码框的突变而逐步形成的。随着非编码RNA（ncRNA）的发现，传统观念正被改变。最近的研究表明非编码RNA中的成员miRNA可能对于肿瘤的形成起着重要的调控作用。 miRNA（microRNA）是一类高度保守的非编码RNA（ncRNA），长度一般为19—25nt的单链型RNA（ssRNAs），由60．110nt的可形成发夹状的内源性转录前体加工而成。miRNA与靶mRNA的3’UTR碱基配对，通过抑制mRNA的翻译或直接使mRNA降解，在转录后水平使基因产生沉默。越来越多的证据显示由miRNA调节的基因调控机制作为基因表达水平调控的一种重要方式，与肿瘤的发生密切相关。     

高血压病气虚血瘀证患者血清对CRL-1730凋亡相关基因、miRNA表达的影响及补阳还五汤的干预作用

为探讨高血压病气虚血瘀证患者血清对人脐静脉内皮细胞株(CRL-1730)凋亡的影响与其作用机制.应用实时定量PCR(polymerase chain reaction)芯片技术检测与miRNA芯片技术分别检测与人细胞凋亡相关的89个关键基因和384个miR-NAs的表达.高血压病气虚血瘀证组与非气虚血瘀证组比较,有1个...     

十三味肺清糖浆的制备及质量标准的研究

优选十三味肺清糖浆的最佳制备工艺,建立科学严谨的质量控制方法.以主要成分黄芩苷的含量为指标,采用正交试验方法对超声提取工艺进行研究.单因素考察法优选101澄清剂加入比例.以紫外分光光度法和薄层色谱法制定质量标准.制备工艺为即超声提取2次,每次2 h,提取功率360W,再加入8%的101澄清剂滤过.并制定了黄芩和百部质量控制标准.本制备工艺简单可行,澄明度好,剂型改革合理.     

血清miRNA提取方法的优化

利用正交试验法优化血清miRNA的提取方法,为进一步研究血清miRNA作为生物标记物提供方法学基础.本文以hsa-miRNA-223-3p,hsa-miRNA-483-5p和hsa-miRNA-16为检测目标,通过比较Trizol法和Trizol+酚/氯仿法的miRNA提取效率和qPCR检测结果,应用正交试验选择出最优实验方案.结果表明血清miRNA的最优提取方法为:血清用DEPC水4倍稀释,离心条件为4℃,12 000r·min-1,离心时间为10min,Trizol法提取.     

弱精症患者精子miRNA表达谱的构建和分析

应用基因芯片技术构建弱精症患者精子中miRNA表达谱．收集30份弱精症患者精液标本和20份成年健康有生育能力男性的精液标本,提取精子RNA,标记后,与miRCURY^TM Array芯片杂交．分析弱精症患者精于中miRNA表达情况．高活力精子和低活力精子共196个miRNA存在表达差异,上调miRNA93个,下调miRNA103个．弱精症患者精子miRNA表达谱的建立对分析精子运动的分子机制和探讨弱精症的病因将会有所帮助．     

基于DSP＋FPGA的PCI数据高速传输

针对解决数据高速传输提出了一种基于DSP FPGA的实现PCI高速传输数据的方法,在此设计中,遵循标准的协议和总线原则,使得系统具有通用性和可扩展性。为数据的高速传输提供了理论基础和实践经验。