基于代谢组学的头颈癌生物标志物研究进展

 头颈癌被列为世界上第六大癌症,头颈癌的主要诱因是人类乳头瘤病毒、酒精和烟草。由于缺乏早期检测和风险评估的生物标记物,超过50%的头颈癌患者往往在晚期阶段才能确诊,5年期幸存率低于50%。基于代谢组学技术的高通量分析方法具有发现肿瘤相关标志物的潜能,综述了代谢组学技术在头颈癌生物标志物发现中的应用进展和存在的问题,展望了进一步研究的主要方向。     

代谢足迹技术及在代谢组学中的应用

系统地介绍了一种用于分析生物细胞和组织特异性的新战略——代谢足迹技术以及它在酵母细胞和人体组织中代谢分析的应用．代谢足迹技术是利用直接注射质谱方法,在分析系统中以培养基为介质,监控细胞从生长培养基中消耗营养物以及分泌代谢物至培养基的全部过程．也就是说。这是一种用高通量方法检测由细胞和组织分泌的代谢产物或从环境中吸收代谢物的定性和半定量的通用分析方法．     

汞胁迫对Geobacter sulfurreducens PCA汞甲基化作用的代谢组影响

采用新兴的代谢组学技术, 筛选差异性细胞代谢物, 分析甲基汞生成和调控的关键代谢通路。在典型环境污染 浓度 (0~100 μg/L) Hg(II)的 胁迫下, 汞甲基 化微 生物Geobacter sulfurreducens PCA吸附/吸收的Hg(II)成为参与汞还原和甲基化的主要反应物质。初始 Hg(II)浓度为10 μg/L时, G. sulfurreducens PCA达到最高汞甲基化效率3.09%±0.16%。代谢组学数据显示, Hg(II)胁迫对胞内的碳水化合物代谢、核苷酸代谢和氨基酸代谢造成干扰。为了应对Hg(II)胁迫, G. sulfurreducens PCA增大了对能量的需求, 用来调控汞生物甲基化反应, 并对受损DNA进行修复。     

植物次生代谢研究

次生代谢是植物重要的生命活动,与植物的生长发育及其对环境的适应密切相关。同时次生代谢产物也是重要的药物和化工原料来源。次生代谢过程及代谢物的积累受到自身和环境中各种生物和非生物因素的调控。随着基因组和代谢组等组学技术的产生和发展,植物次生代谢研究获得了前所未有的机会。通过对代谢过程的深入了解,利用系统生物学方法开展预见性代谢工程将会成为未来的研究趋势。