Identification of genes associated with cotyledon senescence in upland cotton

Leaf senescence in plants is an essential develop- mental phase, and an understanding of senescence is important not only for pure scientific reasons, but also for practical purposes. During the last decade, a number of senescence-associated genes (SAGs) …     

分子生物学技术在软组织小圆细胞肿瘤疑难病例中的诊断价值

本文探讨了分子生物学技术在石蜡包埋软组织小圆细胞肿瘤中的应用及诊断价值.对诊断未确定软组织小圆细胞肿瘤3例,在光镜组织形态学初步诊断和免疫组织化学初步鉴别诊断后,经RT-PCR技术检测特异性融合基因的表达并测序证实最后确诊为尤因氏/原始神经外胚层瘤、腺泡状横纹肌肉瘤、粘液脂肪肉瘤.分别检测出EWS-FLI1融合基因表达1例,PAX3-FKHR融合基因表达1例,TLS-CHOP融合基因表达1例.因此,分子生物学技术为临床软组织小圆细胞肿瘤疑难病例的诊断和鉴别诊断提供了一种可靠、方便、快速有效的技术手段.     

DNA损伤修复蛋白在胆囊病变组织中的表达及其临床意义

目的 研究胆囊腺癌、癌旁组织、腺瘤性息肉和慢性胆囊炎组织中DNA损伤修复蛋白hMSH2和hMLH1表达及其临床意义.方法 选取胆囊腺癌108例、癌旁组织46例、腺瘤性息肉15例和慢性胆囊炎35例手术切除标本常规作石蜡包埋切片,采用EnVisionTM免疫组化法检测hMSH2和hMLH1.结果 hMSH2和hMLH1表达阳性率,胆囊腺癌分别为50.0%和49.1%、评分分别为2.2±1.9和2.2±1.8,均明显低于癌旁组织（阳性率分别为84.8%和87.0%;评分分别为3.9±1.3和4.2±1.2）、腺瘤性息肉（阳性率分别为80.0%和86.7%;评分分别为3.7±1.3和4.0±1.1）及慢性胆囊炎组织（阳性率分别为88.6%和88.6%;评分分别为4.1±1.1和3.9±1.1）（P＜0.05）;不同类型良性病变中2种DNA损伤修复蛋白表达阳性率及其评分均无明显差异（P＞0.05）.hMSH2和hMLH1表达阴性的良性病变胆囊上皮均呈中至重度不典型增生的病理形态学表现.腺瘤癌变或高分化腺癌、肿块最大径＜2 cm,无淋巴结转移及未侵犯周围组织的病例hMSH2和hMLH1表达阳性率及其评分均明显地高于低分化腺癌、肿块最大径≥2 cm、淋巴结转移及侵犯周围组织病例（P＜0.05）;2种DNA损伤修复蛋白表达与患者性别、年龄及有无胆囊结石均无明显关系（P＞0.05）.结论 DNA损伤修复蛋白表达水平均为反映胆囊腺癌发生、进展、临床生物学行为及预后的重要标记物,检测其表达水平对指导预防和早期发现、临床化疗胆囊癌可能有一定临床意义.     

lgtF,rfaF和rfaD基因在副猪嗜血杆菌LOS诱导BALB/c小鼠炎性因子表达中作用的研究

为了研究lgtF,rfaF和rfaD基因在副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,HPS)脂寡糖(LOS)刺激BALB/c小鼠炎性因子IL-1α、IL-6、IL-8和TNF-α表达中的作用。提取HPS SC096株、lgtF基因缺失株(ΔlgtF)、rfaF基因缺失株(ΔrfaF)和rfaD基因缺失株(ΔrfaD)的LOS,用80μg HPS-LOS,ΔlgtF-LOS,ΔrfaF-LOS和ΔrfaD-LOS腹腔注射BALB/c小鼠,分别在6 h和12 h后去眼球采血,分离血清,运用商品化的ELISA试剂盒检测炎性因子IL-1α、IL-6、IL-8和TNF-α的表达量变化。结果表明用80μg HPS-LOS刺激BALB/c小鼠6 h和12 h后IL-1α、IL-6、IL-8和TNF-α的表达量均升高,显著高于ΔlgtF-LOS,ΔrfaF-LOS和ΔrfaD-LOS刺激BALB/c小鼠后的IL-1α、IL-6、IL-8和TNF-α的表达量(P0.05)。以上实验结果首次证实了lgtF、rfaF和rfaD基因在HPS LOS刺激BALB/c小鼠炎性因子表达过程中起着重要的作用。     

基于混沌游戏图形表示的细菌必需基因与非必需基因的Hurst指数特征对比分析

必需基因是维持生物体生命活动必不可少的基因,基因特征的选取对于必需基因的理论预测识别方法至关重要.作者采用分形理论对DEG必需基因数据库中的所有细菌物种进行了基于Hurst指数的必需基因与非必需基因特征对比分析,旨在提取必需基因区别于非必需基因的显著特征.结果表明,绝大部分必需基因与非必需基因序列具有长程相关性,所分析细菌物种的必需基因和非必需基因的Hurst指数均较好地遵从Gamma分布规律,且两类基因的Hurst指数具有显著性差异.     

不同温度下环渤海典型湿地沉积物中二苯并噻吩降解率与功能基因响应关系研究

为了揭示不同温度下环渤海典型湿地沉积物中二苯并噻吩(DBTs)的降解途径, 选择辽河口芦苇湿地、天津北大港滩涂湿地和黄河河口湿地的3种不同湿地沉积物, 在模拟季节性温度条件下, 培养56天, 测定DBT的降解率, 分析DBT降解功能基因的丰度, 建立DBT降解率与功能基因群组定量响应关系模型, 解析不同温度下3种湿地沉积物中DBT的降解途径。实验结果表明, 3种湿地沉积物中DBT的降解率均随培养温度升高而升高, 4ºC培养时, DBT的降解率排序为黄河河口湿地>天津北大港滩涂湿地>辽河口芦苇湿地; 30ºC培养时, DBT的降解率排序为北大港滩涂湿地>黄河河口湿地>辽河口芦苇湿地; catA与dszB基因影响DBT的降解速率。低温条件和中温条件下, 在3种湿地中, 代表Kodama途径的nagAc/nahAc和nidA基因分别起主要作用, 代表4S途径的dszB基因在黄河河口湿地及北大港滩涂湿地中有重要作用。     

中国古典园林的文化基因

中国古典园林的营造,凝聚着深邃的文化基因,其源起、发展、成熟无不与中国文化密切联系,从传统山水文化、哲学思想、文学经典到人文精神都可在中国古典园林中找到它们的烙印,这为中国古典园林赏析提供了独特的角度,同时对现代园林景观设计具有重要的启示作用.     

基于灰值区间的微阵列模拟数据生成算法

针对微阵列芯片数据采集量大、 获取成本高的问题, 提出一种新的基于灰值区间的微阵列模拟数据生成算法. 该算法通过灰值度量的方式模拟微阵列数据中基因的差异表达属性, 结合聚类分析方法创建聚类隧道, 进而产生与原始数据具有相似数理分布及生物学意义的模拟数据. 采用模拟数据和真实生物数据对算法进行实验验 证与分析, 实验结果表明, 基于灰值区间理念与聚类隧道产生机制生成的模拟数据是有效且可靠的.     

Identification and characterization of a salt tolerance-responsive gene( AtGRP9) of Arabidopsis

Soil salinity is one of the important limiting factors for plant growth and development. A cDNA clone encoding a glycine-rich protein (designated AtGRP9) was identified from Arabidopsis by functional expression of the plant cDNA library in the fission yeast S. pombe. Yeast cells overexpressing AtGRP9 displayed significantly enhanced salt tolerance. Northern analysis showed that expression of AtGRP9 in Arabidopsis was induced by NaCl and plant hormone abscisic acid (ABA). These results suggest that AtGRP9 may be involved in the salt stress response in Arabidopsis.     

Identification of differentially expressed genes in photo-period sensitive genie male sterile rice by randomly amplified cDNAs using RAPD primers

The fertile and sterile young panicle representational populations were constructed by bulked sampling method using young panicles in the photo-period sensitive stage of fertility transformation. Two populations were analyzed using cDNA-RAPD. The results showed that: ( i ) bulked sampling method can be employed to analyze differentially expressed genes using cDNA-RAPD, taking an advantage in avoiding false positive caused by conventional sampling method. ( ii ) Among 150 random primers used, 83 primers amplified the same banding patterns, and 34 primers amplified the same banding pattern but different staining of intensity on gel. ( iii ) 33 primers amplified differential cDNA bands between fertile and sterile cDNA populations, and the ratio of polymorphism was 22%. It is concluded that there may exist a lot of genes relating to sterility, which makes the differentially expressed cDNA fragments complicated.