基于高通量测序的不同养殖系统下凡纳滨对虾肠道和水体中微生物的多样性

【目的】研究不同养殖系统对凡纳滨对虾肠道及水体微生物多样性的影响。【方法】以循环养殖系统和非养殖系统下凡纳滨对虾养殖水体及其肠道为研究对象,在养殖30d后采集样品,采用Illumina MiSeq高通量测序样品细菌16SrRNA基因V3+V4区,通过RDP11.3、Greengenes13.8、NCBI 16S Microbial和Customized batabase等数据库进行分析,阐述循环养殖系统的意义和微生物在其中的作用。【结果】养殖期间,不同养殖系统凡纳滨对虾均正常存活。将原始序列优化后对Clean序列进行分析,非循环系统下水体优质序列百分比约81%,肠道中约89%;循环系统下水体优质序列百分比为92%,肠道中为94%。两种养殖系统下水体和肠道细菌在纲水平占绝对优势的是变形菌纲,但各菌群丰度不同;不同的Alpha指数显示出物种间的差异性;通过系统发育树可以看出,不同养殖系统改变了凡纳滨对虾生境中的物种及发育关系,间接阐述微生物在养殖生境中的作用和意义。【结论】通过高通量测序揭示不同养殖系统中微生物菌群的差异以及多样性,对于凡纳滨对虾实际养殖具有指导作用,对阐述养殖过程中微生物和相关疾病的关系具有重要意义。     

密云水库浮游动物多样性格局

对密云水库6个代表性生境的浮游动物做了每月一次的采样调查.记录到浮游动物106种(新记录39种),其中清洁水和贫营养指示种增多.春季的螺形龟甲轮虫、夏季的长额象鼻溞优势明显,秋、冬季无明显优势种.物种数、个体密度和物种多样性均表现为夏季高而冬春季低的规律.单月物种数最高58种(8月),最低16种(5月).个体密度变动于21.93～149.53 ind/L,年均74.88 ind/L±39.97(S.D.).物种多样性(H)变动于0.97～2.91,年均2.06±0.74;均匀度(J)变动于0.30～0.74之间,年均0.60±0.16.各月份物种数、个体密度和物种多样性都以浅水区最高、河口区次之、深水区最低,但位点间差异不显著.多元线性回归结果显示密云水库浮游动物物种多样性特征受水温和溶解氧影响显著(F=72.94,P=0.001),与其它水环境参数相关不大.浮游动物群落结构的稳定性和演替趋势表明水库水质状况良好,富营养化因子未对水库生态系统产生健康威胁.     

江苏徐州地区7种生境蚂蚁群落结构研究

通过诱捕法和样方调查法获得徐州地区蚂蚁4亚科9属13种.优势种铺道蚁(Tetramorium caespitum)、针毛收获蚁(Messor aciculatus)、中华小家蚁(Monomorium chinense)和日本弓背蚁(Camponotus japonicus).从生境分布来看,前2种亦是研究区域的广布种.根据调查数据分析了该地区7种生境中蚂蚁群落的结构及多样性特征,以及人为干扰和生境异质性对蚂蚁群落的影响.结果表明:7种生境中蚂蚁群落种类组成和多样性等指标均不相同.山地松柏杂木林中蚂蚁群落种类数、Shannon-Wiener多样性指数(H′)和Pielou均匀度指数(J)最高;蔬菜果园田中H′最低.人类干扰越强的生境,H′越低;生境质量和异质性越高,H′越高.相关分析与群落结构PCA分析结果基本一致,旱作农田、水稻湿作田、蔬菜果园田、人居环境等4种生境的相似性最高,其它几个生境蚂蚁群落间相似性很低.     

金定鸭遗传多样性及分子标记的研究

用40个随机引物对我国常见家鸭品种(系)、引进品种和野鸭基因组DNA进行RAPD分析,寻找金定鸭品种特征RAPD标记.通过多次重复实验,初步认为Y05 600可作为鉴别育成品种金定鸭的RAPD分子标记.再选用20个引物对金定鸭3个育成品系各12个个体进行RAPD扩增,分析金定鸭的种质特征.结果显示:金定鸭I、II、III系的平均遗传相似系数分别为0.9157±0.0296、0.8552±0.0459、0.8816±0.0449;3个品系的变异系数分别为3.23%、5.37%、5.09%.育成品种金定鸭不同品系遗传一致性较高,但品系内的个体间仍存在着丰富的遗传多样性,不同品系之间存在着极显著的差异(p<0.01).     

林窗植被研究进展

综述了自1945年Joner的开创性工作以来林窗植被的研究进展.扼要介绍了有关林窗环境、林窗形成、物种格局和边缘效应等问题.讨论了林窗促进森林群落正常更新,以及维持物种多样性的机制,并就林窗植被的动态特征及建立林窗模型作了简要阐述.     

青岛海域固氮细菌的系统发育多样性研究

采用严格人工无氮海水培养基富集、分离培养方法及用3对固氮基因(nifH)引物进行PCR检测,从青岛近海沉积物和海水中分离到16株异养型可培养海洋固氮细菌,经16S rDNA全序列测定分析了它们的系统发育多样性。结果显示,16株菌分布于Alphaproteobacteria、Gammaproteobacteria、Flavobacteria的3个纲中,分别代表着6个属、10个种,其中有50%归于Pseudoalteromonas属;海底沉积物中固氮菌的多样性要远高于海水,并在其中发现2个潜在新种。研究表明,青岛近海海域的固氮菌具有一定程度的多样性,它们大部分在系统发育关系上与分离自韩国、南极洲、新喀里多尼岛等海水的标准菌高度同源,但也存在少量潜在新物种。结果可为其他不同海域异养固氮菌的多样性及其生态功能研究提供有益参考。     

飞蝗五个自然种群的遗传分化研究

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术检测飞蝗Locusta migratoria（Linnaeus）2个亚种5个种群的遗传多样性，11个随机引物扩增共产生了163条带，其中多态性片段为156条．Shannon信息指数和Nei’S指数对RAPD数据的分析表明：东亚飞蝗Locusta migratoria manilensis（Meyen）不同种群存在较高的遗传多样性；同时，东亚飞蝗种群间出现一定程度的遗传分化，遗传分化系数分别为36．09％和33．85％．用UPGMA对Nei’S遗传距离作聚类分析，结果表明：东亚飞蝗不同种群的亲缘关系较近，而它们与亚洲飞蝗Locusta migratoria migratoria（Linnaeus）关系较远．由Nei’S遗传一致度和遗传距离可以看出，东亚飞蝗不同种群间的遗传距离均小于东亚飞蝗与亚洲飞蝗之间的遗传距离．由Mantel软件检验得出地理距离和遗传距离的相关性系数r〈0．7，表明这5个种群亲缘关系的远近与地理距离无相关性．同时，还结合等位酶种群遗传结构研究结果综合分析了上述东亚飞蝗4种群的遗传多样性及其分化，表明RAPD可检测出更高水平的遗传多样性．     

土壤微生物群落及其活性与植被的关系

植被通过影响土壤环境,从而影响到土壤微生物群落的结构和多样性．受植被影响的土壤环境中土壤微生物群落的多样性比不受植被影响或者没有植被的土壤环境中的微生物群落的多样性要高很多,不受植被影响的表面以下土壤环境中的微生物群落具有显著的优势ＯＴＵ种群,而表层土壤环境中没有显著的优势ＯＴＵ种群．植被对微生物的影响同时也表现在对生命物质ＤＮＡ的影响,即有植被的土壤环境中的微生物ＤＮＡ具有更高的活性,其基因在克隆过程中更容易被转移,获得更多的克隆细胞和种群．     

多载波DS-CDMA中的交织器设计

多载波直接扩频序列码分多址 (DS- CDMA)是一种结合正交频分复用 (OFDM)的调制方式和 DS- CDMA的多址方式而产生的宽带 CDMA传输方式。该文结合下行多载波 DS- CDMA的特点 ,提出了最优交织器的设计准则 ,推导出了它的最优解和相应的最优性能。给出了一种只需排序操作就可以实现次最优交织器的设计方法。理论分析和仿真结果表明 ,当频域分集数 P小于信道阶数 L 时 ,优化后的交织器能有效地提高系统的分集增益 ,并使系统的性能逼近P=L 时的最优性能。当 P≥ L 时 ,等间距交织器就是最优交织器。     

凡口铅锌矿香蒲湿地夏季鸟类群落结构研究

研究了广东省韶关市凡口铅锌矿香蒲湿地系统夏季鸟类群落结构． 结果表明, 随着湿地植物群落的演替, 水生动物群落的物种明显增多, 以致鸟类的种类和数量也明显增多．根据实地观察, 发现人工湿地区域有鸟类２６ 种, 隶属７ 目、１３ 科． 另外, 还比较了香蒲湿地与外围其它自然生境的鸟类物种多样性． 结果表明, 香蒲湿地的鸟类物种多度、物种多样性和鸟类总数都高于外围生境