利用病毒诱导的基因沉默技术研究一个豌豆PI同源基因的功能

在植物发育生物学研究中, 对很多非模式植物基因功能的研究总是因为缺乏快速有效的方法而受到限制. 病毒诱导的基因沉默(virus induced gene silencing, VIGS)技术是近年来发展起来的一种反向遗传学快速研究基因功能的方法. 本研究利用一种基于PEBV (pea early browning virus)的VIGS体系研究了豌豆PsPI基因的功能. 豌豆在其PsPI基因沉默后出现了类似于拟南芥pi突变体/金鱼草glo突变体的表型, 导致花瓣向萼片以及雄蕊向心皮转变. 半定量RT-PCR分析发现, 在VIGS-PsPI沉默植株花苞中, PsPI基因的mRNA水平显著下降. mRNA原位杂交结果显示, PsPI基因早期在起始共同原基的部位表达, 后期在花器官第二、三轮表达. 本研究结果证明了PsPI基因具有拟南芥PI/金鱼草GLO同源基因的功能, 说明这类基因在进化和功能上是相当保守的, 同时也表明VIGS是一种研究植物基因功能的快速有效的方法, 特别是对于那些转化困难的非模式植物基因功能的研究具有更为重要的意义.     

RNA二级结构预测的模糊模型

基于模糊集合理论，提出了RNA二级结构预测的模糊模型．该模型通过状态空间的模糊分割以及模糊目标的引入等，可有效利用模糊动态规划算法给出该模糊模型的最优决策序列，并进而获得待预测RNA最优与次优的二级结构．基于模糊模型的方法具有许多优点，如计算复杂性的降低，最优与多个次优二级结构的一并获得，以及定性先验知识的有效融入等．完整地给出了RNA二级结构的模糊模型及其计算方法，并进行了具体的实现．将一个具体的BJK模糊模型结构实际应用于tRNA及tmRNA的数据集中，并与基于最小自由能的mfold工具以及基于SCFG的BJK文法模型进行了比较研究．实验结果表明该模型的有效性，相应的预测精度得到了进一步的提高．     

一个快速进化的microRNA家族

microRNAs(miRNAs)是长约22nt的非编码RNA,它可通过降解mRNA或抑制其翻译来调控基因。本文简要介绍了miRNAs的研究背景,阐述了通过比较近缘物种中非保守的miRNA基因来研究miRNAs分子进化的理由。我们的研究结果证实miRNA基因会受到达尔文正选择的影响,发生快速的进化。这一结果将为我们了解非蛋白编码基因的功能与进化提供崭新的视角。     

香蕉不同组织中总RNA提取方法的研究

针对香蕉组织中多糖、多酚等次生物质含量高的特点，以香蕉根、茎、叶、果实为试材，对其总RNA提取进行研究．比较了SDS法、改良SDS法、改良CTAB法和Trizol试剂盒法提取总RNA的效果，结果分析表明：改良SDS法能从香蕉根、茎、叶中获得质量高、完整性较好的总RNA，而改良CTAB法对果实的提取效果较佳，所得A260／A280均高于1．8，A260／A230大于2，0，28 S rRNA带的亮度约是18 S rRNA的2倍．其产率在根、茎、叶中均在400μg·g^-1以上，果实中可达49．34μg·g-^1.以上2种方法所得的总RNA均能满足RTPCR、Northern blot和cDNA文库建立等分子生物学研究，且具有快速、简便易行、成本较低的特点，适合于富含多糖、多酚的植物材料．     

小干涉RNA介导的RNA干涉机制及其应用的研究进展

RNAi系统是由SiRNA、沉默复合物、核酸酶、Argonaute蛋白家族的蛋白质组成,它具有高效性、特异性、持久性和遗传性等特征。RANi原理一般分为两个阶段:起始阶段和效应阶段,在siRNA存在的情况下,把目的mRNA降解成多个小片段RNA。RNAi在实际中可应用于基因功能的研究、基因治疗的研究、移植免疫耐受性的研究等,前景广阔。     

微小RNA在胃癌中的研究

胃癌是世界最常见的恶性肿瘤之一，寻找理想的胃癌早期诊断的标记物和有效治疗靶点，对改善胃癌患者的预后有着重要的意义。     

mRNA二级结构对重组人白血病抑制因子（rhLIF）在大肠杆菌中表达 …

真细菌中翻译起始效率通常是由翻译起始位点两侧的ｍＲＮＡ区域二级结构的稳定性决定的。这种稳定性与该区域ＲＮＡ二级结构的发生自由能相对应。重组人白细胞病抑制因子为具有诱导白血病细胞分化，调节骨组织的生长代谢，维持胚胎干细胞的基本特征，促进神经元的分化等广泛生物学活性的细胞因子。     

MiR-205 inhibits the invasion and migration of esophageal squamous cell carcinoma by modulating SMAD1 expression

Esophageal squamous cell carcinoma （ESCC） is one of the most lethal cancers worldwide. In this study, we aimed to investigate the underlying mechanisms of metastasis inhibition by miR-205 in ESCC. In microRNA （miRNA） array and quantitative RT-PCR analyses, we found that the expression level of miR-205 was significantly lower in patients with lymph node metastasis compared with that in patients without lymph node metastasis. After transfection of miR-205 mimics or inhibitors into ESCC cell lines, a significant negative correlation was observed between the expression level of miR-205 and Smad 1. In luciferase reporter assays, we revealed that miR- 205 inhibited the expression of SMAD1 by targeting the 3＇ untranslated region （3＇-UTR） of SMAD1 mRNA in ESCC cells. Furthermore, our results showed that miR-205 sup- pressed the invasion and migration of ESCC cells, whereas Smadl increased their invasion and migration. Taken together, our study demonstrates that miR-205 functions as a suppressor of tumor metastasis by regulating SMAD1 expression through targeting the 3＇-UTR of SMAD1 mRNAin ESCC. Therefore, miR-205 may be a potential therapeutic target for miRNA-based therapy of ESCC.     

Z7 snoRNA：酿酒酵母中一种新的核仁小分子RNA

通过计算机分析国际分子生物学数据库和分子杂交等方法，在酿酒酵母中发现了一种新的核仁小分子ＲＮＡ：Ｚ７ ｓｎｏＲＮＡ。该ｓｎｏＲＮＡ具有ｂｏｘ Ｃ和ｂｏｘ Ｄ等结构元素，并有１４个核苷酸与１８Ｓ ｒＲＮＡ中的一段保守序列互补，属于典型的以核酸序列指导大分子ｒＲＮＡ甲基化的ｓｎｏＲＮＡ类型。Ｚ７ ｓｎｏＲＮＡ指导酿酒酵母１Ｓ ｒＲＮＡ中第５７８位的尿嘧啶核苷酸的核糖甲基化。Ｚ７ ｓｎｏＲＮＡ长８８个核