假单胞菌ND6菌株水杨酸羟化酶基因(nahG)的核苷酸序列分析和酶鉴定

水杨酸羟化酶是细菌萘降解途径中的关键酶，它能催化水杨酸脱羟和羟化，生成儿茶酚．假单胞菌(Pseudomonas)DN6菌株的萘降解基因位于102kb的质粒pND6-1上，以pUC18质粒为载体，制备了含有1～3kb pND6-1 DNA随机片段的基因库，通过DNA测序和DNA序列同源性分析，从基因库中筛选出含有水杨酸羟化酶基因nahG的克隆．nahG基因的大小为1305bp，编码的水杨酸羟化酶(NahG)由434个氨基酸组成，与Pseudomonas putida NCIB 9816-4菌株的水杨酸羟化酶基因相比，核苷酸序列的同源性为100％，与其它10种细菌的水杨酸羟化酶基因相比，核苷酸序列的同源性为32％～99％．酶学实验表明，ND6菌株的水杨酸羟化酶具有广泛的底物特异性，它不仅能代谢水杨酸，还能代谢多种水杨酸的衍生物，如乙酰水杨酸、黄基水杨酸、3-甲基水杨酸、5-甲基水杨酸和5-氯水杨酸等．     

微生物转化过程中利用OD值实时监测细菌生物量变化的研究

通过对不同稀释度菌液OD值的测定，结合平板计数结果，建立了一种假单胞菌于重(y)-0D值(x)之间的回归方程：y=301．77x-0．2546(R^2=0．9875)和活菌数(y)-OD值(x)之间的回归方程：y=2．0037x 0．0212(R^2=0．9929)．证明用OD值进行细菌生物量的实时检测具有简便、迅速、准确等优点．     

The secretion of lecithinase of Pseudomonas alcaligenes S2 was via type II secretion pathway

Phosphorus is one of the major essential macronutrients for virtually metabolic processes in plant growth and de-velopment[1]. This creates a paradox with major agro-nomic implications since the phosphate form of phospho-rus is one of the least soluble mineral nutrient ions in the soil. The concentration of soluble phosphorus in soil is usually very low, normally at levels of 1 ppm or less (10 mol/L H2PO4?). Mineral forms of phosphorus are repre-sented in soil by primary minerals, such as ap…     

低温低碳氮比好氧反硝化菌的筛选及鉴定

 传统的反硝化工艺存在反硝化细菌的世代时间较长（特别是在低温的冬季）、水力停留时间长、运行和投资费用大等问题。为寻找更好的反硝化细菌,从冬季北方城市污水厂驯化活性污泥中分离出1 株耐低温、低碳氮比,且脱氮率较高的好氧反硝化菌株,命名为HFX08。初步鉴定该菌株为假单胞菌属（Pseudomonas）,G^-菌。该菌株的最适生长温度为10~20℃,生长曲线符合S 型曲线,拟合方程相关性系数达到了差异极显著水平。随着碳氮比的增加,该菌株的反硝化速率随之提高,脱氮率最高可达92%。     

微生物气溶胶与有害气体联合吸入动态暴露动物模型建立及评价

目的 研究建立甲醛((Formaldehyde, FA))与铜绿假单胞菌ATCC15692(Pseudomonas aeruginosa, PAO1)气溶胶联合吸入暴露的大鼠呼吸系统损伤模型。方法 8周龄雄性Wistar大鼠31只(中科院实验动物中心),体质量(180±10) g,随机分为正常对照组(7只)、(3.4±0.3) mg/m3 FA吸入暴露组(8只)、(0.5～1)×107 cfu/m3 PAO1气溶胶吸入暴露组(8只)、FA联合PAO1气溶胶吸入暴露组(8只)。用HOPE-MED 8050型动态气溶胶暴露舱建立大鼠染毒暴露模型,HE染色法检测肺组织结构损伤,ELISA方法测血清IgM、白介素-1β(interleukin-1 beta, IL-1β)、白介素-8(interleukin-8, IL-8)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor,TNF-α)、clara细胞分泌蛋白(clara cell secret protein, CC10)因子分泌水平。发光比色法检测血清SOD活性。结果 组织形态学观察显示,3实验组大鼠肺泡间隔增宽、肺间质水肿、肺组织内炎性细胞侵润,肺组织细胞凋亡数明显增加,以FA与PAO1联合暴露组病理学改变最明显。血清学结果显示,3实验组IgM、 TNF-α、IL-1β、IL-8水平、SOD活性升高,以联合暴露吸入组升高更显著(P0.05)。结论 甲醛与PAO1联合暴露后明显促进大鼠肺组织叠加损伤效应。     

SPF级实验小鼠4种致病菌多重PCR方法的建立及优化

目的 建立一种可同时检测4种SPF级屏障环境常见致病菌的多重PCR方法。方法 本研究针对鼠伤寒沙门氏菌invA基因、肺炎克雷伯杆菌khe基因、嗜肺巴斯德菌16SrRNA基因、铜绿假单胞菌ecfX基因序列分别设计合成特异性引物,构建可同时鉴别4种菌的多重PCR反应体系,优化后测定其特异性、灵敏性并人工模拟感染样本。结果 建立的4重PCR方法能对同一样品中的4种致病菌模板进行特异性扩增,无交叉反应;对4种目的菌的检测灵敏度为10-3ng/μL;也可从混合感染的病料中特异性地检测出4种致病菌。结论 本试验建立的多重PCR方法具有快速、简便、灵敏的特点,为4种致病菌的快速诊断和监控提供了有效的技术支持。     

苯酚降解菌的筛选及降解性能研究

从腐烂的树木枯枝和污染的淤泥中分离出苯酚的高效降解菌.通过对它们的形态和16S rDNA 分析,筛选到的新菌株分别命名为 Acinetobacter sp. SD1, Pseudomonas sp. SD2和 Rhodococcus sp. SD3.在筛选到的3株菌中, Rhodococcus sp. SD3的苯酚降解性能最好,该菌株在72 h 内几乎能将浓度为1.0 g/L 的苯酚完全降解     

莠去津高效降解菌的筛选及鉴定

为克服传统降解菌筛选的局限性,采用全新的筛选方法从长期施用莠去津的土壤中分离筛选出1株高效莠去津降解菌,该菌株可利用莠去津作为氮源生长,降解率可达98.46%.对其最佳生长条件及影响因素的实验研究显示最佳条件为:温度30℃、pH7.0.经生理生化鉴定和16s序列比对分析,鉴定其为丁香假单胞菌.外加氮源可促进菌体的生长但不会完全抑制农药的降解.因此,该研究为降解菌的筛选方式提供了全新的思路并为污染环境修复奠定了坚实的基础.     

Innovation for ascertaining genomic islands in PAO1 and PA14 of Pseudomonas aeruginosa

Based on three distinct traits of genomic islands, a novel approach was developed to search for and determine genomic islands in special strains. Two genomic islands in Pseudomonas aeruginosa PAO1 and 7 genomic islands in Pseudomonas aeruginosa PA14 were defined with this method. Among the 9 genomic islands, 4 islands had been characterized before, while the other 5 islands were initially determined. The insert sites of 6 genomic islands are tRNA sequences, direct repeats of PA14GI-3 are relative to tRNA^Leu, and direct repeats of PA14GI-2 are at the 3＇ end of bifunctional GMP synthase/ glutamine amidotransferase. Only direct repeats of PA14GI-4 are not clear. Among the 5 newly-found genomic islands, it was supposed that PA14GI-2 is a genomic island related to Hg^2＋ uptake, PA14GI-3 is a secretory activity genomic island, PA14GI-6 is a pathogenicity island, and functions of PA14GI-1 and PA14GI-5 are not clear. Finally, the tyrosine type integrases in PAOIGI-1, PA14GI-5 and PA14GI-7 were analyzed, and their binding and restriction sites were predicted.     

响应面优化假单胞杆菌降解咖啡因培养基

利用已筛选出的菌株Pseudomonas putida ECUST5-2降解咖啡因,并对其培养基组分进行优化。首先采用单因子试验从多个因素中寻找出可参考的因素。在此基础之上,利用Plackett-Burman试验筛选出显著影响咖啡因降解率的主要因素为:咖啡因、Na2HPO4、MgSO4和酵母粉。随后用最陡爬坡试验逼近降解菌最大降解率区域。然后利用中心组合设计试验对相关显著因素进行优化,得到咖啡因、Na2HPO4、MgSO4和酵母粉的最佳浓度分别为:3.409 1 g·L-1,0.056 4 g·L-1,0.1611g·L-1和3.570 7 g·L-1。在优化后培养基条件下,咖啡因的降解率(0.105 g·h-1)比其初始咖啡因降解率提高了3.28倍。