天然海鱼共附生细菌抗TMV增殖的活性筛选

从福建平潭潮间带周边海域采集7种海鱼,选择了6种分离培养基,获得海洋共附生细菌191株,通过叶碟法进行抑制烟草花叶病毒（Tobacco mosaic virus,TMV）增殖的菌株活性筛选,其中36株海洋细菌抑制率大于60%,其浓度为1 mg/mL的粗提物抗TMV增殖的活性都能达到38%以上,抑制率超过60%有8株。     

Fatty-acids and their <Emphasis Type="Italic">δ</Emphasis><Superscript>13</Superscript>C characteristics of seep carbonates from the northern continental slope of Gulf of Mexico

Here we reported the fatty-acids and their δ¹³C values in seep carbonates collected from Green Canyon lease block 185 (GC 185; Sample GC-F) at upper continental slope (water depth: ~540 m), and Alaminos Canyon lease block 645 (GC 645; Sample AC-E) at lower continental slope (water depth: ~2200 m) of the Gulf of Mexico. More than thirty kinds of fatty acids were detected in both samples. These fatty acids are maximized at C₁₆. There is a clear even-over-odd carbon number predominance in carbon number range. The fatty acids are mainly composed of n-fatty acids, iso-/anteiso-fatty acids and terminally branched odd-numbered fatty acids (iso/anteiso). The low δ¹³C values (−39.99‰ to −32.36‰) of n-C₁₂:0, n-C₁₃:0, i-C₁₄:0 and n-C₁₄:0 suggest that they may relate to the chemosynthetic communities at seep sites. The unsaturated fatty acids n-C_18:2 and C_18:1△⁹ have the same δ¹³C values, they may originate from the Beggiatoa/Thioploca. Unlike other fatty acids, the terminally branched fatty acids (iso/anteiso) show lower δ¹³C values (as low as −63.95‰) suggesting a possible relationship to sulfate reducing bacteria, which is common during anaerobic oxidation of methane at seep sites.     

细菌中小RNA靶标识别的研究进展

细菌的小RNA（small RNA,sRNA）是一类长度在50~500nt之间的RNA分子,目前已在细菌内发现150多种sRNA.随着越来越多的sRNA被证实,识别sRNA的靶标进而研究sRNA的功能已具有越来越重要的意义.目前,对sRNA靶标的研究主要采用生物信息学预测结合分子生物学实验的方法.本文就细菌中sRNA靶标识别方法的研究进展做一简要综述.     

亚硝基胍与紫外诱变选育高效解钾菌株

为构建遗传背景差异较大、解钾性能稳定提高的候选菌库,选用课题组分离的蜡样芽孢杆菌L18（Bacillus cereus,KF494191) 为出发菌株,对其分别进行亚硝基胍（NTG）和紫外（UV）诱变处理,经四苯硼钠-季铵盐显色初筛,摇瓶发酵复筛,获得42株解钾能力显著增强的突变株,其中：诱变株L18-NTG-151和L18-UV-68发酵液钾质量浓度分别为126.74,121.69 mg/L,与出发菌株相比分别提高了63.64%和57.12%.结果表明亚硝基胍和紫外线诱变处理能显著提高蜡样芽胞杆菌的解钾能力.     

生物表面活性剂产生菌的筛选及鉴定

从大庆油田采集的原油样品中筛选出一株产表面活性剂的菌株HD-322-2,根据形态特征、生理生化性质和16S rDNA序列分析对菌株进行鉴定,并运用红外光谱法和排油圈法对产物进行分析。菌株HD-322-2的16S rDNA序列与枯草芽孢杆菌的相似性达到98%,生理生化性质分析的结果亦与枯草芽孢杆菌相同,认定该菌株属于枯草芽孢杆菌。红外光谱分析结果表明:菌株HD-322-2产生的生物表面活性剂的主要成分为脂肽。该菌株具有较强的排油和降黏能力。     

荧光原位杂交法检测环境硝化细菌实验条件优化及应用

通过正交试验筛检荧光原位杂交(FISH)技术在检测环境中硝化细菌时的最佳及适合的实验条件.结果显示,样品预处理较优的条件为:热固定2h,乙醇脱水3min;FISH技术检测环境样本中亚硝化细菌的最佳实验条件为:杂交温度46℃,杂交时间3h,洗脱液中NaCl浓度20mmol/L;检测硝酸菌最佳实验条件为:杂交温度46℃,杂交时间5 h,洗脱液中NaCl浓度60 mmol/L.应用该方案对太湖、玄武湖、南京锁金村污水处理厂活性污泥中硝化细菌分布进行分析,结果显示,环境样本中亚硝化细菌和硝酸菌含量分别是:太湖1.68×103, 0.54×103cells/mL;玄武湖1.34×103, 0.38×103cells/mL;锁金村污水处理厂活性污泥8.30×106, 0.52×106cells/g.FISH技术检测环境样品中硝化细菌与传统检测方法相比具有快速、简便、准确的优点,在研究环境微生物方面有较好的应用前景.     

北海市南部近岸局部海域细菌变化研究

选取北海市南部的北背岭村和大墩海村附近海域共2个站点,于2004年6~8月用平板计数法对水体的异养菌和弧菌进行计数,并用SPSS软件进行相关性分析,根据海域异养菌总数评价等级标准评价海域的污染状态。结果表明,北背岭站点的异养菌数量变化为1.15×103~1.33×104cfu/m l,平均为4.85×103cfu/m l,6月中旬至7月份异养菌数量变化幅度大;弧菌数在103cfu/m l以内,平均为1.48×103cfu/m l,7月中下旬变化明显,异养菌与弧菌的相关系数为0.62。大墩海站点的异养菌变化范围为7.35×102~1.23×104cfu/m l,平均为3.54×103cfu/m l,6、7月份变化比较平缓,8月份变化幅度大;弧菌数主要在1.00×102~2.50×103cfu/m l之间的较低值变化,平均为8.22×102cfu/m l,变化趋势与异养菌相似,异养菌、弧菌的相关系数为0.84。北背岭站点海域处于中污染状态,大墩海站点海域处于轻污染至中污染状态。     

堆肥未培养细菌的宏基因组文库构建及新的木聚糖酶基因的克隆和鉴定

从自制堆肥样品中提取未培养细菌的总DNA,用柯斯质粒pW EB∷TNC为载体构建宏基因组文库,对文库进行筛选获得表达木聚糖酶活性的克隆,再进行亚克隆、测序分析以及B lastx搜索G enB ank分析木聚糖酶基因。结果构建得到一个包含约5万个克隆的宏基因组文库,文库中外源DNA总容量约为1.8×106kb,获得2个表达木聚糖酶活性的克隆:pGXN 1050和pGXN 1051,鉴定分析表明:pGXN 1050上潜在的木聚糖酶基因um xyn 11A具1个771bp的ORF(Open R ead ing F ram e),可编码含257个氨基酸的蛋白质,所编码产物与混合纤维弧菌(C ellv ibr io m ix tus)的内切-1,4-β-木聚糖酶(G enB ank索引号Z48925.1)的氨基酸序列有46%的一致性和57%的相似性;pGXN 1051上潜在的木聚糖酶基因um xyn 11B具一个723bp的ORF,可编码含241个氨基酸的蛋白质,编码产物与混合纤维弧菌的内切-1,4-β-木聚糖酶(G enB ank索引号Z48925.1)的氨基酸序列有73%的一致性和80%的相似性。木聚糖酶Um xyn11A和Um xyn11B都属于糖基水解酶家族11的成员。     

甲醛对活性污泥法处理氨氮废水的影响

根据兰州某石化污水处理装置生产的实际案例验证了低浓度甲醛在活性污泥法处理废水时对氨氮的影响.工艺运行数据表明,在甲醛浓度超过5mg/L、持续时间超过8h时,虽然对废水中COD的处理未见影响,但是对氨氮去除率影响显著.     

三苯甲烷类染料脱色细菌降解途径及其机制研究进展

三苯甲烷类染料被广泛应用于纺织、医药、食品等行业,但染料废水中含有大量环境难以降解的有害物质,这些物质会随着染料废水不断地排放而在环境中积累,最终危及到人类的生存.目前对于染料的处理主要采用成本高、且会产生二次污染的物理、化学方法.生物降解染料因具有环境友好的特点而越来越受到重视.作者主要从细菌降解三苯甲烷类染料的角度,对目前已报道的主要脱色菌种,以及涉及到的相关代谢产物、降解途径,相关脱色机理等方面进行综述,并对其未来发展前景进行展望.