胶州湾浮游植物分子遗传多样性初步研究

用聚合酶链式反应扩增海洋浮游植物总体的核酮糖1，5-二磷酸羧化／氧化酶大亚基基因(rbcL)片段，建立该基因变异类型文库，并随机测定了38个rbcL大亚基基因片段序列，初步分析了海洋浮游植物分子遗传多样性。将≥97％的氨基酸序列相似性定义为种内变异，38个片段分别代表13个不同的物种，或称为不同的操作分类单元。与数据库序列比较发现，PPJZ01，PPJZll和PPJZ20可能是已报道的rbcL基因序列代表的物种，其它克隆在数据库中没有对应的近缘物种序列存在。系统学分析表明分离的克隆分别属于隐藻门、硅藻门、绿藻门和streptophyta等的浮游植物，极少数克隆来源于异鞭毛藻类、定鞭藻纲和原细菌。根据各操作分类单元克隆数计算得胶州湾浮游植物分子遗传多样性指数为1．97。研究结果为利用分子生物学方法剖分海洋浮游植物群落结构、研究海洋浮游植物动力学积累了基础数据。     

PEG脂质体增强藻蓝蛋白亚基对乳腺癌细胞光毒性的研究

藻蓝蛋白亚基(PCS)是一种低毒并具良好荧光活性的光敏剂.为了增加PCS对乳腺癌细胞的PDT疗效,制备了聚乙二醇修饰的藻蓝蛋白亚基脂质体(PEG-PCS-lip).该脂质体的平均粒径为(136.3±7.6)nm,包封率达到52.1%.在浓度为100mg/L时,PEG-PCS-lip组在MCF-7细胞中的转染率在5h达到(29.1±1.2)%,是PCS-lip组的1.5倍,PCS组的3.1倍.PEG-PCS-lip光动力作用半致死剂量对MCF-7及MA-782细胞分别为(65.4±2.47)mg/L及(70.5±2.95)mg/L.用100mg/L的PEG-PCS-lip进行PDT处理后凋亡率达到了28.5%.与PCS相比,PEG-PCS-lip在血液和肿瘤中比在其他组织中聚集的浓度更高、时间更久,并在注射10h后达到峰值.PCS-PEG-lip-PDT处理组(每千克体重静脉给药10mg,照射剂量为150J/cm2)的肿瘤生长率下降至8.4%,而同时对照组肿瘤大小约增加了两倍.HE组织切片染色和透射电镜观察发现PEG-PCS-lip-PDT组的肿瘤细胞经历了凋亡和坏死.这些数据都表明,相比于PCS和PCS-li...     

背角无齿蚌酸性磷酸酶的部分性质及功能基团研究

作者在对背角无齿蚌外套膜中分离提纯到的一种酸性磷酸酶（ACPase）的部分酶学性质进行研究的基础上，测定了该酶的亚基分子量为61，800D，等电点（pI）为6.12(25℃），并对其氨基酸组成进行了分析，对ACPase的二级结构的圆二色谱（CD）分析显示，酶分子中α－螺旋占31.8%，β-折叠占42.6%，β－转角17.9%，对ACPase进行了化学修饰研究，初步认为组氨酸、丝氨酸、色氨酸和半胱氨酸有可能是该酶的功能基团，二硫键也对维持酶的活性中心构象极为重要。     

HPLC及LC-ESI-MS分离鉴定B-藻红蛋白的亚基(英文)

摘要:为了分析B-藻红蛋白的三种亚基,采用反相HPLC并通过二极管阵列/紫外可见光检测器和荧光检测器,以及LC-电喷雾/MS质谱检测器进行在线检测与鉴定.结果表明,根据在线检测的光谱特征,α,β和3个明显的γ亚基都能成功地被C4柱分离,且α和β亚基均在555 nm处有最大吸收峰,而γ亚基在493nm和555nm处有最大吸收峰.并结合质谱信息,可鉴别出α和β亚基,它们的相对分子质量分别为18977和20330.说明结合上述几种检测技术可为B-藻红蛋白的亚基鉴定提供可靠的结果.     

TRAPP复合物与自噬关系的研究进展

转运蛋白颗粒(TRAPP)是一种高度保守的多亚基蛋白复合物，参与囊泡运输、细胞自噬等过程.细胞自噬是真核生物中高度保守的降解和循环通路，在维持细胞稳态和应对环境压力中起着重要作用.近年来，TRAPP复合物与自噬关系的研究较为广泛，研究表明多个TRAPP复合物亚基参与自噬过程，且TRAPP复合物不同亚基的突变或缺失也与多种人类疾病有关.对TRAPP复合物参与调控细胞自噬机制的深入研究有助于了解一些人类疾病的发生和发展.     

粗粒化模拟研究核糖体30S小亚基的组装动力学（英文）

核糖体是一种生物大分子复合物，它负责蛋白质的生物合成。在大肠杆菌（E. coli）中，完整的核糖体由30S小亚基和50S大亚基组成。大约半个世纪以来，30S小亚基一直是研究核糖体体外组装的关键模型系统，并提出了其组装图谱。然而，该RNA-蛋白质复合物动态组装过程中很多的结构细节仍然未知。本文按照30S小亚基组装图谱的顺序进行了一系列粗粒化模拟，以研究其组装过程中的构象动力学。我们发现，裸露的16S rRNA三级结构非常不稳定，即使与早期组装蛋白结合后仍然会出现类似情况。中期组装蛋白可以显著限制16S rRNA的柔性，并使后者接近于天然结构。晚期组装蛋白的最终结合使16S rRNA完全获得其功能运动。特别地，我们发现蛋白S9和S3对30S小亚基的组装可能比其他核糖体蛋白有更重要的贡献。如果已知组装图谱，我们的粗粒化模拟策略可以广泛应用于研究生物大分子复合物的组装动力学。     

水稻抗逆性基因OsGATA23可变 剪切的生物信息学分析

水稻OsGATA家族第Ⅶ亚家族基因OsGATA23有两个成员,其中一个成员OsGATA23a是多应激反应转录因子,在盐碱度ABA处理和干旱条件下高度表达.利用生物信息学技术,从核酸和蛋白层面分析OsGATA23a亚基在非生物胁迫下显著表达,OsGATA23b亚基在该胁迫下不表达或低表达的影响因素.结果表明,OsGATA23基因的两个亚基蛋白结构的稳定性不同引起表达不同.首先,运用生物信息学技术对GATA23的蛋白性质、功能、结构进行分析;其次,对启动子顺式作用元件进行统计分析.比对水稻OsGATA23基因亚基及亚基差异氨基酸序列的理化性质发现OsGATA23a-1蛋白结构比较稳定.OsGATA23a平均亲水系数为0.327,该段氨基酸序列疏水.OsGATA23a-1氨基酸序列段存在信号肽位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化活性位点,而OsGATA23b-1不存在.在OsGATA23a-1中α螺旋显著减少,延伸链显著增加.OsGATA23b-1中α螺旋减少,无规则卷曲显著增加.对OsGATA23a和OsGATA23b蛋白三级结构模拟发现其亚基结构组成大致相似,对OsGATA23a-1、OsGATA23b-1蛋白三级结构模拟时,发现OsGATA23b-1在计算机算法上不存在稳定的三级结构构象,而无法模拟.OsGATA23基因启动子序列正反链上存在较多与逆境、根等相关的顺式作用元件.在非生物应激状态下,上游相关顺式作用元件选择性识别下游基因OsGATA23成员中具有比较稳定的疏水蛋白结构OsGATA23a亚基,同时在OsGATA23a-1存在信号肽位点,说明OsGATA23a-1不仅有利于OsGATA23a亚基蛋白结构的优化,而且还能被特异性识别.OsGATA23b亚基在逆境状态下不表达或低表达,说明OsGATA23b-1不利于OsGATA23b亚基蛋白结构稳定,且不能被特异性识别.     

非生物胁迫对油菜脯氨酸积累与BnGG2基因表达的影响

测定了非生物胁迫处理后甘蓝型油菜矮化突变体NDF-1及其野生型“3529”游离脯氨酸含量和G蛋白γ亚基基因BnGG2的表达变化.结果表明,从表型上看,突变体比野生型更耐胁迫.NDF-1和“3529”中脯氨酸含量随高温、高盐和干旱胁迫时间递增,但NDF-1中脯氨酸含量低于“3529”.NDF-1和“3529”中BnGG2基因均可被高盐(200 mmol/L NaCl)和干旱(20% PEG 6000)诱导,而被高温(40 ℃)抑制,NDF-1比“3529”反应更迅速明显.低温(4 ℃)胁迫后脯氨酸和BnGG     

水稻矮化突变体G蛋白α亚基基因的结构和表达

利用γ-Co60辐射诱发水稻特光矮-2(Oryza sativa L.cv.TGA-2)产生变异,获得一种稳定遗传的新型水稻矮化突变体dwarf69.dwarf69和TGA-2及其杂交后代F1、F2、F3成熟期的株高数据表明矮化表型受一对隐性基因控制.进一步研究发现,虽然dwarf69和TGA-2的G蛋白α亚基基因(Rice G protein alpha-subunit,RGA)编码区核苷酸序列只有一个核苷酸的差异,但RGA在野生型TGA-2中的表达量明显高于在突变体dwarf69中的表达量.对矮化突变体dwarf69和野生型TGA-2的RGA基因5＇上游区的序列分析表明,dwarf69 RGA 5＇上游区比TGA-2RGA5＇上游区多出1076bp.首次报道水稻矮化突变体中的RGA5＇上游区序列与其野生种的RGA5＇上游区序列存在显著的差异.     

新疆引进小麦品种(系)的HMW-GS组成与沉淀值的关系

以新疆近年来引进的32个小麦品种(系)为材料,运用SDS PAGE技术系统分析了其高分子量谷蛋白亚基构成、不同等位基因间亚基变异,并研究了高分子量谷蛋白亚基构成对沉淀值的影响。结果表明:不同亚基对沉淀值的作用不同,其中5 10>2 12,1>N,7 8与7 9的作用相近;Glu l评分与沉淀值呈极显著正相关,r=0.775 。