融合PPI网络和基因表达的复合物识别算法

从大规模相互作用网络中识别蛋白质复合物,对解释特定的生物进程和预测蛋白质功能具有重要作用,同时也是后基因组时代一 个最重要的研究课题. 考虑到传统仅基于蛋白质相互作用网络（PPI网络）的蛋白质复合物识别算法可靠性不高,本文提出 了一种新的融合PPI网络和基因表达数据的蛋白质复合物识别算法IPCIPG. 区别于之前用基因表达数据评估PPI网络可靠性的做法,本文提出在蛋白质复合物的识别过程中将PPI网络和基因表达数据有机地结合起来. 算法IPCIPG首先根据边聚集系数（ECC）与蛋 白质间共表达的相关性（PCC）计算PPI网络中每个节点的权重,权重最大的节点作为种子,然后从种子节点开始扩充生成稠密子图. 基于酵母数据集的实验结果表明,算法IPCIPG较其他算法HUNTER,HC-PIN,CMC,SPICI,MOCDE,MCL能够更准确,更有效地 识别出具有特定生物意义的蛋白质复合物.     

糖类遗传与生命起源

从遗传学角度探讨了糖类与生命起源，讨论了遗传学上的再认识，提出糖类在遗传学上扮演着重要、核心的角色、糖类是生命起源物质，基因是糖类衍生物。生命诞生过程可能是：先有糖类、然后有氨基酸和碱基；磷酸及其盐类既是生命物质的组成部分、也是催化剂，阳光或地热为能源，于是诞生了基因。生命体是分子相互作用、有序组合、自我调控的耗散体系。     

Myosin V from head to tail

Myosin V (myoV), a processive cargo transporter, has arguably been the most well-studied unconventional myosin of the past decade. Considerable structural information is available for the motor domain, the IQ motifs with bound calmodulin or light chains, and the cargo-binding globular tail, all of which have been crystallized. The repertoire of adapter proteins that link myoV to a particular cargo is becoming better understood, enabling cellular transport processes to be dissected. MyoV is processive, meaning that it takes many steps on actin filaments without dissociating. Its extended lever arm results in long 36-nm steps, making it ideal for single molecule studies of processive movement. In addition, electron microscopy revealed the structure of the inactive, folded conformation of myoV when it is not transporting cargo. This review provides a background on myoV, and highlights recent discoveries that show why myoV will continue to be an active focus of investigation. Received 31 October 2007; received after revision 4 December 2007; accepted 2 January 2008     

恶性肿瘤中IGFBP-rP1的抑癌基因作用机制及其可能的临床实用价值

胰岛素样生长因子结合蛋白相关蛋白1(IGFBP-rP1)是近年来恶性肿瘤的研究热点.本文主要综述IGFBP-rP1在恶性肿瘤中的抑癌基因作用机制及可能的临床实用价值.IGFBP-rP1在恶性肿瘤中的作用广泛涉及细胞的增殖、衰老、凋亡、分化、血管生成等多方面,研究指出IGFBP-rP1可缩短细胞增殖周期并影响非停泊性生长从而抑制增殖,降低致瘤能力;调节BRAF-MEKERK信号通路及pRB、HSP60等相关蛋白的表达从而影响衰老及凋亡;主要通过IGF依赖方式抑制血管生成;而且IGFBP-rP1表达下降跟肿瘤细胞分化程度降低有关.研究显示IGFBP-rP1有一定的临床实用价值,如其表达量跟恶性肿瘤的进展相关,低表达提示某些化疗药物抵抗,可提示预后.而在恶性肿瘤中特异性地上调IGFBP-rP1,可抑制肿瘤增殖及血管生成、诱导细胞衰老凋亡、提高肿瘤分化程度及化疗敏感性,具有治疗意义,但研究者们还在努力探究,争取早日找到一种临床有效的靶向IGFBP-rP1的基因治疗方法.     

P16及COX-2蛋白在宫颈癌中表达及意义

目的 探讨P16及COX-2蛋白在宫颈癌中表达及意义.方法 收集宫颈活检或手术标本138例,采用免疫组织化学方法分别检测P16及COX-2蛋白的表达,并分析结果.结果 正常宫颈组织、宫颈低级别上皮内瘤变(LSIL)、宫颈高级别上皮内瘤变(HSIL)、宫颈癌中P16蛋白阳性表达分别为0％(0/30)、42.3％ (11/26)、71.9％(23/32)、92％(46/50).COX-2蛋白阳性表达分别为3.3％(1/30)、50％(13/26)、75％(24/32)、88％ (44/50).随着宫颈病变分级升高,P16及COX-2蛋白阳性率逐渐上升,统计学差异有显著性(p＜0.05);结论 P16及COX-2的高表达在宫颈癌的发生、发展中均起作用.     

鱼血清蛋白质的微型双相电泳分析

本文采用改进的微型双相电泳系统，对兴国红鲤、草鱼及其杂交鱼血清蛋白质进行了分析，获得较清晰而稳定的结果，分析得出杂交鱼的血清蛋白质的组成更接近于父本草鱼。实验表明微型双相电泳是进行鱼类血清蛋白质分析的灵敏而有效的方法。     

Dual role of cAMP duringDictyostelium development

cAMP plays an essential role duringDictyostelium development both outside and inside the cell. Membrane-bound receptors and adenylyl cyclase are responsible for sensing and producing extracellular cAMP, whereas a phosphodiesterase is responsible for maintaining a low basal level. The molecular events underlying this type of hormone like signalling, which are now beginning to be deciphered, will be presented, in the light of cAMP analogue studies. The importance of intracellular cAMP for cell differentiation has been demonstrated by the central role of the cAMP dependent protein kinase. Mutants as well as strains obtained by reverse genetics will be reviewed which lead to our current understanding of the role of intracellular cAMP in the differentiation of both stalk and spore cells.     

一个人类锌指蛋白家族新基因ZFP28的克隆及表达

Krupple型锌指蛋白是一类具有重要功能的转录调节因子，初步克隆了一个新的人类krupple型锌指蛋白基因，经国际基因命我委员会批准命名为ZFP28。此基因长4076个碱基，含8个外显子，在基因组DNA上长18kb。它编码的蛋白质全长868个氨基酸，含1个信号肽，2个KRAB框和14个C2H2型的锌指。Northem Bolt分析表明该基因在人类早期胚胎的各个组织中普遍表达，在肺和肝中的表达水平最强，其结构和表达特征预示着它编码的是一个具DNA结合功能的转录调控因子。