DNA超细长弹性杆模型的动力学方程及其稳定性问题

对于DNA超细长弹性杆模型，给出运动和变形的几何关系，建立了动力学方程。在扰动方程基础上，给出了运动稳定性的定义和若干定理，明确了Kirchhoff方程的Lyapunov稳定性的概念以及与平衡稳定性的区别，为进一步研究超细长弹性杆的平衡稳定性奠定基础。     

固黄O-CTMAB-DNA三元体系的共振光散射光谱的研究及应用

研究了脱氧核糖核酸(DNA)与阴离子染料固黄O(FYO)及阳离子表面活性剂溴化十六烷基三甲铵(CTMAB)三元体系的共振光散射光谱的特征.考察了各种影响因素,在优化条件下确立了共振光散射强度与鱼精DNA和小牛胸腺DNA以及变性后的鱼精DNA和小牛胸腺DNA浓度之间的关系,相应的线性范围分别为0.026～7.00 mg/L;0.025～7.00 mg/L;0.032～6.00 mg/L;0.031～8.00 mg/L,相关系数为0.999 1;0.999 6;0.998 1;0.999 6,检出限分为7.0,6.0,11.0,12.5 μg/L,基于共振光散射的增强,建立了一种测定DNA的新方法.图6,表4,参8.     

血浆和尿液8-OHdG含量作为运动机能监控标志物的可行性分析

15名青年男子田径运动员在功率自行车上进行一次力竭运动,于运动前1d(Baseline)、运动前(Pre-Ex)、运动后即刻(Post-Ex)、运动后24h(Post-24h)、48h(Post-48h)和72h(Post-72h)分别测定肌肉酸痛强度,血浆、尿和淋巴细胞中8-羟基脱氧鸟苷(8-OHdG)含量以及血浆中肌酸激酶(CK)活性和丙二醛(MDA)含量,探讨8-OHdG作为运动机能监控标志物的可行性.结果显示,肌肉酸痛强度在运动后即刻明显升高(P0.01),24h达峰值(P0.01),72h恢复至正常水平;血浆CK活性在运动后24h开始升高(P0.01)并持续至72h(P0.01);血浆MDA含量和淋巴细胞8-OHdG含量均在运动后即刻显著升高(P0.01),24h恢复至安静水平(P0.05);血浆和尿液中8-OHdG含量在各时间点均无显著性变化(P0.05).血浆和尿液中8-OHdG含量在Baseline、Pre-Ex的两次测试间均无显著性差异,日间变异系数(CV)分别为72.8%(95%CI:57.2%~99.9%)和87.8%(95%CI:66.1%~130.5%).ELISA法测定8-OHdG的批内CV为2.25%~4.67%,批间CV为5.25%~7.12%.以上结果表明,虽然力竭运动可造成氧化应激、淋巴细胞DNA损伤和运动性肌肉损伤,但由于血浆和尿液中8-OHdG含量存在显著的日间生物节律变异,因此可能不是运动机能监控(DNA氧化损伤及过度疲劳)的敏感标志物.     

山药基因组DNA的提取和RAPD反应条件的优化

研究了山药基因组DNA的提取方法;对Mg2+浓度、dNTPs浓度、引物浓度和Taq酶用量进行了优化,建立了最佳的RAPD反应体系:在25μL反应体系中Mg2+浓度为2.0 mmol.L-1,dNTPs浓度为0.25 mmol.L-1,引物浓度为20 pmol.L-1,Taq酶1.5 U,模板DNA为200 ng.扩增程序为:95℃预变性7 min;94℃变性30 s,36℃退火45 s,72℃延伸2 min,共35个循环;72℃终延伸10 min.     

利用吖啶酯化学发光研究甲醛和乙醛对DNA的损伤

以吖啶酯为嵌入DNA双螺旋结构的化学发光指示剂,以0.10 mol/L HNO3 0.3%H2O2和0.3 mol/L NaOH 2%TritonX—100为发光启动试剂,建立了一种简单的评价DNA断裂损伤的化学发光分析新方法.结果表明,低浓度的甲醛引起DNA的断裂损伤,高浓度的甲醛引起DNA链的交联,乙醛仅引起DNA链的断裂损伤.同时研究了甲醛和乙醛对DNA的损伤行为及其可能的机制.     

背包问题的三链DNA计算模型

背包问题是组合优化中很重要的NP问题。因为三链DNA的特殊结构在参与反应时可以减少计算模型的错解率,且在生化反应中利用磁珠分离法对解进行分离较方便准确,文章利用三链模型求解0-1背包问题和完全背包问题。首先将背包问题的约束条件进行分解,再将物品质量编码为DNA片段,链接反应后,利用凝胶电泳技术和三链模型检测所包含的物品组合,得到满足约束条件的物品组合,再利用此方法检测价值最大的组合,即问题的解。其他的背包问题也可用此方法来解决。     

基因芯片设计及数据分析软件系统

基因芯片是提取生物分子信息的一种新技术,该技术是分子生物学与电子信息科学交叉的产物。基因芯片在基因型分析、基因表达监控和疾病检测方面有着重要的应用。本论分析基因芯片中的信息处理问题,介绍一个高密度基因芯片设计及数据分析软件系统,该系统包括基因芯片探针设计、芯片优化、杂交图像处理和检测结果分析等功能。     

点击化学用于生物分子标记的研究进展（英文）

自1999年Barry Sharpless提出点击化学的概念以来,其得到极大的关注和发展。主要介绍了点击化学的定义和分类,其中Cu(I)催化下炔基与叠氮可形成稳定的1,2,3-3氮唑化合物,这类反应的应用最为广泛。它在标记生物大分子方面的应用主要从4个方面展开,包括标记多肽和蛋白,DNA和RNA,细胞中的酯质和病毒表面。     

Environmental chemical stressors as epigenome modifiers: a new horizon in assessment of toxicological effects

In eukaryotic cells, chromatin transformation from euchromatin into heterochromatin as a means of controlling gene expression and replication has been known as the ‘‘accessibility hypothesis' '. The interplay of epigenetic changes including histone modifications, DNA methylation, RNA interference(RNAi) and other func- tional epigenetic components are intricate. It is believed that these changes are well-programmed, inherited and can be modified by environmental contaminant stressors. Environmentally-driven epigenetic alterations during development, e.g. embryonic, foetal or neonatal stage, may influence disease susceptibility in adulthood. Therefore, understanding how epigenome modifications develop in response to environmental chemicals and, how epigenetic-xenobiotic interactions influence human health will shed new insights into gene-environment interactions in the epidemiology of several diseases including cancer. In this review, we consider studies of chemical modifiers including nutritional and xenobiotic effects on epigenetic components in vitro or in vivo. By examining the most-studied epigenome modifications and how their respective roles are interlinked, we highlight the central role of xenbiotic- modified epigenetic mechanisms. A major requirement will be to study and understand effects following environmentally-relevant exposures. We suggest that the study of epigenetic toxicology will open up new opportunities to devise strategies for the prevention or treatment of at-risk populations.