基于人工鱼群的DNA编码序列组合优化算法研究

分析DNA编码序列设计的目标及需要满足的约束条件,提出全局人工鱼群算法(GAFSA)生成有效的DNA编码序列.根据优化问题的约束条件及人工鱼群的特点,对人工鱼的视野和步长按进行动态调整.实验结果表明,所述GSFSA算法比遗传算法、多目标进化算法、遗传粒子群算法算法产生的DNA编码序列具有更高的质量.     

基于DNA序列的信息隐藏

研究了以DNA序列为载体的信息隐藏,提出了一个信息隐藏算法.该算法首先将秘密信息经预处理、编码、调制变成一维随机DNA序列;然后由一个随机数序列决定隐藏信息在载体的高复杂性区域的位置;最后在隐藏信息的位置,秘密信息字符替代载体字符.由该算法实现的信息隐藏既具有一定的稳健性和安全性,又符合生物学意义.实验结果也证明了该算法的有效性.     

有限理性下的进化博弈与合作机制

在介绍传统博弈论基本假设的基础上,指出完全理性是传统博弈论均衡选择的最基本假设和完全理性在动态博弈中的局限,提出有限理性与动态学习是动态博弈中多个智能体选择的基础;探讨了不断改善有限理性的进化学习方法和智能体选择机制;解释了进化博弈与进化稳定策略的本质;指出了传统博弈论与进化博弈论的区别;提出了有限理性下进化博弈与合作机制研究的问题,给出了有限理性下进化博弈与合作机制的研究结果.     

SPL家族基因复制及功能分化分析

【目的】基因复制及随后的功能分化是基因组和物种演化的重要驱动力。植物特有的转录因子家族SPL(SQUAMOSA-promoter binding protein like)广泛参与调控植物生长发育及响应逆境胁迫,为研究重复基因的起源方式和进化命运提供了良好的研究系统。本研究对葡萄(Vitis vinifera)、番木瓜(Carica papaya)、毛果杨(Populus trichocarpa)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)4种模式植物的SPL基因家族开展基因复制及功能分化分析,为进一步研究SPL基因功能、预测种属特异性的功能基因提供系统进化角度的参考。【方法】利用SBP特征结构域,鉴定葡萄、番木瓜、毛果杨和拟南芥4种模式植物中SPL基因家族成员,并利用最大似然法构建系统进化树。基于物种内、物种间基因组共线性,分析SPL基因家族发生基因复制的方式及差异保留情况,并计算保留的SPL直系和旁系同源基因的同义、非同义替换率,分析功能分化情况。【结果】在4种模式植物中共鉴定出SPL基因73个,其中42个是miR156的靶基因。系统进化分析显示:73个SPL基因聚类为9个主要分支,miR156靶向SPL基因成簇聚集在6个主要分支;Clade I中SPL基因编码的2个锌指结构基序为C4和C₂HC,而其余8个分支中SPL基因的锌指结构基序由C3H和C₂HC组成。大规模基因组复制事件(片段复制或全基因组复制)是SPL基因家族发生基因重复的主要方式。根据基因组复制事件推算,15个古基因位点理论上应复制出的360个位点中,83.6%的重复位点发生丢失或演化成非SPL基因。本研究鉴定出旁系同源基因17对,直系同源基因27对,且所有旁系和直系同源基因的K_a/K_s(非同义替换率和同义替换率之比)值均小于1。【结论】在不同物种中保留下来的SPL直系同源基因受到较强的纯化选择,在功能上具有保守性;同一物种中保留下来的SPL旁系同源基因在进化过程中维持部分功能冗余,但在组织表达偏好性和蛋白功能上已呈现出不同形式的分化。     

基于Gabor滤波的鲁棒复制-粘贴图像取证方法

复制-粘贴是一种常见的数字图像篡改技术,目前的复制-粘贴数字图像取证技术未考虑旋转和缩放攻击。文章提出了一种新的复制-粘贴数字图像取证方法,该方法选择了鲁棒的、抗旋转及抗缩放的图像Ga-bor特征,并结合量化的DCT系数进行图像块匹配,以检测篡改区域。实验结果表明,该方法具有较强的鲁棒性,可以抵御旋转、缩放攻击,同时也可以取得较好的检测准确率。     

彗星电泳检测细胞DNA损伤应用新进展

彗星电泳是近年发展起来的一种测定单个细胞DNA损伤的方法 ,因其操作简单、快速及灵敏等特点 ,应用范围十分广泛 .着重介绍了这一技术的发展、图形分析及应用进展     

酶性DNA（Ⅲ）：鱼精DNA酯酶活性的初步研究

从鱼精提取的ＤＮＡ表现酯酶活性。用α或β萘酯作底物，坚牢蓝作显色偶合剂，发现萘酯能被此ＤＮＡ水解从而导致坚牢蓝出现特征性的紫红色。ＤＮＡ溶液中的Ｈ＾＋或ＯＨ＾－并不能使坚牢蓝显色。     

水稻叶绿体DNA提取和纯化方法优化

改进了水稻叶绿体DNA的提取和纯化方法,获得的高纯度的水稻叶绿体DNA适于PCR扩增等分子操作.本方法要点为:匀浆液2 300 r.min-1离心去核,上清液4 300 r.min-1离心,沉淀用于DNA提取,提取后的叶绿体DNA用RNase和蛋白酶K纯化.     

DNA凝胶电泳区带的定量

本文通过实验证实了DNA凝胶电泳图谱中区带的扫描吸收峰面积正比于DNA的质量。据此可以对区带中的DNA含量进行定量分析。为限制性核酸内切酶的动力学常数的测定提供了简单的方法。     

枣树基因组DNA提取方法及RAPD体系的建立

以8个枣树品种的嫩叶为材料,比较了不同的DNA提取方法,结果表明：采用改良的CTAB法提取的DNA纯度和产率,虽然不比改良SDS的高,但适宜RAPD分析．在20μL反应体积中,RAPD分析的优化反应体系为：引物0．2pmol·L^-1、Mg^2＋2．0mmol·L^-1、dNTP200μmol·L^-1、TaqDNA聚合酶1．2U．改良的CTAB法是枣树RAPD分析基因组提取DNA的最好方法．