Investigations into the perplexing interrelationship of the Genus Takifugu Abe, 1949 (Tetraodontiformes, Tetraodontidae)

The phylogenetic relationships within the genus Takifugu Abe, 1949 (Tetraodontiformes, Tetraodonti- dae) remain unresolved. Because of the use of Takifugu as model organisms, the resolution of these relationships is crucial for the interpretation of evolutionary trends in biology. Pufferfishes of this ge- nus are comprised of a comparatively small number of species and are mainly distributed along the coastal region of the western part of the Sea of Japan and the coastline of China. Mitochondrial gene sequences were employed to test the phylogenetic hypotheses within the genus. Seventeen species of the genus were examined. Molecular phylogenetic trees were constructed using the maximum parsi- mony, neighbor-joining, maximum likelihood and Bayesian methods. Our hypothesis of internal relationships within the genus differs from previous hypotheses. Our results indicate that (1) the genus Takifugu is a monophyletic assemblage; (2) the genus is divided into 6 subgroups based on the mo- lecular data; and (3) there is low genetic diversity among the species within this genus. In addition, speciation within Takifugu appears to be driven by hybridization and isolation by distribution. Our re- sults also suggested that the taxonomy in the genus should be clarified based on both molecular and morphological data.     

光照和黑暗条件下大豆和玉米基因表达差异的初步研究

光照黑暗条件下，植物幼苗的形态建成差异十分明显，以双子叶植物大豆和单子叶植物玉 材料，利用改进的ｍＲＮＡ差异展示技术分析了黄化苗和苗的基因表达的差异，黄化苗和苗基因表达差异可以归纳为“：黄化苗基因特异表达，绿苗基因特异表达，黄化苗基因表达增强，绿苗基因表达增强，黄化革和绿苗基因表达水平和近五咱类型大豆绿苗中基因特异表达类型比黄化苗要多，玉米中则相反，黄化苗基因特异表达类型多于绿苗，试验中还对差异展     

基于偏最小二乘与极大间距准则的微阵列分类

 针对基因表达数据中的高维小样本问题，提出了一种两阶段的识别框架：“偏最小二乘法(PLS)+极大间距准则(MMC）”。该方法首先使用PLS算法提取出带有分类信息的特征，然后使用MMC准则对样本进行分类。在六个公共的基因数据库上与一些常见的基因分类方法相比较，结果显示了该方法对基于基因表达数据的肿瘤分类有效且稳定。     

Isolation of cDNAs Enconding Two Distinct Transcription Factors Binding to DRE cis-acting Element Involved in Cold- and drought-induced Expression of Arabidopsis rd29A Gene

ＩｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎＳｅｖｅｒｅｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌｃｈａｎｇｅｓ ,ｓｕｃｈａｓｌｏｗ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ ,ｄｒｏｕｇｈｔａｎｄｈｉｇｈ ｓａｌｔ ,ａｆｆｅｃｔｔｈｅｇｒｏｗｔｈａｎｄｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆ ｐｌａｎｔｓａｎｄｔｈｅｐｒｏｄｕｃｔｉｖｉｔｙｏｆｃｒｏｐｓ .Ｐｌａｎｔｃｅｌｌｃａｎｎｏｔｏｂｔａｉｎｗａｔｅｒｗｈｅｎｓｕｂｊｅｃｔｅｄｔｏｄｒｏｕｇｈｔｏｒｈｉｇｈ ｓａｌｔｃｏｎｄｉｔｉｏｎ .Ｌｏｗ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅａｌｓｏｒｅｄｕｃｅｓｗａｔｅｒｓｔａｔｅｏｆ …     

采用偏最小二乘法的基因-药物共模块识别

首先,将药物二维化学结构转化为数值序列,计算药物之间的皮尔逊相关系数,进而构建药物关联网络;然后,在带有基因网络约束的稀疏偏最小二乘算法的基础上,加入药物关联网络信息,提出伴有基因和药物关联网络正则约束的稀疏偏最小二乘(SGDPLS)算法;最后,将SGDPLS算法应用于基因-药物共模块识别.结果表明:药物关联网络信息的加入能够有效提高所识别的共模块中基因模块与药物模块的相关性,增加共模块的生物可解释性.     

PCR技术在分子生物学中的应用

PCR方法(Polymerase China Reaction),即聚合酶链式反应,又称体外基因倍增,它在分子生物学中有着广泛的应用。文中主要讨论了PCR技术在辅助构建跳跃及连锁文库(Jumping andLinking Library),染色体走步(Chromosome Walking),基因修饰(Rene Modification),重组PCR(Recombinant PCR),足迹法(Footprinting),进行克隆(Cloning)和亚克隆(Subcloning)诸方面的应用,同时指出了PCR技术存在的不足,尚有待于改进。     

从细胞色素b基因序列分析羚牛分子系统进化

目的分析羚牛分子系统进化,解决多年来关于羚牛分类地位及其与麝牛关系的争论。方法应用聚合酶链式反应(PCR)分别扩增羚牛、绵羊、山羊细胞色素b基因,并对其全序列(1140bp)进行测定。结合GenBank检索序列,对9种偶蹄类动物(麝牛、绵羊、羚牛等)、1种奇蹄类动物(斑马)的细胞色素b基因序列差异进行分析,并基于序列差异构建分子系统树。结果羚牛与羊亚科的动物亲缘关系最近(序列差异分别为9.085%和11.652%),与其他动物亲缘关系较远(序列差异为12.344%~23.333%),与麝牛的差异达到了13.658%。羚牛与绵羊分歧的时间约在360万年前,而与麝牛的分歧时间约在550万年前。结论将羚牛归入羊亚科较为合理,羚牛和麝牛形态和行为上很强的相似性可能是趋同进化的结果。     

位点特异性频率模型在昆虫分子系统发育分析中的应用

根据位点特异性频率模型(site-specific rate model),利用PAUP软件,对线粒体COI基因序列不同密码子位点的数据模块分别进行了豉甲科和水生肉食亚目在亚科或科水平上的系统发育学分析,结果表明第二密码子数据模块获得的系统分析结果与形态学分析结果一致。表明位点特异性频率模型在线粒体COI基因作为标记来进行昆虫分子系统发育分析上获得了更好的效果。     

肿瘤靶向治疗研究进展

肿瘤是目前世界上死亡率最高的疾病之一,手术、放化疗是目前治疗肿瘤的常用手段.但是肿瘤是一个多因素导致的疾病,必须从多方面考虑其治疗机制.靶向治疗是现阶段肿瘤治疗的新技术,可针对多种机制来抑制肿瘤的发生和发展或消除肿瘤.对此,相关研究者们已在肿瘤靶向治疗方面开展了大量的工作,为肿瘤的防治提供了参考依据。