一种改进的六联体使用频率编码测度

在基因预测软件中常用的编码测度得到的序列编码潜力大小往往与序列的C G含量紧密相关,从而影响了对蛋白编码区的识别效果．研究发现六联体使用偏好与其自身C G含量存在一种近似线性的相关性,据此提出了一种改进的六联体使用偏好模型,通过综合考虑六联体使用频率与六联体的C G含量,可简便有效地减小序列编码潜力大小对序列C G含量的依赖性．测试表明,与分类建模策略相比,该方法所需的训练数据较少,而且具有更好的蛋白编码区识别效果,因此可用于基因预测软件中以提高蛋白编码区与基因结构的预测精度．     

Aβ_(37-42)形成二聚体的分子模拟研究

阿尔茨海默症是一种神经退行性疾病,多发病于老年人群.该疾病不但严重影响患者的健康及正常生活,还给患者家属带来极大痛苦.因此治疗该疾病成为科学界急欲攻克的难关.而治疗的基础是解析病理,大量研究表明该病患者脑内有大量纤维状Aβ蛋白质聚集物.因此研究Aβ蛋白质如何聚集是解析病理的关键.同时预防和阻止Aβ蛋白质聚集也成为治疗阿尔茨海默症的一种可选方案.本文即选取Aβ蛋白质片段,以分子动力学模拟方法,详细分析其形成稳定二聚体的完整过程.研究发现该蛋白质片段上残基侧链之间的疏水作用促使两个Aβ37-42单体相互靠近,其间会形成多种非稳态中间体,其结构经过不断调整最终才形成稳定的二聚体结构.该结构调整过程对形成稳定的二聚体结构非常重要.在此过程中两条肽链主链形成氢键的个数逐渐增加,同时伴随形成了新的残基侧链之间的相互作用.研究发现在二聚体形成的全过程中Ile41和Ala42均起到不可忽视的作用.Ile41由于其侧链具有疏水性且体积相对较大,可通过其疏水作用力促使两个单体相互靠近.而Ala42在后期结构调整中发挥了一定作用,稳定了二聚体的结构.该研究有助于更好地理解Aβ蛋白质聚集特别是其形成二聚体的过程,同时也为防治Aβ蛋白质聚集提供了一些理论依据.     

Morphometrical analysis of four populations of the Little Blue Penguin,Eudyptula minor

Variations in coloration, external morphology and plasma protein between four populations of the Little Blue Penguin, E. minor were determined. A south-north cline was found along the coast of New Zealand.     

人源蛋白酪氨酸磷酸酶PTP1B功能域及其全酶的原核表达及活性比较

通过设计引物,利用RT-PCR从人肝癌细胞(huh-7)中克隆蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP1B)全长及功能域PTPc的cDNA序列并连接到pGEM-T Vector载体上,测序正确的cDNA序列连接到表达载体pET-32a(+)上,分别在大肠杆菌Transetta(DE3)和BL21(DE3)菌株中稳定表达目标蛋白,经Ni 2+亲和柱纯化后目的蛋白达到了电泳纯,通过酶促动力学方法分析两种蛋白的体外活性.本实验成功表达了PTP1B和PTPc可溶性蛋白,并发现Transetta(DE3)菌株较BL21(DE3)有更高的蛋白表达能力;酶促动力学分析表明,PTP1B全酶的Vmax为16.13mmol·L-1·s-1,Km为0.94mmol/L;其功能域PTPc的Vmax为5.49mmol·L-1·s-1,Km为0.54mmol/L.表明PTP1B全酶的活性高于PTPc功能域的活性.     

考马斯亮蓝法快速测定菜籽粕中可溶性蛋白质的含量

采用考马斯亮蓝G-250染色法对菜籽粕中可溶性蛋白质含量进行测定,在波长595 nm处测定其吸光度.实验表明,可溶性蛋白质含量在10~100μg/mL之间呈现良好的线性关系,通过此法测得菜籽粕中可溶性蛋白的平均含量为5.30%.方法简便快速、灵敏度高、重现性好,是测定菜籽粕中可溶性蛋白质的一种有效方法.     

修饰作用导致大豆蛋白氨基酸低效化问题的研究进展

大豆蛋白是广泛应用的食品加工原料,是人体可摄入的优质氨基酸来源,工业生产中为提高大豆蛋白的加工功能特性,常对其进行修饰改性。然而修饰改性有时会导致氨基酸消化吸收低效化。综述了大豆蛋白的功能特性及营养价值、主要修饰作用及其对氨基酸有效性影响,并对现阶段国内外研究的动态进行了分析,并提出今后的研究方向和展望,较全面地呈现修饰导致的大豆蛋白氨基酸低效化问题的研究进展,进一步解释蛋白聚合体与氨基酸消化性的关系,为提高大豆蛋白利用率,创新加工生产提供参考。     

有机酸沉淀法分离牡蛎中的糖原和蛋白质

研究了有机酸对牡蛎匀浆中糖原和蛋白质分离效果的影响。采用有机酸溶液对牡蛎匀浆进行处理,离心后得到富含蛋白质的沉淀和糖原含量相对较高的上清液,以达到分离牡蛎中糖原和蛋白质目的。通过单因素实验和正交试验得到的优化工艺条件为:牡蛎匀浆与0.5mol/L的乙酸溶液的料(g)液(mL)比为1∶3,将pH值调至7.0,60℃下搅拌30min,最后5000r/min离心10min。在此优化条件下得到的沉淀中蛋白质质量比为62.1%,占总蛋白质的59.6%；糖原质量比为2.21%,占总糖原的5.5%。上清液中蛋白质质量比为19.4%,占总蛋白质的29.7%；糖原质量比为23.8%,占总糖原的93.5%。研究结果表明,乙酸沉淀法可有效分离牡蛎中的糖原和蛋白质。     

短期UVB辐照对抱茎风毛菊光合作用的影响

以抱茎风毛菊(Saussurea chingiana)为实验材料,利用短期中波紫外线(UVB,Ultraviolet B)辐照对比实验(CK:对照组,自然大气UVB强度;UVB:UVB辐照度为205μw·cm~(-2),短期辐照时间为4h)研究了光合色素含量、叶绿素荧光快速诱导动力学曲线(OJIP)和光合蛋白表达量的变化。结果显示:UVB辐照降低了抱茎风毛菊的叶绿素质量分数,增大了叶绿素a/b比值和类胡萝卜素质量分数;UVB辐照导致PSII反应中心蛋白(D1、D2)、捕光色素蛋白(CP43)、Cytb6f复合物和ATP酶复合体蛋白均发生降解,外周捕光色素蛋白(LHCII)的表达量升高;UVB辐照抑制了从QA-往下的电子传递,增加了热耗散能量,阻碍了光合作用的碳同化过程,进而降低光能利用率。叶绿素a/b比值、类胡萝卜素含量的增大虽然缓解了短期UVB辐照对抱茎风毛菊的伤害,但是UVB辐照对光合作用仍具有显著的负影响。     

基于T检验与支持向量机的蛋白质质谱数据分析

对蛋白质质谱数据进行模式识别成为癌症诊断的一种新方法,但质谱数据存在高维小样本问题,因而数据分析面临着巨大挑战.在对原始数据进行基线校正与标准化并用分箱法进行降维预处理的基础上,提出用T检验方法选取特征,对蛋白质质谱数据进行分析研究.实验对卵巢质谱数据集进行分类,用10-fold交叉验证法选择训练和测试样本,以支持向量...     

碱提酸沉法制备燕麦浓缩蛋白的工艺研究

燕麦蛋白具有高营养价值,可采用碱提酸沉工艺以脱脂燕麦粉为原料提取.以燕麦浓缩蛋白的提取率为目标函数,在通过单因素试验对提取的工艺条件进行初步探索的基础上,运用正交试验设计对碱提酸沉法的工艺条件予以优化,确定合适的提取条件为:浸提pH值9.5、液料比10:1、温度45～50℃、时间90min.在此条件下,燕麦浓缩蛋白的提...