基于扩展语义特征机器学习消歧的基因提及标准化

提出了一种基于扩展语义向量的特征表示方法,利用机器学习的方法来解决基因提及标准化中的消歧问题。首先应用高性能的命名实体识别系统识别文献中的基因提及;其次采用不同的搜索策略生成候选结果;再次以扩展语义信息作为特征用机器学习的方法进行消歧;最后利用Wikipedia构建后过滤器对候选结果进行过滤处理。在BioCreative Ⅱ GN任务测试集上的试验表明,该方法的F值达到了83.2%。     

基因工程的发展现状和应用前景

介绍了＂基因＂和＂基因工程＂,从植物育种、动物育种、医学、保护生物多样性等6个方面阐述了基因工程的应用价值,对基因工程的研究前景进行了展望。     

病毒利用微RNA抑制免疫反应

微RNA（MicroRNA）多见于人体中不产生蛋白质的基因组——即所谓的“垃圾DNA”中,是一种极小的非编码RNA,通常会抑制基因的表达。据估计,人体内有三分之一的基因会受到微RNA调控。有科学家认为,微RNA会对人体先天免疫系统进行调节,但是一直没能证实这种调节会产生什么样的后果,也无法认定这会与病毒感染有关。     

关于大脑的五大问题

人脑具有已知领域中最令人吃惊的复杂构造。不过,由于大脑成像技术、基因、干细胞研究等方面的进步,我们开始解开一些有关人脑的谜团。     

中国6种白色羽鹭科鸟类的系统归属研究

对黄嘴白鹭(Egretta eulophotes)、岩鹭(E.sacra)、大白鹭(E.alba)、中白鹭(E.intermedia)、白鹭(E.garzetta)和牛背鹭(Bubulcus ibis)6种白色羽鹭科鸟类和其它8种鹭科鸟类的线粒体12S rRNA基因分析比对及建立系统树.结果显示:黄嘴白鹭和岩鹭的亲缘关系最近,它们与白鹭聚为一支,三者间遗传距离小于1.05%,应归于同一属,即白鹭属;大白鹭、中白鹭与白鹭属种类遗传距离大于9.52%,而与鹭属种类的遗传距离在4.89%～5.46%之间,可见它们与鹭属的亲缘关系更近,应从白鹭属分离出来;大白鹭、中白鹭和牛背鹭三者与鹭属种类的遗传距离都小于5.46%,亲缘关系比较接近,综合(开鸟)亚科外群的遗传距离分类标准(6.74%～7.70%),支持将大白鹭、中白鹭和牛背鹭归入鹭属的结论.     

一个NBS-LRR蛋白质基因转化水稻及其超量表达

水稻Osxoc1334是一个编码NBS-LRR类蛋白质的基因,通过构建该基因的超量表达载体,并在农杆菌EHA105介导下转化中花11号水稻,最终获得6株再生水稻植株.对抗性愈伤组织和再生植株用GUS组织化学染色检测,结果抗性愈伤组织和6株再生水稻植株均可染上蓝色,而野生型植株不变色,用潮霉素磷酸转移酶基因的特异引物进行PCR鉴定,再生植株均可扩增到目标条带而野生型植株则不能,表明Osxoc1334基因已随T-DNA整合到再生水稻植株基因组中.采用半定量和荧光定量PCR分析转基因水稻的Osxoc1334基因表达,结果其中3株转基因植株的Osxoc1334基因平均相对表达量明显增强,其中1株为野生型植株的23.5倍.这为进一步鉴定该基因功能奠定了基础.     

酿酒酵母功能基因组学研究进展

随着各种微生物基因组序列信息的积累和测序工作的不断完成,酿酒酵母基因组学研究的重点已由传统的结构基因组学发展到了功能基因组学,并从单一的基因功能研究转向多个或整个基因组系统地去了解真核生物生命活动的本能。对基因组学水平上酿酒酵母功能基因的生物芯片分析,代谢通路和功能图谱,以及比较基因组学研究进行综述。     

鱼类Cathelicidin抗菌肽的研究进展

抗菌肽作为非特异性免疫因子,在机体抵抗病原感染中发挥重要的作用.Cathelicidin是目前发现的一个最大抗菌肽家族,具有多重生物学功能.鱼类Cathelicidin的研究虽比较滞后,但国内外学者已取得了一些研究成果.综述了前人鱼类Cathelicidin的研究成果,如基因结构、蛋白酶酶切作用、体内表达状况和生物学活性,以期为后续研究提供一定的研究基础和研究思路     

p53 基因敲除小鼠生长发育和繁殖性能的调查

摘要: 目的观察p53 基因敲除小鼠与BALB/c 小鼠在生长发育和繁殖性能方面的差异。方法p53 基因敲除小 鼠和BALB/c 小鼠各34 只,雌雄各半,观察其2 周龄至12 周龄的体质量和体长,并随机选取30 笼一雌一雄所产第 2 胎仔鼠进行幼仔个数的统计。结果在生长发育方面,3 周龄时p53 基因敲除小鼠与BALB/c 小鼠体质量无明显 差异,P = 0. 846 ＞ 0. 05; 6 周龄时p53 基因敲除小鼠体质量明显低于BALB/c 小鼠,P = 0. 000 ＜ 0. 05; 体长在3 周龄 和6 周龄时p53 基因敲除小鼠体长明显低于BALB/c 小鼠,P = 0. 000 ＜ 0. 05。在繁殖性能方面,p53 基因敲除小鼠 同样明显低于BALB/c 小鼠,P = 0. 000 ＜ 0. 05。结论初步研究了p53 基因敲除对小鼠的繁殖与发育的影响,与 BALB/c 小鼠比较均有显著差异。