贵州草海鲫鱼Spo11基因的克隆、生物信息学和表达分析

【目的】探索环境内分泌干扰物壬基酚(Nonylphenol,NP)对贵州草海鲫鱼(Carassius auratus)Spo11 基因表达的影响。【方法】通过PCR方法克隆实验鱼Spo11 基因,利用生物信息学方法分析SPO11蛋白的氨基酸序列、理化性质和结构特点;并设置1个对照组和低、中、高共3个不同剂量NP处理组,用NP质量浓度分别为0,25,50和100μg·L-1的水体浸浴实验鱼28d后,检测各组实验鱼Spo11 基因的表达情况。【结果】Spo11 基因c DNA序列长度为1471bp(Gen-Bank登录号:MF66470),包括66bp的5′非翻译区、编码383个氨基酸的1152bp的开放阅读框和253bp的3′非翻译区。预测SPO11蛋白质相对分子质量为43.23k Da,等电点IP为6.89,主要由亮氨酸、丝氨酸和缬氨酸组成。该蛋白是含有信号肽的不稳性亲水蛋白,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。与对照组实验鱼的Spo11 基因相对表达量相比,中剂量和高剂量的NP处理组实验鱼Spo11 基因相对表达量均有所升高,与前者的差异均具有统计学意义(p<0.05)。【结论】环境内分泌干扰物NP可以影响贵州草海鲫鱼Spo11 基因的表达。
     

S-腺苷甲硫氨酸合成酶的可溶性表达

系统考察了pET可溶性表达系统对酵母来源的S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因的表达情况,结果显示:采用含Nus·Tag融合标签的pET-44a为载体,trx B和gor双突变的Origami为宿主最适合目的蛋白的可溶性表达。进一步考察不同来源的大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、苏云金芽孢杆菌的可溶性时,也得到了相似的结论,比较发现酵母来源的SAM合成酶可溶性表达的比活力最高达60.9 U/mg。     

有向基因组间重组距离的线性时间计算

讨论基于基因组中染色体之间的移位、染色体内部的翻转、融合和分裂的基因组排序问题,给出了计算两个有向多重基因组重组距离的线性时间算法.     

探秘病毒王国

随着病毒的神秘面纱被逐渐揭开,人们对病毒有了全新的认识。蒂姆·罗博特姆是一位微生物学家,当他从生长在英格兰布拉德福德市的一座水塔中的阿米巴变形虫中分离出一种未知微生物时,他显得格外激动,他的神情就好像在看一部令人毛骨悚然的恐怖片。他惊讶万分,大张着嘴,却小声地叫道":它     

大肠杆菌基因编码区域基分布非均匀性的研究

基于大肠杆菌１２９２个基因编码区。１）统计出了氨基酸丰度分布，与一般生物氨基酸丰度比较发现，构成大肠杆菌蛋白质的氨基酸中疏水氨基酸相对较多，小氨基酸相对较少，二硫键相对较少；（２）发现编码区域基分布的徨与氨基酸丰度的分布和同义密码子的非均匀使用紧密相关；３）分析了编码开始区域、编码终止区域碱基分布和氨基酸丰度分布的差别，得到了一些有意义的结论。     

人白血病仰制因子基因在酵母中的融合表达

用ＰＣＲ突变的方法使人白血病抑制因子基因的终止密码子缺失，并与质粒ｐＰＩＣＺαＡ上的ｍｙｃ表位及６个组氨酸处于同一读码框，构建融合表达载体ｐＰＩＣＺαＡ－ｈＬＩＦＭ．通过氯化理化学转化法使表达载体整合到毕赤巴斯德酵母Ｘ－３３的基因组ＤＮＡ中。转化子经甘油增菌和甲醇诱导，实现了ｈＬＩＦ基因在毕赤酵母表达载体系统中的表达．ＳＤＳ－ＰＡＧＥ检测和 Ｗｅｓｔｅｒｎ ｂｌｏｔ分析结果表明在相对分子质量为６１ ０００处有一条人白血病抑制因子特异蛋白带．凝胶薄层扫描分析结果显示表达的目的蛋白占培养液上清总蛋白的 ３３．３％．且该表达产物具有抑制小鼠畸胎瘤细胞Ｆ９克隆形成的活性．     

HCV基因分型在丙肝诊断和治疗中的应用

目的 建立ＨＣＶ基因分型方法，研究ＨＣＶ基因型与肝病程度的关系，探讨ＨＣＶ基因型与ＩＦＮ－ａ２ｂ抗病毒疗效的关系。方法 ＨＣＶ基因组ＮＳ５区ＰＣＲ扩增产物酶切分型。结果 ７３例ＨＣＶ感染者中有ＨＣＶⅡ型４５例，ＨＣＶⅢ型２８例。Ⅱ型ＨＣＶ感性肝炎３１例，肝硬化１４例；Ⅲ型ＨＣＶ感染者中有慢性肝炎２６例，肝硬化２例。Ⅱ型ＨＣＶ感染者的肝硬化发生率显著高于Ⅲ型ＨＣＶ感染者（Ｐ〈０．０５）。所有病人均应     

植物细胞壁中富含甘氨酸的蛋白质

在植物的某些组织中存在富含甘氨酸的蛋白质，根据ＧＲＰｓ中甘氨酸的含量和氨基酸的种类、数目及排列顺序的差异，推测植物的ＧＲＰｓ存在３种类型，这些ＧＲＰｓ在植物的生长发育及植物防御过程中起重要作用，已有大量的ＧＲＰ基因被分离鉴定，并对一些ＧＲＰ基因的启动子进行了分析，ＧＲＰｓ基因的表达受植物发育的调节，具有组织或器官特异性，很多ＧＲＰ基因的表达还受环境因素的影响。     

聚离子亚基化合物介导的基因转移方法可用于外源基因？…

利用聚离子亚基化合物介导的基因转移方法，研究了外源β－半乳糖苷酶报告基因的瞬时表达。结果表明，聚离子亚基化合物介导的基因转移方法可用于外源基因的瞬时表达研究。而且在相同的条件下，用该方法在ＮＩＨ３Ｔ３细胞和ＰＡ３１７细胞中对报告基因转移的效率     

生物伦理学：基因悖论

联合国教科文组织于1993年成立了国际生物伦理学委员会。该委员会成立以来最重要的一项工作就是起草1997年联合国教科文组织通过的《世界人类基因组合与人权宣言》。这是联合国成立50年来所制定的第二部宣言,目前需要获得国际社会的认可。新《宣言》认为,人类基因图的发现将会导致严重的后果:人们可以从我们的基因中查看我们的体格特征,查看我们容易患哪些遗传疾病,查看我们将来的健康发展史。人们对基因的研究将有助于推动人道主义事业的发展,但同时也危及到《宣言》中所提出的人权。根据《宣言》,人权应当在一个统一的原则下受到保护:我们有义务尊重每