一种利用微波炉加热快速提取细菌DNA用于PCR扩增的方法

利用微波加热原理,探索一种快速、简单、高效提取细菌DNA用于常规PCR快速检测的方法。在微波炉额定功率800 W条件下分别对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、单增李斯特氏菌、副溶血弧菌、沙门氏菌以及志贺氏菌6种常见食源性病原菌进行微波处理,离心取上清,获取细菌DNA,将样本DNA进行PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳进行验证。并进一步采用微波加热方法针对6种病原菌最低检出浓度和混合提取6种病原菌DNA的PCR检测进行分析。6种病原菌在微波炉中加热40-130 s的上清DNA样本均能用于常规PCR扩增。针对检出浓度的分析表明,副溶血弧菌的最低检出浓度为103 cfu/ml,金黄色葡萄球菌为104 cfu/ml,肠出血性大肠杆菌为105 cfu/ml,肠炎沙门氏菌和福氏志贺氏菌的最低检出浓度为106 cfu/ml,针对单核细胞增生李斯特氏杆菌的的最低检出浓度为107 cfu/ml。进行6种混合菌微波共提取时,其中5种病原菌的特异性基因都能扩出,并且条带很亮。该微波提取方法具有快速,简单,高效的特点,能满足大部分食源性病原菌的常规PCR检测需求,大大节约了时间和成本,具有广泛的适用性,为细菌快速分子检测提供了简便手段。     

基于单细胞凝胶电泳法的不同烷化剂导致DNA损伤的比较研究

从单细胞水平考察单官能团和双官能团烷化剂引起DNA损伤的差异.采用单细胞凝胶电泳法检测并比较单官能团烷化剂甲基亚硝基脲与双官能团烷化剂尼莫司汀在不同浓度下对DNA的损伤情况.研究结果表明药物浓度与彗星尾部DNA含量之间存在线性关系.为了检测DNA交联损伤,选择加入断裂剂作为对照,结果显示双官能团烷化剂尼莫司汀能引起显著的DNA交联.本文从细胞毒性作用和DNA损伤水平考察了烷化剂的毒性,为阐明烷化剂的致癌和抗癌机制提供理论基础.     

DNA芯片技术及其农业应用

DNA芯片（DNA chip)是生物芯片（bio-chip)的一种，它有多种同义词：基因芯片（gene chip)、DNA显微芯片（DNA microchip)、DNA陈列（DNAarray)、DNA显微陈列（DNA microarray)；另外，由于DNA芯片是一种寡核苷酸，所以也称为寡核苷酸阵列（oligonucleotide array)或寡核苷酸芯片（oligonucleotide chip)。     

DNA序列非退化的二维图形表示及其应用

提出了一种新的DNA序列的2-D图形表示方法,并证明了它的非退化性,随后结合图形表示给出DNA序列的12个正规化的ALE指标.在此基础上,结合双核苷酸计数和符号序列LZ复杂度,将DNA序列转化为一个29维的数值向量.对23个物种的β球蛋白基因和18个物种的线粒体NADH脱氢酶序列进行的系统发生分析,证明了所提方法的有效性.     

文种金鱼系统发育地位的研究

利用随机扩增多态ＤＮＡ技术，通过增加ＲＡＰＤ位点数进一步分析了文种鱼的系统发育地位。将ＲＡＰＤ扩增结果进行统计学分析。应用ＮＴＳＹＳ软件ＵＰＧＭＡ法聚类构建了金鱼主要代表品种发育的分子系统树。     

基因突变让你远离阿尔茨海默症

一项新的研究表明，有一种罕见的基因突变，它能够依靠改变遗传密码的单个字母令人们免受使记忆丧失的痴呆症——阿尔茨海默症（老年痴呆症）的困扰。此类患者大脑内部斑块上存积了一种蛋白质片段，学名为β-淀粉样蛋白，而DNA的改变能够抑制这种淀粉状蛋白的增长。     

聚乙二醇修饰多壁碳纳米管对质粒DNA的影响

利用体外评价方法(plasmid DNAassay)和原子力显微镜(atomic force microscopy,AFM)直接观测相结合,研究原始多壁碳纳米管(multi-walled carbon nanotubes,MWNTs)、纯化后的MWNTs以及聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)修饰的MWNTs与DNA的相互作用.结果表明:原始MWNTs对质粒的损伤较为严重;纯化后的MWNTs对质粒的损伤有所减弱;而经PEG修饰的MWNTs对质粒的损伤非常小,表现出良好的生物相容性.     

DNA机器人

或许未来数十年后，成群的DNA机器人能够用来探寻人体病变的信号。 在纽约某个化学实验室的高脚杯里，有只“蜘蛛”正在利用“折纸工艺”铺筑的“轨道”上蹒跚前行。此“蜘蛛”其实是用DNA——即指挥合成蛋白质的双螺旋链条“编写”而成的微型机器人。     

Differentiation and adaptation epigenetic networks: Translational research in gastric carcinogenesis

There are several kinds of epigenetic networks in the human body including the cell differentiation epigenetic network(DiEN) and the host adaptation epigenetic network(AdEN).DiEN networks are static and cell/tissue-specific.AdEN networks are variable and dependent upon environmental factors.DiEN and AdEN alterations can respectively serve as biomarkers for different kinds of diseases.Cancer is a consequence of accumulated pathophysiological adaptations of tissue stem cells to exposure of environmental carcinogens.Cancer cells are de-differentiated cells that obtain the capacity of unrestricted proliferation,local invasion,and distant migration/metastasis.Both DiEN and AdEN changes can be observed in cancer tissues.Alterations of DNA methylation are the most stable epigenetic modifications and can be sensitively detected in a small cell population.These advantages make DNA methylation the optimal biomarkers for detection of initiated cells in precancerous lesions and metastasis stem cells in cancer tissues.It has been proven that p16 methylation can be used as a diagnostic biomarker to determine malignant potential of epithelium dysplasia in many organs including the stomach.In a large-scale validation study on the DNA methylome of gastric carcinomas(GC),the methylation status of more than 90 CpG islands has been analyzed by DHPLC.Furthermore,GFRA1 demethylation and methylation of SRF and ZNF382 are frequent events during gastric carcinogenesis and consistently correlate to GC metastasis and overall survival of GC patients from China,Japan,and Korea,respectively.In a population study,it has been demonstrated that gradual increasing of plasma miR-211 and other miRNA levels may be an early risk predictor for GC development.