基于质谱技术的计算蛋白质组学研究

蛋白质组是继人类基因组计划完成之后又一新兴的生命科学研究对象，蛋白质组学研究细胞或组织内所有表达的蛋白质．生物质谱技术已为蛋白质组学研究产生了大规模的质谱数据；而如何从这些数据中提取和发现有关蛋白质组的重要生物学知识为计算蛋白质组学的研究提出了重大需求，如蛋白质鉴定、翻译后修饰、定量分析，以及疾病模式的发现等．本文研究了如何应用计算技术来解决蛋白质组学研究中质谱信息处理的这几个关键问题．     

Construction and anti-tumor effects of recombinant fowlpox virus expressing Newcastle disease virus hemagglutinin-neuramidinase gene

Hemagglutinin-neuramidinase (HN), a Newcastle disease virus-derived protein, not only mediates receptor recognition but also possesses neuraminidase (NA) activity, the ability to cleave a component of those receptors, N-acetylneuraminic acid (NAcneu, sialic acid). It is known that this protein in mammalian species, including human beings, has interesting anti-neoplastic as well as immune stimulating properties. To explore the use of the HN gene in cancer gene therapy, we constructed a recombi-nant fowlpox virus expressing the HN protein (vFV-HN) and compared the anti-tumor activity of the recombinant virus with that of wild-type fowlpox virus (FPV) in vivo and in vitro. Here we found that although B16 cells were somewhat resistant to the basal cytotoxic effect of wild-type fowlpox virus, infection with vFV-HN caused a pronounced cytotoxic effect and, the survival of tumor-bearing mice immunized with vFV-HN was significantly increased compared with the survival of mice immunized with the FPV alone. Furthermore, the immunization of mice with vFV-HN elicited a B16 tumor-specific cytotoxic T lymphocyte (CTL) response and clonal expansion of both CD4 and CD8 T cell populations in vivo. In addition, T cells from lymph nodes of mice vaccinated with vFV-HN secreted high levels of the Th1 cytokine IL-2 and IFN-γ, indicating that the regression of tumor cells is related to a Th1-type dominant immune response. These results demonstrate that vaccination with vFV-HN may be a potential strategy for cancer gene therapy.     

锌试剂-蛋白质体系的共振光散射光谱研究

 在pH 3.0的B-R缓冲溶液中,锌试剂能与蛋白质结合形成复合物.此结合反应能显著加强锌试剂的瑞利光散射信号.详细研究了此结合反应的最佳反应条件,并以此反应为基础,利用共振瑞利散射光技术,建立了一个测定蛋白质的新方法.该方法对牛血清白蛋白(BSA)、人血清白蛋白(HSA)以及免疫球蛋白测定的线性范围分别为0.25~12.5,0.10~15.0μg/mL和0.10~12.5μg/mL,检出限均小于0.05μg/mL,且大量的常见金属离子、氨基酸等共存物质不干扰测定.方法具有很高的灵敏度、很好的选择性及重现性.用于血清样品中蛋白质的测定,结果满意.     

蛋白质相互作用的研究方法及进展

介绍了蛋白质与蛋白质相互作用的研究方法及进展,包括已经应用的标准技术、物理学方法、最新进展及其他方法.利用蛋白质间相互作用为工具,通过合成可调控转录系统来调整生物系统,可实现对基因功能的微调.     

点带石斑鱼人工配合饵料中蛋白质适宜含量的研究

设置4组配合饵料蛋白含量分别为48.23%、51.43%、54.09%和56.22%的试验组研究点带石斑鱼人工配合饵料中蛋白质的适宜含量.经过40 d的试验,得出饵料蛋白含量为51.43%的试验组的日均增重量为0.93±0.06 g.d-1、特定生长率为3.72%±0.12%d-1、饵料系数为0.54±0.01,蛋白质效率为363.0%±3.8%,均为最佳.经回归分析,点带石斑鱼人工配合饵料中蛋白质适宜含量为52.1%.     

Offlattice Model in the Prediction of Protein 3D Structure

3-dimension HPNX offiattice model is developed from the 2-dimension HP offiattice model. In the HP model, 20 types of amino acid monomers are divided into two classes, H （non-polar monomer） and P （polar monomer）. In the HPNX model, polar monomers are split into positively charged （P）, negatively charged （N） and neutral （X） monomers. A new evolutionary algorithm is applied to study long chains of the HPNX offiattice protein model. This method successfully predict the structures of several proteins in the 3-dimension space that are similar to the structures gotten by X-Ray Crystallography and NMR and published in the PDB（Protein Data Bank）.     

生料酿酒过程中导致产品味苦的若干因素初探

生料酿酒是上世纪 80年代后期从日本传入的。由于这个技术操作简单 ,投资少 ,酒质好 ,深受广大厂家和消费者的喜爱。但也存在着很多不足 ,尤其是酒中的苦 (涩 )味物质一直是困扰广大厂家的难题。本文着重阐述酒中苦 (涩 )物质的产生原因 ,并对苦味物质的控制进行了初步研究     

蛋白质光谱探针研究进展

蛋白质分析是生命科学研究中的重要课题。蛋白质内源紫外吸收光谱和荧光光谱可以用于蛋白质分析，但其灵敏度不能满足微量分析的要求。蛋白质光谱探针（包括金属离子、有机试剂和金属络合物）能够与蛋白质相互作用生成超分子复合物并引起体系光谱信号的变化，由此可以提供蛋白质含量或结构方面的信息。根据光分析方法的不同，蛋白质光谱探针可以分为吸光探针、荧光探针和光散射探针3类。本文中，笔者综述了蛋白质光谱探针的研究进展，讨论了发展趋势。     

虎纹捕鸟蛛毒素HWTX -Ⅰ和芋螺毒素MVIIA嵌合体的固相化学合成

采用Fmoc固相合成的方法,将来自芋螺的ω-芋螺毒素(ω-Conotoxin) MVIIA (N-型钙离子通道阻断剂)中已知活性位点及可能的相关序列嵌入虎纹捕鸟蛛毒素-Ⅰ(HWTX -Ⅰ) 的非活性位点区,代替其相应序列,构建同时携带两种活性位点的多肽嵌合体.嵌合体用 MALDI-TOF质谱鉴定.通过RP-HPLC检测其氧化复性过程,摸索出嵌合体的最佳复性条件.经过两次RP-HPLC脱盐纯化.结果表明,设计合成的嵌合体在1×10-5g/mL,利用小鼠隔神经-隔肌标本的阻断实验证明嵌合体显示了27 %的天然HWTX-Ⅰ的神经毒活性.实验结果表明,HWTX -Ⅰ具有蛋白质工程改造前景.     

6种淡水腹足类足肌蛋白质的比较研究

以隶属于软体动物门、腹足纲、中腹足目、Jiao蚴科的大沼螺、纹沼螺、长度涵螺、光滑狭口蚴为研究对象，以田螺科的梨形环棱螺、黑螺科方格短沟蜷作为对照，用凝胶电泳方法对上述动物进行了足肌蛋白质的比较研究。结果显示腹足类的足肌蛋白质不但具有种内稳定、种间差异显著的特性，而且电泳谱带的差异程度能够反映出物种的遗传特性和相互的亲缘关系。其中以主要区带的数量、Rm值含量最为明显。通过数值聚类分析后显示，大沼螺、纹沼螺、长角涵螺之间的亲缘关系较近，而光滑狭口螺与上述3个种的亲缘关系较远，其分类地位与梨形环棱螺和方格短沟蜷类似。实验结果与修订后的中腹足目科级分类方案相当吻合。