PCR技术在分子生物学中的应用

ＰＣＲ方法，即聚合酶链式反应，又称体外基因倍增，它在分子生物学中有着广泛的应用。文中主要讨论了ＰＣＲ技术在辅助构建跳跃及连锁文库，染色体走步，基因修饰，重组ＰＣＲ，足迹法，进行克隆和亚克隆诸方面的应用。     

应用PCR-斑点杂交方法进行β地中海贫血产前基因诊断

从１９８９年以来，我们应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）和等位基因特异寡核苷酸斑点杂交（ＡＳＯ－ｄｏｔ－ｂｌｏｔｔｉｎｇ）技术对６０例β地中海贫血高危胎儿进行产前基因诊断。结果查出β地中海贫血纯合子６例、双重杂合子８例、杂合子２７例．其余１９例为正常胎儿。ＰＣＲ－ｄｏｔ－ｂｌｏｔｔｉｎｇ方法准确可靠，尤其适合于β地中海贫血的产前诊断。     

高灵敏度巢式PCR方法扩增HBV全长基因组

探讨一种用于乙型肝炎病毒(HBV)基因组扩增的灵敏度高、广谱性好的巢式聚合酶链式反应(nested PCR)方法,适用于较低病毒拷贝数标本的HBV DNA扩增.通过设计两套通用巢式引物,实现对各基因型(A,B,C,D,E,G)HBV均具有较高的扩增效率;采用两步法分段扩增HBV基因组,对两段目的产物进行测序拼接获得HBV的全基因序列.应用本方法对4组病毒拷贝量(IU/mL)分别为:>1.0×104,1.0×103~1.0×104,2.0×102~1.0×103,<2.0×102的100份血清标本进行全长基因组扩增,其中75份获得阳性结果,各组阳性率依次为:100%,66.7%,60%,25%,有效扩增灵敏度为2.0×102~1.0×103IU/mL;而一步法只在病毒拷贝量>1.0×104IU/mL的标本组中获得15份阳性结果,总的阳性率仅为15%,说明该方法扩增灵敏度明显高于一步法.因此,本方法为HBV流行病学调查研究HBV基因组序列提供了更高的灵敏度,可在流行病学调查中发挥重要作用.     

PDGF-D对人胃癌细胞株SGC7901的作用

目的:探讨血小板衍生生长因子-D(PDGF-D)及其受体PDGFRβmRNA在人胃癌细胞株SGC7901中的表达及其意义.方法:用RT-PCR方法检测人胃癌细胞株SGC7901中PDGF-D及PDGFRβmRNA的表达,将人重组PDGF-D蛋白分别以0、20、50、100、500、2 500、25 000、250 00...     

Bombyx mori bidensovirus: The type species of the new genus Bidensovirus in the new family Bidnaviridae

Bombyx mori bidensovirus （BmBDV）, which had been assigned to Densovirinae in Parvoviridae previously, replicates mainly in silkworm midgut columnar cells and causes the fatal flacheric disease. In contrast to parvovirus, this virus possesses two single-stranded DNA genome segments and encodes a putative protein-primed DNA polymerase. The accumulating evidence sug- gests that it has unique characteristics different to parvovirus and adopts its own mechanisms for replication. So far, little is known about the replication mechanisms of BmBDV. In this review, we focus on the pathology associated with this virus and the viral biology such as viral genome structure, viral genes, and viral replication and expression strategies.     

用微分方程组的解析解拟合甲型流感病毒聚合酶酸性蛋白家族的进化过程(英文)

用数学模型对甲型流感病毒聚合酶酸性蛋白家族的进化进行拟合:(1)用氨基酸对的可预测性量化1918年至2008年分离的2433个聚合酶酸性蛋白以表示其演变,(2)确定上升半寿期和下降半衰期是否相似作为拟合的前提条件,(3)用微分方程组的解析解拟合进化,(4)用所获得的拟合参数模拟2009年至2018年可能的进化过程。结果呈现了对聚合酶酸性蛋白家族及其不同亚型的良好拟合,这标志着蛋白质进化的研究已经从经验性的实验分析向动力学的数学建模迈进。     

PCR-DGGE在真菌群落研究中的应用解析

论述了变性梯度凝胶电泳(DGGE)在真菌群落结构研究中的技术应用的主要步骤:从样品中直接提取真菌DNA,选取5′端含GC夹的特异性引物对18S rDNA或IST序列等的部分片段进行扩增,得到合适的目的DNA片段,并在变性梯度的聚丙烯酰胺凝胶中进行电泳,使不同来源的真菌DNA片段有效分离,再进行各种分类分析。     

耐热酿酒酵母海藻糖代谢途径对热胁迫的响应

为深入探讨酵母的热响应机制,测定了热胁迫条件下耐热酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中海藻糖含量的变化,并通过实时定量聚合酶链式反应,分析了热胁迫下参与海藻糖代谢的相关基因的表达.结果表明:在42℃热胁迫下,酿酒酵母细胞内的海藻糖含量显著提高,在处理240min时达到0.20g/g(以细胞干重计),约为热胁迫前的4倍;随着胁迫时间的增加,胞内海藻糖的含量开始下降。参与海藻糖代谢的基因表达变化与海藻糖含量变化高度一致,说明海藻糖在酵母适应高温的过程中起重要作用.     

一种基于Propidium Monoazide与PCR结合的选择性检测细菌活细胞的方法

建立了一种PMA与PCR结合的细菌活细胞检测的方法,可有效抑制微生物死细胞DNA的PCR扩增,从而排除死细胞对微生物活细胞检测的影响．结果表明,PMA浓度大于3 μg/ml时可抑制死细胞DNA的PCR扩增,PMA浓度高达50 μg/ml时仍不影响活细胞DNA的PCR扩增;并且得出曝光时间大于3 min可使PMA与死细胞DNA分子共价交联,抑制其PCR扩增;浊度影响PMA交联的结果表明浊度小于10 NTU时,PMA仍能有效地抑制死细胞DNA的PCR扩增,而当浊度大于100 NTU时,PMA失去效果．