Finding finer functions for partially characterized proteins by protein-protein interaction networks

Based on high-throughput data, numerous algorithms have been designed to find functions of novel proteins. However, the effectiveness of such algorithms is currently limited by some fundamental factors, including (1) the low a-priori probability of novel proteins participating in a detailed function; (2) the huge false data present in high-throughput datasets; (3) the incomplete data coverage of functional classes; (4) the abundant but heterogeneous negative samples for training the algorithms; and (5) the lack of detailed functional knowledge for training algorithms. Here, for partially characterized proteins, we suggest an approach to finding their finer functions based on protein interaction sub-networks or gene expression patterns, defined in function-specific subspaces. The proposed approach can lessen the above-mentioned problems by properly defining the prediction range and functionally filtering the noisy data, and thus can efficiently find proteins’ novel functions. For thousands of yeast and human proteins partially characterized, it is able to reliably find their finer functions (e.g., the translational functions) with more than 90% precision. The predicted finer functions are highly valuable both for guiding the follow-up wet-lab validation and for providing the necessary data for training algorithms to learn other proteins.     

ZnWo4：Cr^3＋的吸收光谱研究

本文通过对ZnWo4:Cr^3 晶体的光学吸收谱的观测资料^[1]的分析，假定Cr^3 杂质的有效晶场的八面体结构的变形后的D4晶场。采用Oh点群表象准对角型简化强场方案，导出了d^3-D4强场能量矩阵。首次计算了ZnWo4:Cr^3 的自旋允许谱精细结构。理论计算结果与实验吻合较好。     

大尺寸充气体黑洞中激光等离子体相互作用

本文是根据Ｒ．Ｅ特内、Ｒ．Ｌ考夫曼等人之作编译而成。大尺寸充气体黑洞具有类似于国家点火装置（ＮＩＦ），所预期的等离子体条件，可用来测量受激布里渊散射（ＳＢＳ）。上述等离子体是热的（３ｋｅＶ），电子密度高，处于似稳态，而在大于２ｍｍ长度上是均匀的。另外，还介绍了类似的ＮＩＦ照射条件，低ＳＢＳ背光的观测。     

论疏水相互作用的生物学意义

本文用热力学和非平衡态热力学观点探讨了疏水相互作用的本质及特征，进而阐明其重要的生物学意义：维系生命系统结构、驱动有序化过程．     

土壤矿物-有机物-微生物相互作用及其环境效应

由国际土壤学联合会及国际理论与应用化学联合会发起的第4届土壤矿物-有机物-微生物相互作用国际学术研讨会于2004年9月20～23日在武汉华中农业大学举行。有来自世界31个国家和地区的土壤、环境、化学及微生物科学专家共150人参会，国际土壤学联合会第二部门主席、国际理论与应用化学联合会代表N.Senesi先生、国际土壤学联合会土壤界面专业委员会负责人黄盘铭先生、国际禁化武组织代表John Makhubalo 先生等世界著名的专家也出席会议。会议共发表116篇论文。     

Petri网系统的可达性分析

对Petri网系统的可达性问题做了综合性的阐述和分析, 提出了利用能量优化方法来解决可达性问题的方法, 并在此基础上结合计算代数方法和神经计算模型对可达性问题做了进一步的研究. 主要工作包括 1.给出了Petri网到线性空间的映射规则及其可达性的等价性定理; 2.建立了能量优化模型, 将可达性判断化为优化问题; 3.用神经网络来求解能量优化模型; 4. 最后综合了计算代数方法和能量优化模型的优点给出一个基于计算代数和神经计算的方法. 作者提出了一种利用基于硬件的大规模并行的神经计算来代替基于软件的串行的数字计算的可达性判断的解决方案.     

基于二分法迭代的频谱感知节能优化策略

针对认知无线电(CR)系统中频谱感知技术能量效率低的问题,提出了一种基于二分法迭代寻优的联合优化算法。该算法通过联合传输功率与感知时隙进行优化,最大化地提高了CR系统的能量效率,并且在针对优化参数ξ的寻优过程中,使用了二分法与迭代算法结合的寻优方法。通过理论分析,与其他类似算法相比,该算法的寻优速度更快,算法复杂度更低,函数收敛速度更快,实际应用的可扩展性更强。数值仿真分析结果表明,在保证检测性能的前提下,提出的算法能够很好地解决能效的最优化问题,在恒定检测概率Pd=0.9和Pd=0.7条件下,所提出算法的能耗开销均低于其他算法,在系统吞吐量中所提出算法均优于其他算法,为CR系统的发展提供了理论支撑,更加符合未来CR系统的节能发展方向。     

探寻银河中心的神秘天体

灿烂夺目的太阳位于太阳系的中心，支配着太阳系的命运、给诸行星以生机乃至生命。然而，它只是庞大的银河系中毫不起眼的一颗恒星。那么，位于银河系中心的又是个怎样的天体呢？85年前，人类终于认识到太阳并不位于银河系中心，从而揭开了孜孜不倦的寻找银心天体的百年史。     

地基基础-坝体体系动力特性及地震反应分析的有限元与无限元耦合法

编制了有限元及有限元—无限元耦合计算程序，利用其分析了广西源口拱坝在有限域及无限域地基下的动力特性与动力响应，并与常规刚性地基下坝体的动力特性、动力响应进行比较，得出结论：1．弹性地基下拱坝自振频率减小、动位移最大值增大；2．耦合分析法具有较高的精度和显著的经济性，是工程应用中值得推广的一种分析方法。     

两步法磷酸生产余热回收改造及热经济学分析

中国磷酸生产过程中的热浪费和热污染问题非常严重。解决这一问题将带来巨大的经济效益和社会效益。该文分别从能和可用能两个角度对一种新的燃烧水合两步法制取磷酸系统的余热回收改造方案进行分析,得到了改造前后整个系统的能流分布和可用能流分布,以及各个环节的能效率和可用能效率,并使用热经济学分析的方法,结合环境政策和资源占有对改造前后的多元产品系统进行可用能成本折算和分析。结果表明这种余热回收改造方案在经济效益、环境保护和节约资源3个方面具有明显的优越性。