一种考虑蛋白质柔性的分子对接方法

分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的一种重要方法,为此建立了基于诱导契合的分子对接优化模型.模型中引入残基基团的概念,将蛋白质划分成若干个残基基团,通过这些残基基团的运动近似表征整个蛋白质的运动情况,并将配体小分子的运动处理为平移、转动和柔性键旋转三部分分量.设计了一个将k-均值聚类和遗传算法相结合的快速迭代格式,并采用多种群遗传策略和信息熵控制的空间减缩搜索技术加速了分子对接设计中的遗传演化进程.在此基础上,开发了一种考虑蛋白质柔性的对接程序FkxGAsDock.数值试验表明,该程序较好地平衡了效率与精度之间的关系,取得了满意的对接结果.     

甘肃省藓类植物新纪录

报道了分布于白龙江流域的甘肃省藓类植物的1个新纪录科,8个新纪录属和66个新纪录种．新纪录科是四齿藓科（Tetraphidaceae）,新纪录属是白氏藓属（Brothera）,圆口藓属（Cyroweisia）,异蒴藓属（Lyellia）,拟白发藓属（Paraleucobryum）,平珠藓属（Plagiopus）,锯齿藓属（Prionidium）,扭毛藓属（Streblotrichum）和四齿藓属（Tetraphis）,新纪录种为白氏藓（Brotheraleana）,短颈圆口藓（Gyroweisia brevicoulis）,宽果异蒴藓（Lyellia platycarpa）,拟白发藓（Paraleucobryum enerve）和长叶拟白发藓（P．longifolium）等．     

流域汇流的等流时单位线方法初探

由于等流时线方法的固有缺陷,它计算出的流量过程线难以达到需要的精度.本文使用分布式瞬时单位线的思想来改进等流时线方法,将产流场和传播场结合起来,使用纳什线性水库模型为每一个等流时面积建立各自的单位线,以描述河槽调蓄对径流的作用,弥补了等流时线法的缺陷.同时它利用一组线性水库之间的相似关系,缩减建立单位线所需的参数,继而建立等流时单位线.该方法可以便于根据流域下垫面特性和径流进行参数调节,最后找到适合该流域的参数.等流时单位线方法用于白溪流域五场洪水的实际计算结果说明,它可以较好地综合等流时线法和单位线法的优势,改进计算的精度.等流时单位线法是等流时线法和单位线法的有效结合,方法中各参数能够较容易地与实际物理模型相联系,更有利于应用在缺乏资料的流域.     

基于指标体系的流域水安全诊断评价模型

 为在随机、模糊、经验等不确定性环境下定量评价流域水安全系统的总体状况,识别使流域水安全系统或其子系统处于不安全的主要指标,在流域水安全的理论分析、专家咨询和调研基础上建立了流域水安全诊断评价指标体系和评价等级标准,提出用基于加速遗传算法的模糊层次分析法筛选指标、确定水安全评价系统中各指标和子系统的权重,用集对分析方法构造流域水安全评价指标样本值隶属于可变模糊集“水安全诊断评价标准等级”的相对隶属度函数,建立了流域水安全诊断评价模型（SPA-DAM）。SPA-DAM在巢湖流域水安全诊断评价中的结果说明：流域近7a来水安全等级值均处于临界安全附近,虽存在缓慢改善的趋势,但由于水资源安全和水灾害防治安全程度不高、波动性大,水环境安全和社会经济安全程度不高、改善缓慢,因此总体上该流域的水安全形势不容乐观;合理调控水资源利用率、人均水资源量、单位面积化肥施用量、环保投资占GDP比例、单位面积蓄水工程总库容、水利工程投资占GDP比例、区域开发指数、人口密度和科技教育投入占GDP比例等关键指标,是提高该流域水安全保障程度的重要措施。SPA-DAM的评价结果可靠合理,方法简便实用,在已知等级评价标准的多层次系统诊断评价问题中具有一定的应用价值。     

多线程可动态演化程序的设计

为满足软件系统24/7/365不中断运行的需求,提出了对运行中的软件进行动态演化的要求.分析了软件演化的基本种类,叙述了多线程可动态演化软件的演化步骤,并对该类程序设计中涉及到的一些关键问题展开讨论.最后以数据集成软件为例分析了多线程可动态演化程序实例的运行状况.     

广东省兴宁市小水电发展历程

兴宁市位于中国广东省东北部兴宁盆地,地跨东经115°30’～116°,北纬23°50’～24°37’,全市面积2105km^2,人口113万多人。是中国最具代表性的客家城市之一。 兴宁市北部的罗浮镇属东江流域,镇内河溪均流入东江上游的渡田河。其余的镇属韩江流域,镇内46条河溪水流入韩江上游的梅江。     

基于迁徙策略的PSO集成及其在序列模体识别中的应用

对优化问题和游牧民族迁徙行为的比较研究表明,两者存在相似之处,文中模拟了游牧民族迁徙机制,提出了一种迁徙策略,并且与粒子群优化算法相结合,提高了算法摆脱局部极值的能力,通过集成技术,充分发挥各种粒子群优化算法的优点,实现协同演化,提高了算法的全局搜索能力。最后应用于求解计算分子生物学中的一个复杂问题——生物序列模体识别,实验表明,该算法是有效的。     

浙江省生态足迹与万元GDP能耗演化分析

改革开放后,浙江长期坚持以市场化为导向的经济社会体制改革,造就了经济大省的浙江地位。“八五”、“九五”、“十五”连续15年的经济快速增长以及经济一生态协调发展的“浙江模式”令人关注。但15年间浙江的生态足迹与生态承载力状况究竟发生了怎样的变化,以及“十一五”期间浙江经济能否持续发展,引起了人们的广泛关注。     

软件体系结构演化模型

近几年来,软件体系结构(Software Architecture, SA)已成为软件研究的热点之一.它作为软件的蓝图,为人们宏观把握软件的整体结构和软件演化提供了一条有效的途径.文章从宏观层面入手,以软件体系结构作为软件的支撑,讲述了软件演化及其两个方面:动态演化和静态演化.     

西藏定日贡扎上白垩统的年代地层划分及评述

分别采用不同的地层学方法对西藏贡扎地区的两条相邻上白垩统剖面进行了年代地层划分.根据将建立在贡扎Ⅰ上白垩统剖面上的锶同位素演化曲线与W. H .Burke等的同时代锶同位素演化曲线对比,剖面上岗巴村口组顶界年龄值约为81.4 Ma;根据在贡扎Ⅱ剖面上划分出的12个浮游有孔虫化石带确定的岗巴村口组顶界年龄值约为67.0 Ma.作者认为岗巴村口组顶界年龄值存在明显差别是受诸多因素影响,在对地层进行年代地层研究中,要不断提高各种地层学方法的分辨率,并尽可能采用综合的地层学方法.