PCR-DGGE分析湿地植物根际土壤细菌群落实验条件优化

为了更好地利用PCR-DGGE技术分析湿地植物根际土壤样品的细菌多样性,选取3对通用引物,优化了PCR扩增16SrDNA的实验条件,并优化了DGGE的变性剂浓度梯度范围和电泳时间长度.结果显示：PCR时采用退火温度touch-down程序,能够提高扩增特异性.引物357f/518r和357f/907rM扩增靶序列的DGGE变性剂浓度梯度理想范围分别为50%～80%和40%～70%,最佳电泳时间长度分别为17h和14h.比较DGGE分析图谱的条带数以及Shannon多样性指数,357f/518r呈现的结果最好,357f/907rM次之.运用引物357f/518r和357f/907rM扩增靶序列的DGGE分析,能更全面地反映湿地植物根际土壤样品的细菌多样性.     

新疆阿苇滩水库浮游植物群落生态特征

 阿苇滩水库位于新疆阿勒泰地区,是额尔齐斯河上游的引水注入式水库,在当地水产养殖发展中占有重要地位。为了解其渔业生物资源现状,于2008年7月（平水期）、10月（枯水期）和2009年5月（丰水期）,在阿苇滩水库设置3个断面进行浮游植物研究。共采集到浮游植物8门99种（属）,其中优势种8种,分别为小形色球藻（Chroococcus minor）、广源小环藻（Cyllotella bodanica）、尖针杆藻（Synedra acus）、浮球藻（Planktosphaeria gelotinosa）、膨胀四角藻（Tetra?觕dron tumidulum）、四尾栅藻（Scenedesmus quadricauda）、韦氏藻（Westlla botryoides）和小球藻（Chlorella vulgaris）。水库浮游植物细胞密度变化趋势明显,平水期（6.88±1.07×106ind/L）>枯水期（3.66±0.45×106ind/L）>丰水期（0.97±0.23×106ind/L）。结果显示,库区水温和水容量变化是影响水体浮游植物种类组成、密度和多样性指数变化的主要因素。     

连续式白腐真菌膜生物反应器处理染料废水: 微生物群落结构及其与脱色效率的关系

通过PCR-DGGE( 变性浓度梯度凝胶电泳) 分析评价了连续运行100 天的白腐真菌膜生物反应器中群落结构的变化, 并研究了群落结构与染料脱色效率之间的耦联关系, 且通过多维尺度(MDS) 方法对 DGGE 电泳图谱进行分析, 以二维图形向量的方式显示。结果表明, 通过对系统内优势菌种的 18S rDNA 序列进行测定, 并通过NCBI(美国国立生物技术信息中心) 基因库比对确定的菌种 Phanerochaete chrysosporium ( P. chrysosporium) 在运行期间始终是微生物群落的优势种, 随着系统运行时间的延长, 其优势愈加 明显, 但反应器 中微生物群落结构 Shannon-Wiener 多样性指数却逐渐降低, 由起始阶段的 1. 92 降至最终的 0. 92 。对 DGGE 条带进行 MDS 分析得知, 反应器在运行阶段基本稳定维持处在一个区域, 表明其微生物群落结构在运行期间较为稳定, 且该反应器对染料废水始终具有良好的脱色效果, 平均脱色率为82.5% , 最高时可达93.2%。     

垃圾渗滤液处理系统中微生物群落结构变化研究

采用基于PCR的变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE) 和 real-time PCR 方法, 分析了深圳市某垃圾渗滤液处理系统中总细菌和硝化细菌的生物量及群落结构变化, 探究生物量与水质变化间的关系及环境因素对微生物群落结构的影响。结果表明, 该垃圾渗滤液处理系统具有很好的氨氮和总有机碳(TOC) 去除效果, 总去除率分别为 99.9% 和 91.4% 。在垃圾渗滤液处理系统中, 总细菌、氨氧化菌(AOB) 、亚硝酸盐氧化菌(NOB) 的生物量与 TOC 及氨氮浓度没有显著相关性(p > 0. 05); 溶解氧不影响AOB 生物量, 但明显影响NOB 生物量。微生物群落结构及多维尺度(DMS) 分析表明:在该废水处理系统中, DO浓度对总细菌和 NOB 微生物群落结构有重要影响; 而氨氮浓度是影响 AOB 群落结构的关键因素。     

五龙河自然保护区鸟类群落夏秋食性特征分析

2005年11月至2006年9月,对湖北五龙河自然保护区的鸟类群落进行了调查,并对夏秋两季的鸟类食性集团作了聚类分析。结果表明:该区记录鸟类82种;其中夏季50种,秋季51种。该区夏秋季的鸟类群落均以虫食性鸟类为主,且均为24种。夏季取食集团的第1类群是山地灌木林取食集团,由银喉长尾山雀、红头长尾山雀、暗绿绣眼鸟、棕颈钩嘴鹛组成;秋季取食集团的第1类群为河滩灌木丛取食集团,由灰鹡鸰、淡眉柳莺、褐柳莺、暗绿绣眼鸟、黄喉鹀、喜鹊组成。     

太原义井工业区土壤动物群落的多样性

通过对太原义井工业区污染农田土壤动物调查,共获得土壤动物5473个,隶属4门7纲.调查显示,土壤动物群落的组成与数量随污染程度的加重而减少,土壤动物密度也呈同样的变化趋势.在重污染土壤动物中,优势类群与常见类群的种类明显减少.结果表明:重金属污染对土壤动物群落结构的影响是随着污染的加重,多样性指数和密度类群指数都有减少趋势,但均匀度指数变化不明显.受到重金属污染的农田土壤动物的表聚性减弱,甚至出现逆分布现象.     

涪陵区春季鸟类群落及其对于区域生态保护的意义

按照生境特征分为水域、次生林、居民点和农田4种鸟类群落,于2006-2008年采用样线法对涪陵区春季鸟类进行了调查.结果表明,春季共记录到鸟类96种,重要值高的鸟类(200≤IV≤300)4种,广布型鸟类38种.次生林鸟类群落的物种数和Shannon-Wiener指数均最高;水域、水域-农田、次生林-居民点鸟类群落的均匀性指数(Pielou指数)、Jaccard相似性指数、Co-sine相似性指数分别最高.农业生产结构的不合理性和工业污染是影响涪陵区鸟类的主要因素,提倡执行"天然林保护工程".     

古尔班通古特沙漠南缘媒介蜱群落分析

为明确目前古尔班通古特沙漠南缘媒介蜱的流行情况和分布规律,对该地区11个生境点的考查分析。结果显示,获得的2776枚媒介蜱,隶属4属11种,初步确定了莫索湾沙漠区、克拉玛依干旱区、安集海农垦区和精河平原牧场媒介蜱的种群落组成和区域分布,并对其群落结构进行了相关分析,同时确定了在古尔班通古特沙漠区媒介蜱的优势物种为残缘璃眼蜱(Hyalomama detritum detritum)、亚洲璃眼蜱(Hyalomama asiaticum asiaticum)、亚东璃眼蜱(Hyalomama asiaticam)、盾糙璃眼蜱(Hyalomama scuperse);在农垦区和平原牧场地段内则以银盾革蜱(Dermacentor niveus)、残缘璃眼蜱、亚洲璃眼蜱、亚东璃眼蜱、盾糙璃眼蜱为优势蜱种。     

浙江秀山岛潮间带大型底栖动物群落组成及其生物多样性

2008年6-10月对浙江秀山岛潮间带大型底栖动物进行了调查,共采集到大型底栖动物51种,隶属于4门、7纲、33科、41属。其中,软体动物19种,占37.26%;甲壳动物28种,占54.90%;多毛类3种,占5.88%;其他无脊椎动物只有海葵1种,占1.96%。潮间带大型底栖动物的生物量大小比较:九子沙滩(47.99g/m2)滑泥公园(32.23g/m2)海岙码头(7.78g/m2)兰山码头(5.34g/m2),而物种多样性(H')大小依次为滑泥公园(2.98)、九子沙滩(2.78)、海岙码头(1.55)、兰山码头(1.34)。研究认为秀山岛潮间带湿地越来越多用于旅游开发和临港工业建设可能是大型底栖动物物种多样性较低的主要原因,且临港工业建设对潮间带大型底栖动物群落结构的影响比用于旅游开发所产生的影响大,特别是物种数减少较明显。     

PCR-DGGE解析好氧-沉淀-厌氧工艺微生物群落多样性

为研究好氧-沉淀-厌氧(OSA)污泥减量工艺微生物群落结构和多样性,以及运行条件对微生物群落的影响,使用16S rDNA的PCR-DG-DGGE图谱分析方法结合条带割胶回收DNA序列比对,对OSA工艺微生物群落特征进行分析。DG-DGGE图谱聚类分析和多样性指数分析表明,OSA工艺微生物群落多样性比传统活性污泥工艺更加丰富。增加Ns和提高废水水质的复杂性,都能使Shannon指数略有提高,微生物多样性增加,但优势微生物种群基本不受影响。DG-DGGE图谱中优势条带序列分析表明,OSA工艺中的回收到的11个优势菌与α-proteobacte-ria,β-proteobacteria,CFB-group bacteria种属的微生物有很近的亲缘关系,β-proteobacteria约占63.6%。其中6个优势菌与强化生物除磷系统、反硝化系统中出现的微生物同源性非常高,证实了在OSA系统中存在的慢速生长微生物-反硝化菌和聚磷菌。