还是定名为“朊病毒”好

1996年笔者在英国访问期问,英国爆发了疯牛病,这使人们对疯牛病的病原体prion产生了广泛的关注,其中也包括prion的中文定名。为此,笔者曾在《生命的化学》1997年第4期上写了一篇短文《建议将Prion译为朊病毒》,文中简要地叙述了建议的依据和理由。也就是在那年,布鲁西纳（Prusiner）因发现prion而获得1997年的诺贝尔生理学或医学奖。实际上,     

基于距离最大熵值的蛋白质结构域边界检测系统

首次将蛋白质结构域边界检测问题归结为非平衡数据学习问题, 提出一种新的欠采样方法, 即在支持向量机特征空间中对与正类样本具有距离最大熵值的负类样本进行采样. 以经过筛选的蛋白质结构域数据库作为实验数据, 支持向量机学习系统的平均预测准确率可达80%, 同时具有较高的敏感性和特异性.     

哺乳动物Gpx 基因家族进化选择和功能分歧研究 (动物科学)

研究哺乳动物谷胱甘肽过氧化物酶基因家族(Gpx)的亲缘关系和进化选择压力性质。从NCBI等网站获取哺乳动物Gpx基因编码区核酸序列和GPX蛋白氨基酸序列,并用MEGA、Clustal构建亲缘关系树,用SignalP和TargetP分析信号肽和亚细胞定位信息;用K estimator和PAML分析其Gpx基因家族进化先后顺序和选择压力;用Diverge分析GPX蛋白家族功能分歧。结果表明,GPX蛋白家族进化中形成两个亚类,其一包括GPX1和GPX2,其二包括GPX3、GPX5和GPX6;各GPX蛋白成员均有高度保守的GPX蛋白家族基序和高度保守的硒代半胱氨酸或半胱氨酸残基,氨基端信号肽分析显示,GPX1蛋白为胞浆线粒体型,其余家族成员均为胞外分泌型;哺乳动物Gpx1基因进化上受到严格的负选择作用,Gpx基因家族成员保守区也受到负选择作用,但用枝位点模型却检出了正选择作用,GPX蛋白家族内存在轻微的功能分歧。哺乳动物GPX蛋白家族的进化上的负选择作用表明其在哺乳动物清除自由基抗氧化方面的关键作用。     

镁离子转运蛋白CorA间质结构域删除分析

为了研究CorA的镁离子转运机理,对大肠杆菌CorA的间质结构域区进行了删除突变分析,并利用酵母突变体互补技术进行了突变体活性测定.以酿酒酵母质膜镁离子转运系统敲除突变体菌株CM66及其基因型对照菌株CM52为宿主菌,建立了大肠杆菌CorA转运活性测定体系.结果显示:大肠杆菌CorA间质结构域N-端起始的24个残基对于CorA在酵母质膜中的表达或维持其本身正确构象发挥重要作用, CorA M124到D154段的部分残基在CorA介导的镁离子转运过程中起到重要作用.     

锌指结构域序列的进化生成模拟——遗传算法在蛋白质结构研究中的应用

<正> 遗传算法(Genetic algorithms, GA)是具有高频率的搜索机制的算法.遗传算法不仅为蛋白质结构研究提供了一种全局自适应搜索算法,使能量最低状态(按热力学假说,蛋白质的天然状态的能量最低)的搜索更加方便,而且为我们提供了一种新的想法和研究思路.通过应用遗传算法对锌指结构域序列进行进化模拟,成功地从随机产生的氨基酸序列中,进化生成了一些潜在的锌指结构域序列,不仅在一定意义上证明了氨基酸序列起源的随机性,而且对遗传算法在大规模解空间的搜索能力进行了测试.     

朊病毒与人类疾病

1981年,美国学者prusiner等发现了一种只含蛋白质(27KD),不含核酸的引起羊搔痒病的病原体,并将其命名为朊病毒(prion,virino)。近年的研究表明,朊病毒是由宿主基因编码而不是由朊病毒基因编码的蛋白质。目前认为,朊病毒与一些人和动物的慢性中枢神经系统疾病有关,如羊搔痒病(scrapie)、库鲁病(Kuru)、亚急性早老性痴呆(克雅病)、Gss病、疯牛病等。     

冷休克蛋白及冷休克反应

冷休克蛋白是从真细菌中发现的,它不仅作为RNA分子的伴侣蛋白,同时还与细菌的多个生理过程吸着密切的联系,如：对低温的适应、细胞生长的控制、营养胁迫等,冷体克蛋白引起冷休克反应的分子调控发生在转录和翻译两个水平上。     

香山科学会议第207-212次会议简述

20 0 3年 9月 ,香山科学会议召开了第 2 0 7— 2 12次学术讨论会 ,会议主题分别是“热断层 (TTM )技术发展中的科学问题”、“中国数字化虚拟人体研究的发展与应用”、“朊病毒与人畜构象病的研究进展及防病对策”、“激光制造与未来技术产业的发展”、“凝固科学技术与材料发展”和“污染土壤修复与生态安全”。热断层 (TTM)技术发展中的科学问题　　香山科学会议召开了主题为“热断层 (TTM )技术发展中的科学问题”的第 2 0 7次学术讨论会 ,刘德培、周立伟、曾毅院士和马俊如研究员担任会议执行主席。红外、医学及相关学科的 4 0多名…     

PAS结构域介导Org35蛋白与NifA之间相互作用

在巴西固氮螺菌中, 氧和铵是调节固氮基因表达的主要环境因子, 即高浓度的氧和铵抑制固氮作用. NifA蛋白(nifA基因的产物)是所有固氮基因(nif基因)的转录激活蛋白. 目前, 在该菌中, 氧和铵对NifA蛋白的表达和活性的调节机制仍然不清楚. 本研究从巴西固氮螺菌中克隆到编码含有PAS结构域蛋白的org35全基因, 将根据org35的核苷酸序列推测的Org35蛋白氨基酸序列在NCBI网上进行同源性比较, 结果表明, Org35蛋白属于杂合双组分调节系统, 包括3个结构域, 即N-端PAS结构、中间组氨酸激酶结构域(HPK)和C-端响应调节蛋白结构域(RR). 并通过酵母双杂交系统证明了Org35蛋白与NifA蛋白之间的相互作用是由PAS结构域介导的.     

耐辐射奇球菌RadA蛋白参与DNA损伤修复过程

RadA是一个高度保守的蛋白. 在古细菌中, RadA蛋白具有RecA类似的功能并在同源重组过程中起关键作用. 在大肠杆菌中, RadA蛋白也参与了同源重组和DNA损伤修复过程, 但远没有在古细菌中的功能那么重要. PSI-BLAST结果表明, 与古细菌以及真核细胞中RadA蛋白相比, 耐辐射奇球菌RadA蛋白和细菌中的RadA的相似性更高. 研究发现, 耐辐射奇球菌radA基因的突变增加了耐辐射奇球菌对γ射线和紫外线照射的敏感性, 但对过氧化氢氧化胁迫的抗性没有影响. 耐辐射奇球菌和大肠杆菌radA基因均能完全补偿突变体对γ射线和紫外线辐照的抗性. 进一步的结构域功能分析表明, 与radA突变体的抗性相比, 锌指结构域的缺失导致耐辐射奇球菌对γ射线和紫外线辐照更加敏感; 仅仅缺失Lon蛋白酶结构域的耐辐射奇球菌表现为比radA突变体略微更抗γ射线和紫外线辐照处理. 这些实验结果表明, 耐辐射奇球菌RadA蛋白的确参与了DNA损伤修复过程, 而且不同的结构域具有不同的功能.