Xieite, a new mineral of high-pressure FeCr2O4 polymorph

Xieite, a new mineral, occurs in the shock vein of the Suizhou meteorite. The mineral has an orthorhombic structure and its space group is Bbmm. The cell parameters are a = 9.462（6） A, b = 9.562（9） A, c = 2.916（1）A. The crystal-chemical formula is （Fe0.87Mg0.13Mn0.01）1.01（Cr1.62AI0.25Ti0.08V0.02）1.97O4, or simply formula FeCr2O4. Stronger X-ray diffraction lines are [d （A）, I/Io]： （2.675, 100）, （2.389, 20）, （2.089, 10）, （1.953, 90）, （1.566, 60）, （1.439, 15）, （1.425, 15）, （1.337, 40）. Xieite is a high pressure polymorph of FeCr2O4 and formed by solid-state transformation of chromite under shock-induced high pressure and temperature, in association with other high-pressure minerals including ringwoodite, majorite, lingunite and tuite. The P-Tcondition for the formation of xieite is estimated to be 18--23 GPa and 1800--1950℃, respectively. Xieite has recently been approved by the Commission on New Minerals, Nomenclature and Classification of the International Mineralogical Association （IMA 2007-056）. The mineral name, xieite, is named after Xiande Xie.     

ABCA1基因R1587K多态性在广西汉族与壮族人群中的分布

为探讨ABCA1基因R1587K单核苷酸多态性(SNP)在中国广西汉族与壮族人群中的多态性分布,采用聚合酶链-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,对无血缘关系的健康汉族人100例和壮族人84例的ABCA1基因R1587K位点进行检测,分析基因型频率和等位基因频率在2组人群中的分布,并与其他种族相比较.结果表明,ABCA1基因R1587K等位基因频率在汉族分别为ηR=0.475和ηR=0.525,壮族中分别为ηR=0.411和ηK=0.589;基因型频率在汉族分别为:ηRR=0.19,ηRK=0.57,ηKK=0.24,壮族分别为:ηRR=0.25,ηRK=0.32,ηKK=0.43.2组人群的基因型频率分布无显著性差异(P＞0.05),2组人群在等位基因频率分布上也无统计学差异(P＞0.05).可见,ABCA1基因R1587K位点多态性在中国广西汉族与壮族的基因型频率分布无统计学差异,与国外不同种族人群相比具显著性差异.     

LDLR基因Ava Ⅱ位点多态性与高甘油三酯血症的相关性

研究了LDLR基因外显子13中Ava Ⅱ位点多态性在宁夏回族自治区正常回、汉族人群及高甘油三酯血症患者中的分布频率,分析探讨了该住点多态性是否存在于宁夏回、汉族居民中,以及基因型与甘油三酯含量之间的相关性.应用聚合酶链式反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法,对214例健康样本(回族102例,汉族112例)和212例高甘油三酯血症患者样本(回族88例,汉族124例)的低密度脂蛋白受体(LDLR)基因的多态性进行了检测.结果发现,在宁夏地区回、汉族人群中存在着Ava Ⅱ多态性位点,回、汉族居民间存在着明显差异,健康人群与高甘油三酯血症人群之间该位点基因型存在着显著差异.由此说明,Ava Ⅱ多态性位点可以作为宁夏回、汉族的遗传标记,而且该位点与高甘油三酯血症有相关性.     

新疆良种驴DGAT2基因第3内含子PCR-SSCP多态性与体尺性状的相关性分析

应用PCR-SSCP技术对新疆和田和喀什良种驴群体的DGAT2基因内含子3进行单核苷酸多态性检测和分析,探讨DGAT2基因作为候选基因影响新疆良种驴体尺性状的可能性。结果表明:DGAT2基因存在多态性,其第3内含子有两种等位基因A和B,存在AA和AB两种基因型,没有检测到BB基因型,其中AA基因型为优势基因型。AB型与AA型相比存在碱基发生A→G的突变,使赖氨酸突变为精氨酸。新疆和田良种驴AA与AB基因型个体相比,体高和胸围差异极显著(P<0.01),体长差异显著(P<0.05),AB型体高、胸围和体长高于AA型。新疆喀什良种驴AA与AB基因型个体相比,体高差异显著(P<0.05),AB型的体高、胸围和体长高于AA型。新疆喀什良种驴的体高、体长和胸围高于和田良种驴,差异极显著(P<0.01)。     

铜绿假单胞菌医院感染流行病学分子研究及基因分型

目的建立随机扩增多态性DNA（RAPD）基因分型方法检测铜绿假单胞菌（PA）,调查铜绿假单胞菌医院感染流行病学的情况,为控制院内感染提供直接可靠的参考依据。方法对2008—2009年分离的180株铜绿假单胞菌进行统计分析其临床分布;通过抗生素敏感性试验进行抗菌谱分型;再采用PAPD基因分型方法进行分析。结果标本主要来自ICU、烧伤科、呼吸内科等。从痰液标本中分离的铜绿假单胞菌占58．9％,其次伤口分泌物标本占18．9％、中段尿16．7％,其它类型标本占5．5％。抗菌谱分型分为5型。180株铜绿假单胞菌用RAPD分型共得178株,分型率98．9％（178／180）,分为9种类型：Ⅰ～Ⅸ。结论RAPD分型技术对铜绿假单胞菌临床分离株分型率较高;同一抗菌谱型的基因型可能不同,同一基因型的抗菌谱也可能不同。     

菜豆种质盐溶蛋白遗传多态性分析

以39个菜豆品种和1个杂交后代为材料,通过SDS-PAGE技术获得了种子盐溶蛋白的亚基分布电泳图谱,比较了分布差异,并分析了其遗传表现.结果表明：40个供试种质的盐溶蛋白带型差异显著,电泳共分离出27条迁移率不同的条带,其中有4条保守带（均为100%表达）,分子质量分别为99.039、58.267、25.234、15....     

银川地区尿酸转运相关基因多态性与高尿酸血症相关性研究

目的 分析银川地区居民尿酸水平的影响因素,探讨溶质载体家族30成员3(SLC30A3)基因多态性与高尿酸血症发生的关系.方法 选取高尿酸血症患者614例,同期年龄和性别构成相当的尿酸正常健康体检者600例为对照组.使用Haploview软件筛选SLC30A3基因tagSNP,共得到2个SNP位点(rs13267319,rs24628779),分析SLC30A3基因多态性与银川地区居民高尿酸血症的关系.结果 银川地区居民中男性受试者尿酸水平与BMI值、腰围、收缩压、GLU呈正相关,与HDL-C呈负相关;女性受试者尿酸水平与腰围、GLU、TC、TG呈正相关,与HDL-C呈负相关.多因素Logistic回归分析显示:BMI值、收缩压、舒张压、TG、LDL-C、Cre是高尿酸血症的独立危险因素,HDL-C是高尿酸血症的保护因素.SLC30A3基因rs13267319位点在高尿酸血症组AG型和AA型比例均明显低于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05);与GG型相比,AG型和AA型患高尿酸血症的危险性均明显降低;等位基因A相对于G对高尿酸血症有保护作用.SLC30A3基因rs24628779位点在高尿酸血症组CT型和TT型比例均明显高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05);与CC型相比,CT型和TT型患高尿酸血症的危险性均明显增高.等位基因C相对于T对高尿酸血症有促进作用.结论 SLC30A3基因rs13267319,rs24628779位点与银川地区居民高尿酸血症的发病机制存在明显关联.     

Effects of cutoff thresholds for minor allele frequencies on HapMap resolution: A real dataset-based evaluation of the Chinese Han and Tibetan populations

Genomic variation is the genetic basis of phenotypic diversity among individuals, including variation in disease susceptibility and drug response. The greatest promise of the International HapMap is to provide roadmaps for identifying genetic variants predisposing to complex diseases. Single nucleotide polymorphism （SNP） is the fundamental element of the HapMap. Allele frequency of SNPs is one of the major factors affecting the resulting HapMap, being the factor upon which linkage disequilibrium （LD） is calculated, haplotypes are constructed, and tagging SNPs （tagSNPs） are selected. The cutoff thresholds for the frequency of minor alleles used in the making of the map therefore have profound effects on the resolution of that map. To date most researchers have adopted their own cutoff thresh- olds, and there has been little real dataset-based evaluation of the effects of different cutoff thresholds on HapMap resolution. In an attempt to assess the implications of different cutoff values, we analyzed our own data for the centromeric genes on Chromosome 15 in Chinese Han and Tibetan populations, with respect to minor allele frequency cutoff values of 〉0.01 （0.01 group）, 〉0.05 （0.05 group）, and 〉0.10 （0.10 group）, and constructed HapMaps from each of the datasets. The resolution, study power and cost-effectiveness for each of the maps were compared. Our results show that the 0.01 threshold provides the greatest power （P= 0.019 in Han and P= 0.029 in Tibetan for 0.01 vs. 0.05 threshold） and de- tects most population-specific haploypes （P= 0.012 for 0.01 vs. 0.05 threshold）. However, in the regions studied, the 0.05 cutoff threshold did not significantly increase power above the 0.10 threshold （P = 0.191 in Han; 1.000 in Tibetans）, and did not improve resolution over the 0.10 value for population- specific haplotypes （P= 0.592） neither. Furthermore the 0.05 and 0.10 values produced the same figures for tagging efficiency, LD block number, LD length, study power and cost-savings in the Tibetan population. These results suggest that a lower cutoff value is more appropriate for studies in which population-specific haplotypes are crucial, and that the most appropriate cutoff value may differ between populations. Due to the limited genes studied in this project more studies should be conducted to further address this important issue.     

TLR9基因遗传多态性与疾病关系的研究进展

近年来对TLRs的研究主要集中在人类的TLRs的遗传多态性在各种疾病中的免疫学作用等方面的研究。对其他哺乳动物TLRs的免疫学研究还不是很多。本文综述TLR9基因的遗传多态性与几种疾病关系的研究最新进展。     

中国明对虾与5种虾类线粒体16S rRNA和COI基因片段的序列比较及其系统学初步研究

采用PCR扩增和序列测定等技术,对中国明对虾（Fennerpenaeus chinem如）线粒体DNA16S rRNA和细胞色素氧化酶I（COI）基因片段进行了初步研究,分别得到16S rRNA和COI 2个基因片段的碱基序列,其中16S rRNA基因片段的大小为515bp,碱基A＋T,G＋C的组成分别为66．47％和33．53％;COI基因片段的大小为472bp,碱基A＋T,G＋C的组成分别为62．50％和37．29％．在2种基因片段中,AT的组成明显高于GC的组成,这与果蝇、虾类、蟹类等无脊椎动物的16S rRNA和COI基因片段的研究结果相似．通过对中国明对虾16S rRNA和COI 2个基因片段遗传特征的研究,16S rRNA只有8处核苷酸的碱基在4个群体间表现出差异,COI基因片段中共检测出24个多态性核苷酸位点,其种内变异较低。另外,将本研究所得序列与GenBank中对虾科5个种的16S rRNA基因片段序列进行比较后,发现其聚类关系与传统分类相一致．