多重相关检验中错误发现率的控制算法

假设检验问题是通过比较p值和置信水平α的值来决定是否拒绝对应的假设,pα时我们拒绝原假设。随着试验次数的增加,在所有满足零假设为真的p值集合中,数值较小的p值存在的可能性会增加,从而使得做出错误的判断,p值调整算法可以针对多重检验有效地缓解这类问题。本文讨论多重检验的p值调整算法的功效,模拟基因序列进行多重检验分析,产生2000个模拟量(即基因数量),重复实验1000次,得到1000组p值。对每组p值使用相应的调整算法得到新的p值,比较每个算法功效的优劣。模拟结果显示在我们所选用的5种p值调整算法中,q值方法(Storey 2003)能很好地控制错误发现率(FDR)的大小,同时具有更高的功效值。     

仁扇舟蛾幼虫肠道可培养细菌群落结构分析

[目的]了解仁扇舟蛾(Clostera restitura)肠道共生细菌的主要类群及其群落结构特征,明确仁扇舟蛾幼虫前、中和后肠可培养细菌的种类及群落结构组成,为进一步研究特异功能细菌的生理生化特征和功能提供基础.[方法]选取仁扇舟蛾5龄幼虫进行肠道解剖,分离前、中和后肠不同肠段,研磨稀释10-1～10-6,分别涂布于...     

研究发现H7N9流感病毒适应感染哺乳动物的新突变

最近的一项研究发现,某些H7N9流感病毒的基因序列中含有一个新型的突变,可能在这种新型流感病毒的感染和发病过程中发挥一定的作用.题名为"新型H7N9禽流感病毒感染与环境流感病毒的关联和病毒对宿主的适应"的研究论文发表于《中国科学:生命科学》英文版2013年第6期,从流行病学、临床医学和生物信息学等角度探讨了新型H7N9禽流感病毒的特征,     

德国科学家破解人类进化之谜

据香港文汇报报道,德国的莱比锡普朗克演化人类学研究所近日宣布与美国一家科技公司合作,重组一种绝迹3万年的史前人类一尼安德特人的基因序列,试图填补人类进化历程中几处空白的片段。     

科技动态

电视也能收短信，抓住多变记忆：威刚MyFlash记忆卡，智能镜照出5年后模样可清晰了解身体变化，世界上最具传染性的细菌基因序列破译，全球第一批纳米博士学位被授予 中国人在列，“八箭十星”笑傲苍穹……     

新生儿成熟度对免疫球蛋白重链可变区基因重排多样性的影响

目的分析不同胎龄新生儿免疫球蛋白重链可变区(IgH)基因序列特征，探讨新生儿成熟度对其多样性的影响。方法10例极不成熟儿、12例不成熟儿和11例成熟儿的脐血淋巴细胞DNA被抽提，IgH基因被扩增、克隆和测序。结果极不成熟儿和不成熟儿优先使用V     

Cloning,Sequencing and Phylogenetic Study of rbcL Gene from Cyanobacteria Arthrospira and Spirulina

Large subunit gene of rubisco (rbcL) of cyanobacteria Arthrospiraplatensis FACHB341, A. platensis FACHB439, A. maxima OUQDSM and Spirulina sp. FACHB440 is cloned, sequenced and characterized. Results show that GC content of the gene in strain Spirulina sp. FACHB440 is higher than that in the others. The alignments based on deduced amino acid sequences indicate that Spirulina sp. FACHB440 is different from that in other three samples of Arthrospira, though they have the same conserved functional sites (95, 98, 121, 124, 221, 257). The nucleotide sequence similarity among the three strains of the genus of Arthrospira (96.5 - 99.6% ) is higher than that between Arthrospira and Spindina (78.1 - 78.5 % ). By comparison of the corresponding sequence of other cyanobacteria, a phylogenetic tree with two clusters is constructed. A. platensis FACHB341, A. maxima OUQDSM and A.platensis FACHB439 form the monophyletic linage, which is fully supported by bootstrap values (1000), while Spirulina sp. FACHB440 and Anabaena sp. PCC7120 cluster in another linage with the bootstrapvalue of 909.     

墨吉对虾Penaeus merguiensis 线粒体16SrRNA 基因序列分析

比较墨吉对虾6个群体的线粒体16SrRNA基因约457个碱基对的DNA序列。结果表明这6个群体间的遗传距离（D）在0-0.0085之间，未发现广东的3个群体与澳洲或新加坡群体间存在地理群体以上的遗传差异。     

走出"基因决定论"的误区

自从基因一词在20世纪初进入科学家的词汇表以来,它不仅是生物学家最为常用的词汇之一,也成为当今普通大众最为熟悉的科学术语之一.     

中华绒螯蟹卵巢新基因EJ05的全长cDNA克隆和序列分析

利用RACE技术从中华绒螯蟹卵巢获得了新基因EJO5（Eriocheir japonica ovary gene 5,EJO5)的全长rDNA序列(GenBank检索号：AY185921)．该cDNA序列长度为1425hp，开放阅读框为585bp，编码194个氨基酸．根据氨基酸序列计算的相对分子质量和等电点分别为22344和9．5．用生物信息学的方法未能得到对该基因功能预测的信息。