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31.
Finding finer functions for partially characterized proteins by protein-protein interaction networks
LI YanHui GUO Zheng MA WenCai YANG Da WANG Dong ZHANG Min ZHU ding ZHONG GuoCai LI YongJin YAO Chen WANG Jing 《科学通报(英文版)》2007,52(24):3363-3370
Based on high-throughput data, numerous algorithms have been designed to find functions of novel proteins. However, the effectiveness of such algorithms is currently limited by some fundamental factors, including (1) the low a-priori probability of novel proteins participating in a detailed function; (2) the huge false data present in high-throughput datasets; (3) the incomplete data coverage of functional classes; (4) the abundant but heterogeneous negative samples for training the algorithms; and (5) the lack of detailed functional knowledge for training algorithms. Here, for partially characterized proteins, we suggest an approach to finding their finer functions based on protein interaction sub-networks or gene expression patterns, defined in function-specific subspaces. The proposed approach can lessen the above-mentioned problems by properly defining the prediction range and functionally filtering the noisy data, and thus can efficiently find proteins’ novel functions. For thousands of yeast and human proteins partially characterized, it is able to reliably find their finer functions (e.g., the translational functions) with more than 90% precision. The predicted finer functions are highly valuable both for guiding the follow-up wet-lab validation and for providing the necessary data for training algorithms to learn other proteins. 相似文献
32.
本文首先建立了特征结构提取问题的罚函数表示,通过对罚函数求极小可以求得原始协方差矩阵的主特征向量及其对应的特征值。为了求得其他特征结构,特构造了一个协方差矩阵序列。如果将罚函数展开并进行整理,高阶Hopfield神经网络可被引入到特征结构提取中。这种方法比较直观,它将网络稳定时的输出与所求协方差矩阵的主特征向量的各个分量相对应,而网络稳定时的能量则对应于协方差矩阵的迹与所求特征值之差,计算机仿真结果验证了这种方法的正确性。 相似文献
33.
前言。在工程规划、设计与管理中,常用到一些由实际资料绘制的曲线,由于没有函数表达式,应用起来很不方便.当曲线具有周期性质(通常近似于三角函数曲线)时,自然考虑到采用三角多项式来近似拟合.本文探讨了三角多项式拟合曲线基本方法存在的不足,提出了一个有效的改进方法,并从理论上证明了该方法的正确性. 相似文献
34.
土工作业工程机械产品质量系统分析方法 总被引:2,自引:0,他引:2
贾鸿勋 《系统工程理论与实践》1995,15(9):44-50
在系统工程理论指导下, 综合运用层次分析法、功效函数法和多目标数学规划法建立了产品质量管理系统分析数学模型, 并对推土机产品质量优劣作出了定量系统评价, 它是择优选用土工作业工程机械有效方法。 相似文献
35.
36.
讨论了具有相同1值点的亚纯函数的唯一性问题,对具有相同1值点的两个亚纯函数及其它们的各阶导数的唯一性问题结合亏值理论得到了几个定理,推广和改进了前人的有关结果。 相似文献
37.
本文在文[1]的启示下,借助文[2]的迭代思想,研究函数方程P(X)f(X)+Q(Z)f(Z)=R(X),给出了它的可解条件及其求解公式,推广了有关文献的结论. 相似文献
38.
张振江 《宝鸡文理学院学报(自然科学版)》1993,(2):40-42
本文利用分析的方法,借助于次调和函数和下函数的性质得到 Dirichlet 问题的存在性。 相似文献
39.
40.