基于混合分布模型数据挖掘的研究进展

基于混合分布模型的数据挖掘和知识发现是近几年发展起来的方法，本从其原理出发，介绍了该模型的发展及其在数据挖掘中的实现方法，并对未来的研究方向进行了展望，给出了若干值得研究的问题。     

数据仓库的研究

介绍了数据仓库的体系结构、相关技术和数据分析技术,分析了数据仓库的两个重要应用——OIAP和数据挖掘的功能和实现中的相关技术和方法,对数据仓库研究的现状和发展方向进行了介绍．     

miRNA作用通路研究

后基因组时代的分子生物学研究需要从整体的角度,系统地阐述基因参与的生物调控过程,已有的通过构建基因调控网络的方式所做的系统生物学研究主要关注于蛋白编码基因之间的相互作用。随着近年来非编码RNA（noncoding RNA）,特别是miRNA研究的深入,显示生物体内存在着广泛的基因转录后调控。本论文通过建立综合蛋白质编码基因与miRNA基因相互作用关系的基因调控网络,分析了人类基因组中涉及miRNA的三类作用模式：（1）宿主基因与内含子miRNA共同作用于另一个蛋白编码基因。（2）miRNA簇中的不同miRNA分别作用于存在着相互作用的两个蛋白编码基因。（3）由两个宿主基因与其各自的内含子miRNA形成双向负调控回路。本研究的结果为进一步认识人类miRNA基因的功能特性提供了重要参考,研究所预测的数据为实验验证提供了依据。     

B7-1和新型隐球菌DHA1基因嵌合重组质粒的构建

目的构建包含新型隐球菌细胞免疫主要相关基因-迟发超敏反应抗原基因(delayed-type hypersentivity antigen 1，DHA1)与小鼠共刺激分子B7-1的嵌合重组质粒。方法设计合成两对寡核苷酸引物。用PCR法分别从pUCmB7-1TM和新型隐球菌重组质粒pcDNA3-DHA1中特异扩增出编码B7-1和DHA1的基因片段(921和984bp)。分别用HindⅢ、EeoRⅠ、XbaⅠ酶切后。逐个定向连接到质粒pcDNA3中，转化宿主菌DH-5α．分别用上述内切酶酶切及DNA测序鉴定重组质粒。结果酶切鉴定示所切下的片段大小均与预计相符，测序结果与献报道序列及预计结果一致。证实符合表达框架。结论本实验成功构建了新型隐球菌嵌合重组质粒pcDNA3-B7-1-DHA1。为进一步研究新型隐球菌DNA免疫奠定了基础。     

Symmetrical directional cloning: An efficient method to prepare hairpin RNA interference constructs

RNA interference (RNAi) is a loss-of-function approach by which double-stranded RNA (dsRNA) initiates degradation of homologous mRNAs in a sequence specific manner. The dsRNA molecules can be produced in vitro or in vivo, and can be introduced to cells in a number of ways. Here we report a more efficient method for the cloning of inverted repeat DNA fragments into expression vectors that can be transcribed into effective dsRNA molecules in vivo or in vitro. This method, named Symmetrical Directional Cloning (SDC), takes the advantage of compatible non-palindromic restriction enezyme sites, which allow one to directionally clone a single PCR product in both the sense and antisense orientations together into a vector. SDC allows for the directional cloning of inverted repeats using a single PCR product; it requires only one cut site on each side of the loop. Hence this method is more cost effective and less time-consuming. At least 21 commercially available restriction endonucleases can be used as cloning sites for the SDC method. The efficacy of dsRNA expression vectors prepared by SDC has been demonstrated by targeting a negative regulator of the signaling pathway mediating the response of cells to phytohormone, gibberellins (GA), in the aleurone cells.     

基于有权重超图模型的离群点发现

结合基于有权重支持度框架的关联规则挖掘方法和基于超图模型的离群点检测方法,给出了一种离群数据的改进定义,并通过一个简单的实例说明了这种离群数据的离群含义,且与原离群点定义做了比较,分析了新定义离群数据的应用价值.     

基于粗糙集与BP神经网络的分布式数据挖掘算法

利用数据挖掘来提高网络中能量利用率是无线传感器网络(WSN)的一个重要研究方向.本文构建了基于粗糙集与神经网络相结合的无线传感器网络分布式数据挖掘算法.该算法用粗糙集对节点内的原始数据进行离散化与属性约简后得到的最简决策表训练BP神经网络,再将构造好的BP神经网络集成在每个传感器节点上.仿真结果表明,该算法可以降低数据维数,消除冗余数据、减少网络通信量、延长网络寿命.     

Noncoding RNAs: Different roles in tumorigenesis

A major portion of the mammalian genome is transcribed to produce large numbers of noncoding RNAs(ncRNAs).During the past decade,the discovery of small RNAs,including the microRNAs(miRNA) and small interfering RNAs(siRNA),has led to important advances in biology.The breadth of the ncRNA field of study has substantially expanded and many recent results have revealed a range of functions that can be attributed to the miRNAs and other ncRNAs.For example,H19 RNA,HOTAIR RNA,transcribed ultraconserved regions(T-UCRs),natural antisense RNA,transfer RNA and mitochondrial noncoding RNA have been suggested to play important roles in cancers and other diseases as well as in diverse cellular processes.In this review,we focus on the current status of several classes of ncRNAs associated with cancer with the emphasis on those that are not microRNAs.     

临床数据中挖掘关联规则算法的选用

对典型的挖掘关联规则的Apfiori算法和FP-growth算法进行比较分析．然后，结合临床数据的特点，建议在临床数据关联规则挖掘中采用FP-growth算法。     

基于粗集理论的分类关联规则挖掘研究

认为数据量的巨大和高维、用户交互与先验知识的利用等等是知识发现领域面临的问题和难点。粗糙集理论是一种具有模糊边界的集合理论，它作为研究知识发现的新型工具，能严格地处理不精确数据的分类问题，被广泛应用于不相容决策表中的规则提取过程中。针对粗糙集理论中属性约减和属性值约减这两个重要问题进行了研究，并介绍了数据集中挖分类规则的基本原理，同时利用RS理论中核和核值的概念，提出了一个在数据集中发现没有冗余属性的最小归纳依赖关系并简化决策系统的数据挖掘算法，并应用一简单的例子说明如何在数据库中发现分类规则，实验结果表明此算法可以大大提高系统潜在知识的清晰度。