一株好氧反硝化细菌的筛选鉴定及其脱氮效果

经过富集培养和反硝化能力测定,从城市污水处理厂活性污泥中筛选得到1株好氧反硝化细菌。通过16S rDNA同源性分析对该菌进行分子鉴定,并将菌接种到模拟富营养化水体中以探究其对系统中硝态氮和总氮的去除能力。结果表明,该菌属于Klebsiella sp.,命名为HLNR05。菌株HLNR05在24 h内NO3--N的去除率达96.6%,TN去除率达92.1%,而且其从培养体系中完全去除的氮明显多于同化到细胞的氮。利用HLNR05处理模拟富营养化废水,结果发现其在24 h内对模拟废水中的NO3--N和TN去除率达91.4%和88.2%。表明菌株HLNR05具有较强的好氧反硝化能力。     

蜡样芽孢杆菌 LJ01 的鉴定及亚硝酸盐还原酶性质

从豆瓣酱中筛选出一株能高效降解亚硝酸盐的菌株 LJ01,经鉴定为蜡样芽孢杆菌． 通过测定 LJ01 细胞中不同组分的酶活,研究了亚硝酸盐还原酶的初步定位．LJ01 经100mg/L 的 NaNO₂ 诱导后,用溶菌酶破壁,粗酶液先经阴离子 DEAE Sepharose Fast Flow层析柱分离,测定不同蛋白组分 a、b、c 降解亚硝酸盐的活力,利用 0．1 mol/L 无机电子供体丁二酸和亚硫酸钠等鉴定出组分 c 为亚硝酸盐还原酶,再经葡聚糖凝胶 G-150 层析柱分离,获得较纯的亚硝酸盐还原酶,每升发酵液可得到 0．54 mg 活性酶蛋白,酶蛋白活力达到 4004． 89 U/mg,得率为 2．37%,纯化后其 NiR 的比活力提高了 17． 57 倍． 经 SDS-PAGE 电泳后确定 LJ01 中亚硝酸盐还原酶的单体分子质量约为 30ku．     

基于分子动力学模拟和自由能计算的非小细胞肺癌对克唑替尼(crizotinib)耐药性研究

为了研究间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK) F1174V突变引起非小细胞肺癌患者对crizotinib的耐药性机制,使用分子动力学模拟(molecular dynamics simulations,MD).本质动力学(essential dynamics,ED)分析及分子力...     

Aβ16—22聚集及海藻糖抑制其聚集过程的毛细管电泳检测

淀粉质β（amyloidp,Aβ）多肽是阿尔兹海默症（Alzheimer’Sdisease,AD）的致病蛋白,其疏水核心Aβ16—22具有重要的研究价值．以Aβ16—22为模型多肽,利用毛细管电泳检测方法,分析了Aβ16—22在水溶液和海藻糖溶液中的聚集过程．结果表明,毛细管电泳法不仅能够很好地分离Aβ16-22聚集过程中单体和部分聚体,实现对多肽聚集过程的快速鉴定和分析,同时也可检测海藻糖对Aβ16—22聚集的抑制作用．研究结果可为Aβ聚集抑制剂的高通量筛选和AD治疗中的快速诊断提供实验基础．     

活性污泥宏基因组Fosmid文库的构建

大插入片段宏基因组文库的构建是开发大片段目的基因及分析其结构与功能的基础． 文中分别采用十六烷基三甲基溴化铵( CTAB) 法、试剂盒及琼脂糖包埋法提取活性污泥宏基因组DNA,其中琼脂糖包埋法获得的DNA 片段大于23 kbp,利用此DNA 成功构建了以pCC1FOS 为载体的Fosmid 文库,该文库含有5280 个克隆,平均插入片段长度为35 ～40 kbp,共包含约200Mbp 的宏基因组DNA． 从此文库中随机挑选200 个克隆,利用活性筛选方法快速筛选到了1 个含有淀粉酶的阳性克隆,表明活性污泥Fosmid 文库可用于功能基因的活性筛选,具有开发新基因的潜力．     

一株拮抗芽孢杆菌的分离鉴定及其β-1,4-葡聚糖酶基因的克隆

 植物真菌病害是影响农业生产的主要因素之一,连作栽培导致病害逐年加重,为获得能够抑制病原真菌的生防菌以解决真菌病害防治难题,通过平板对峙实验及分子鉴定、抑菌活性物质分析、葡聚糖酶基因克隆及分析,获得一株对多种植物病原真菌具有显著抑制作用的芽孢杆菌,菌株编号为L103。16S rDNA及看家基因序列分析表明,该菌株为巨大芽孢杆菌,羧甲基纤维素钠平板筛选及刚果红染色实验发现该菌具有很强的产纤维素酶(CMC酶)的能力,根据GenBank中巨大芽孢杆菌内切葡聚糖酶基因(HM130670.1)序列设计引物,将扩增得到的1482bp大小的片段克隆到载体pMD18-T上,测序并通过GenBank数据库BLAST分析显示该序列与一株Bacillus sp. HB102的内切β-1,4-葡聚糖酶基因序列一致性达到95%,而与Bacillus subtilis的β-1,4-内切葡聚糖酶基因一致性为85%,进一步分析该菌株产生的抗病活性物质并对其进行改良将为该菌在今后的真菌病害防治应用中提供理论基础。     

鲫鱼肠道温和气单胞菌的分离鉴定及药敏试验

从鲫鱼肠道分离纯化获得一株细菌,编号为XA-2,对其进行形态观察,并对理化特性、16S rDNA克隆测序及系统发育进化树构建等研究．结果表明,XA-2菌株为革兰氏阴性短杆菌,可发酵葡萄糖产气;进一步采用 PCR方法克隆16S rDNA序列,测得长度为1508 bp ;对系统发育进化树分析,发现XA-2菌株与温和气单胞菌（Aero-monas sobria）模式菌株NCIMB 12065的亲缘关系最近,同源性达99.73％,从而鉴定XA-2菌株为温和气单胞菌．采用27种抗生素进行药敏试验,结果显示该菌株对头孢噻吩、头孢噻肟、头孢克肟、头孢哌酮、新霉素、诺氟沙星、复方新诺明等药物敏感,对先锋霉素Ⅳ、阿莫西林、庆大霉素、卡那霉素、红霉素等药物不敏感．     

养殖塘底泥中溶藻细菌的分离及16S rRNA序列分析

从养殖塘底泥中分离细菌,对其溶藻活性进行初步研究.结果表明,共有14株菌株对铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)显示出强弱不同的溶藻活性,其中MS7和MT22的叶绿素a去除率分别达到了91.0％和73.7％,溶藻活性较强.16S rRNA基因测序结果显示,分离得到的14株溶藻细菌中,除了AT菌株为...     

珊瑚礁相关病毒的研究进展

珊瑚礁被称为海洋中的“热带雨林”,是海洋生态系统中的核心组成部分之一。珊瑚礁病毒包含珊瑚本身感染的病毒和珊瑚共生生物（如藻类、细菌等）感染的病毒,对于珊瑚礁健康与疾病、生长与死亡起着独特而重要的作用,在维持珊瑚礁生态系统的物质循环和能量流动等生态学功能方面起着潜在作用。由于技术的局限以及关注度较低等原因,有关珊瑚礁病毒的研究较少。近年来,随着高通量测序技术的发展,宏转录组和宏基因组逐渐成为研究珊瑚礁病毒多样性及其生态学功能的重要方法之一。本文对国内外相关研究进行总结和归纳,拟为珊瑚礁病毒后续研究提供新的方向和思路,同时指导我国珊瑚礁的保护以及修复。