黄粉虫抗冻蛋白基因TmAFP84的克隆和序列分析

对黄粉虫抗冻蛋白(AFPs)基因进行RT-PCR扩增后,构建克隆重组质粒pUCm-T-TmAFP84,经双酶切、PCR和测序鉴定,克隆出了与GenBank中公布的编码84个氨基酸基因(注册号AF159114)基本相一致的抗冻蛋白基因TmAFP84,其同源性高达98.81%.与其他编码84个氨基酸的抗冻蛋白基因的同源性为95.92%.进而构建了表达重组质粒pMAL-p2X-TmAFP84.     

A measure of semantic similarity between gene ontology terms based on semantic pathway covering

Semantic similarity between Gene Ontology (GO) terms is critical in resolving semantic heterogeneousness when integrating heterogeneous biological databases. Traditionally, distance based and information content based measures are two major methods. In this paper, a new method based on semantic pathway covering is proposed and an algorithm, COMBINE algorithm, is presented, which considers information contents of two given nodes and those of all nodes included in the two nodes’ pathways. Experiments show that COMBINE algorithm obtains the highest correlation index compared with those distance based and information content based algorithms.     

Ⅰ型糖尿病基因免疫治疗研究

I型糖尿病是由T细胞介导自身免疫性疾病，由胰岛β细胞免疫破坏所致．其基因免疫治疗主要包括诱导免疫耐受、改变抗原提呈细胞的功能及活性、改变免疫调节细胞因子、干扰协同刺激信号和调节细胞凋亡．     

六安地区高粱花叶病毒P3基因的克隆和序列测定

从六安产甘蔗病叶中提取总RNA,逆转录获得甘蔗花叶病毒(Sorghun mosaic virus,SrMV)基因组cDNA。设计P3基因特异引物,通过PCR扩增P3基因,并将P3基因cDNA克隆、测序。     

扩展青霉TS414脂肪酶的克隆与原核表达

提取了扩展青霉Penicillium expansumTS414菌体的总RNA,并以反转录得到的cDNA为模板,成功扩增得到了脂肪酶基因;在此基础上,构建了重组表达载体pGEX-4T-1-PEL,并在大肠杆菌DH5α中实现了扩展青霉脂肪酶的表达;进一步采用低IPTG诱导浓度、低温、长时间的发酵策略等,使扩展青霉脂肪酶得以有活性的表达;同时,通过反复冻融细胞破碎法使其较好地从菌体细胞中分离出来,提取得到的酶液的活力达到0.49 U/mL。以上结果为后续脂肪酶分子进化等研究奠定了坚实的基础,亦可转化为高校或中学生物学实验教学的项目。     

人可溶性TRAIL原核分泌表达载体的构建

为了克隆人可溶性TRAIL基因片段,构建其新型原核分泌表达载体,从HL-60细胞中提取总RNA,根据GeneBank提供的人TRAIL基因序列,设计扩增人可溶性TRAIL基因114～281片段的特异性引物,同时引入NcoI、BamHI、TEV酶的酶切位点及His标签,以便纯化及纯化后切去His标签,并将目的基因克隆至原核表达载体PhoA,经测序分析鉴定,于大肠杆菌MM294中进行表达.结果表明:克隆到人sTRAIL基因序列,经DNA测序结果与GeneBank基因库报道的一致,成功构建了可分泌表达的人源可溶性TRAIL原核表达载体PhoA-sTRAIL,并在大肠杆菌MM294中成功表达.     

带信息熵反馈机制的免疫克隆文本聚类算法

为了有效提高文本聚类的质量,用聚类过程不断反馈的信息熵改进向量空间模型中特征词权重的计算,构造以文本相似性为基础的抗体-抗原亲和力和抗体浓度计算方法,提出用亲和力和抗体浓度控制的抗体克隆和变异策略寻找聚类中心,并将文本归入与聚类中心相似度最大的类簇.实验表明,该算法可得到聚类质量较高并且稳定性较好的聚类结果.     

流感分子病毒学研究进展

流感病毒繁殖周期很短,基因结构又非常简单,病毒RNA分成8个独立的片段。每个基因片段编码一个蛋白,有利于宿主发生双重感染后不同毒株之间基因交换重组。流感病毒为了自身生存,适应外界环境,频繁发生变异。每次新亚型出现,都引起世界性大流行。人类与流感病毒将长期共存。     

猪β干扰素基因17位丝氨酸突变体重组酵母表达载体的构建

根据猪β干扰素基因序列设计一对引物,并按酵母密码子的偏好性,在引物中对稀有密码子进行同义突变,即第3位的TAT基因突变为TAC,第7位的CGA基因突变为AGA,第164位的CGG基因突变为CGT。同时,利用聚合酶链式反应基因定点突变技术,把17位的半胱氨酸密码子TGT突变为丝氨酸密码子TCT,构建poIFNβSer17...