基于高通量测序的不同养殖系统下凡纳滨对虾肠道和水体中微生物的多样性

【目的】研究不同养殖系统对凡纳滨对虾肠道及水体微生物多样性的影响。【方法】以循环养殖系统和非养殖系统下凡纳滨对虾养殖水体及其肠道为研究对象,在养殖30d后采集样品,采用Illumina MiSeq高通量测序样品细菌16SrRNA基因V3+V4区,通过RDP11.3、Greengenes13.8、NCBI 16S Microbial和Customized batabase等数据库进行分析,阐述循环养殖系统的意义和微生物在其中的作用。【结果】养殖期间,不同养殖系统凡纳滨对虾均正常存活。将原始序列优化后对Clean序列进行分析,非循环系统下水体优质序列百分比约81%,肠道中约89%;循环系统下水体优质序列百分比为92%,肠道中为94%。两种养殖系统下水体和肠道细菌在纲水平占绝对优势的是变形菌纲,但各菌群丰度不同;不同的Alpha指数显示出物种间的差异性;通过系统发育树可以看出,不同养殖系统改变了凡纳滨对虾生境中的物种及发育关系,间接阐述微生物在养殖生境中的作用和意义。【结论】通过高通量测序揭示不同养殖系统中微生物菌群的差异以及多样性,对于凡纳滨对虾实际养殖具有指导作用,对阐述养殖过程中微生物和相关疾病的关系具有重要意义。     

云南西双版纳几种热带兰菌根真菌的研究

 从云南西双版纳不同生境下的14株热带兰菌根中分离到19株真菌,分别鉴定为9个属,其中优势菌为镰孢霉属(Fusarium)9株占47.37%;组丝核菌属(Phacodium)3株占15.79%.     

玉林城郊春、夏蝶类资源多样性

2006年4月至2006年5月间,在玉林城郊选择了六个不同生境的样地对蝶类多样性进行调查研究.共采集到蝴蝶637号,隶属8科34属51种.其多样性系数为2.5.     

都市残存林中樟树群落类型及物种多样性分析

选取武汉市残存林里常见的樟树(Cinnamomum camphora)林为研究对象,基于研究样地记录的15个样方中各物种的重要值,通过聚类分析中的组间连接法,对研究区域的残存樟树林进行了群落类型的划分;并运用Patrick丰富度指数、Shannon-Wiener多样性指数、Simpson多样性指数和Pielou均匀度指数,对不同群落类型及不同结构层次的物种多样性进行了分析.结果表明：研究区域的残存樟树群落可划分为6个群丛,分别为：群丛1：樟－女贞－络石＋阔鳞鳞毛蕨群丛;群丛2：樟－女贞＋棕榈－中日金星蕨＋黑足鳞毛蕨群丛;群丛3：樟－海桐＋棕榈－井栏边草＋天葵群丛;群丛4：樟＋马尾松－海桐＋白花龙－络石＋阔鳞鳞毛蕨群丛;群丛5：樟－棕榈＋冬青－阔鳞鳞毛蕨群丛;群丛6：樟－栓皮栎－蕨群丛.其中Patrick丰富度指数R最高的是群丛1,Shannon-Wiener多样性指数H、Pielou均匀度指数J、Simpson多样性指数D均最高的是群丛4.研究区域内残存樟树群落,垂直结构上明显分为乔木层、灌木层和草本层三层.就各层的多样性指数而言,多数表现为草本层>灌木层>乔木层;而群丛4例外,表现为灌木层＞草本层＞乔木层.该研究可为武汉市残存樟树林植被的恢复提供基本的科学依据.     

江西九连山森林群落灌木层的物种组成与多样性分析

基于样地调查和群落学的分析,采用总优势度(SDR)、Shannon-Wiener指数、Simpson指数和群落均匀度Pielou指数研究了九连山主要森林群落灌木层的物种数量组成及其多样性.结果表明:(1)多样性指数:在所有样地中,多样性指数最大的是丝栗栲(Castanopsis fargesii)林(2.353),最小的是天然猴头杜鹃(Rhododendron simiarum)林(0.973);(2)均匀度指数:不同群落均匀度指数差异较小,最大的是次生毛竹(Phyllostachys pubeseerts)林(0.961),最小的是杉木(Cunninghamia lanceolata)林(0.564);(3)优势度指数:各群落优势度指数与多样性指数呈现出较大负相关趋势,优势度值最大的是杉木林(0.431),最小的是丝栗栲林(0.091).通过对比分析各群落不同层次物种的Shannon-Wiener多样性指数,各群落多样性指数的平均值以灌木层最大,乔木层最小,且同一群落中灌木层的种群密度明显高于乔木层,灌木层与乔木层之间的物种组成存在较大差异,预示着九连山森林群落间的种群动态变化及演替趋势.     

The entropy characters of point mutation

The biological diversity, which depends on the genetic material DNA, is the foundation for a species to survive and evolve. The entropy is the best measurement of biological diversity. Based on the single-parameter and the two-parameter models, here we established some differential equations about the point mutation of a DNA sequence with finite length, as well as some functions describing the processes of the variation in quantities of 4 kinds of bases （A, T, G and C） in the DNA sequence. At the molecular level, we discussed the entropy characteristics of point mutation. The results proved that a species maintained its entropy and evolved in the direction of the increasing biological diversity. In order to testify the theoretical results, we did a series of computer simulations of random point mutation in Matlab environment. The results were well consistent with the theoretical researches.     

修文石灰岩山地篦子三尖杉灌丛群落多样性研究

根据样方调查,对分布在黔中地区修文县六桶乡的篦子三尖杉群落的种类组成、外貌、结构特征和物种多样性进行分析.结果表明,在800m2的样地中,有维管植物92种,隶属52科79属.群落中乔木的个体数量很少,主要由灌木和草本组成,灌木层主要优势种为篦子三尖杉、火棘等.群落外貌常绿,结构简单.整个群落的物种丰富度Gleason指...     

赣江上游流域丰水期大型底栖动物群落的分布特征

2009年6—7月间从赣江上游流域的70个采样点共采集到大型底栖动物33种,其中软体动物门23种、环节动物门7种、节肢动物门3种,主要优势种为河蚬(Corbicula fluminea)和耳型河螺(Rivularia auriculata).为了较好地了解大型底栖动物的群落分布特征,根据支流汇流和生境状况,将上游流域划分成6个区域.对6个区域的多样性、多维尺度等的分析结果表明,不同区域间大型底栖动物的群落结构组成存在明显差异,其中受人为扰动最小的区域采集得到的底栖动物种类数最多,丰度和生物量最高,Shannon-Wiener多样性指数和Pielou均匀度指数均处于最高水平.     

室内信道中多极化MIMO系统的容量

针对室内多径信道,提出一种研究系统信道容量的方法,利用结合信道特征设计的三维多极化测量系统测量信道中多径入射信号的三维空间分布,代入天线方向图与入射信号进行空间积分计算出系统容量。利用该方法和系统对典型室内环境进行了测量,研究了真实的三极化天线组成的MIMO(multiple-input-multiple-output)系统的容量和摆放方向对多极化天线系统容量的影响。结果表明:三极化系统具有比单极化系统更优越的性能,可以利用该特性对室内环境中多极化MIMO系统的设计和布局进行优化以实现更高的系统容量。     

湘潭市郊冬季菜地生态系统杂草植物群落物种多样性的研究

对湘潭市郊菜地生态系统冬季期间杂草植物群落的物种多样性进行了初步研究，共出现18种，分属于10科15属，物种丰富度为9-15；Simpson指数为0.6401-0.7451；Shannon-Wiener指数为1.4852-1.7000；均匀度指数为0.5791-0.7145。结果表明：离市中心越远，物种多样性程度越高。