理论和实验DNA计算

本书是《自然计算系列》丛书之一。近10年来，DNA计算迅速地发展成为计算科学、生物学、工程和数学之间的新研究领域。此书全面地介绍DNA计算的整个领域、历史和发展，书中详细论述至今已有的所有理论模型和实验结果，也讨论了将来可能的发展。     

Interaction between poly（amidoamine） dendrimers and DNA studied by spectroscopic methods

The interaction between amino-terminated, and ethylenedtamine core poly（amtdoamine） （PAMAM） dendrimers and herring sperm DNA was investigated by various spectroscopic methods including UV spectroscopy, fluorescence spectroscopy, microscopic FTIR- and circular dichroism （CD-） spectroscopy. Ethidium bromide （EB） is used as a nucleic acid probe for this study. Experimental results show that PAMAM dendrimers can form stable complexes with DNA and the dendrimers bind to DNA sufficiently strong which cannot be displaced by EB, and we also found that the formation of the complexes can cause the conformation change of the DNA secondary structure. According to the Scatchard analysis, the association constant of PAMAM to DNA is calculated to be 2.53×10^4 mol/L^-1.     

生物电脑最新进展（二）

介绍了生物计算机研究的最新进展及DNA计算机在诊断和治疗疾病上的应用，指出生物计算机的进一步发展需要在DNA大分子关键技术、DNA实用系统等方面有重大的突破。     

Progress in non-viral gene delivery systems fabricated via supramolecular assembly

Gene delivery systems are one of key issues that limit the development of gene therapy. The novel non-viral gene delivery systems fabricated via supramolecular assembly have begun to show increasing promising and applications in gene therapy due to its suitable nanometric size,controllable structure and excellent biocompatibility. In this review, the fundamental and recent progress of non-viral gene supramolecular assembly is reviewed. Artificial viruses the future direction of non-viral gene delivery systems are also described.     

卵巢癌中的表观遗传修饰

介绍了在卵巢癌的发展和治疗中表观遗传学的重要性，特别强调了在卵巢癌中内源性和获得性耐药性遗传途径中异常的DNA甲基化和组蛋白去乙酰化的重要性．通过表观遗传治疗反转肿瘤抑制基因沉寂和其他参与药物级联反应的基因沉寂为出现耐药性的卵巢癌患者带来了新的希望．     

松枯梢病菌RAPD分子水平遗传距离分析

对来自中国、美国、英国、南非和智利的松枯梢病菌23个菌株进行RAPD分析。用12个引物共扩增出135个RAPD标记,其中多态性标记占96.3%。各菌株间的Nei相似系数UPGMA法聚类结果表明,国内外23个菌株可大致分为3个类群:来自智利的CWS41与所有菌株的遗传关系最远;来自中国的F2和J2次之;其他的国外菌株与国内菌株的遗传关系则较近。此次实验未将来自美国的B型菌株与其他菌株区分开。     

HBs和HCVc基因双顺反子质粒在BALB/c小鼠体内的分布

 采用注射含双顺反子质粒后,PCR法扩增不同组织中HBsAg和HCVc基因,同时检测HBV和HCV抗体应答水平.研究注射基因免疫用双顺反子质粒在小鼠组织中的分布.pcDNA3.0BApc154S₂S 1次注射BALB/c小鼠后,24 h内主要分布于血液、肝、脾、骨髓、淋巴结、注射部位肌肉、肺和肾等含血液丰富的组织中.注射后2 d主要在骨髓、血液和注射部位肌肉中存在.7 d后仅在注射部位肌肉中能检测出来,并可持续到第9周.组织切片镜检质粒注射初期肌肉细胞轻度浊肿,随后肌膜细胞轻度增生,未见其它明显的组织病理学变化.质粒多次免疫BALB/c小鼠未见明显的临床症状和病理组织学变化.质粒在小鼠体内不同组织存在时间不一致.     

六氮杂镍配合物与DNA相互作用的研究

合成了六氮杂镍的配合物(Ni(Ⅱ)L-1,8-二羟基乙基-1,3,6,8,10,13-六氮十四烷高氯酸镍).用电化学、荧光光谱及黏度等方法研究了配合物与小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用.电化学实验表明,Ni(Ⅱ)L在Tris-HCl缓冲溶液(pH=7.3)中的氧化还原是1电子转移过程,Ni(Ⅱ)和Ni(Ⅲ)配合物对DNA键合常数的比值(K2 /K3 )为3.2;荧光实验表明该配合物与DNA具有明显的嵌插作用,其结合常数为2.15×104L/mol;黏度实验表明Ni(Ⅱ)L可使DNA发生卷曲或扭结作用.实验均表明Ni(Ⅱ)L和DNA相互作用为部分嵌插和部分沟谷结合的混合模式.在H2O2存在下,凝胶电泳和高效液相色谱方法证明Ni(Ⅱ)L对ct-DNA和pBR322 DNA的劈裂能力均增强.     

克隆植物珠芽蓼基因组DNA的提取及RAPD鉴定

高原植物体内所含有的酚类、多糖、色素等次生代谢物质严重影响提取其基因组DNA的得率和纯度,是导致后续分子操作失败的主要原因.运用一种新改进的CTAB法对变色硅胶保存的高原植物珠芽蓼(Polygonumviviparum)叶片进行基因组DNA的提取,采取常温下沉淀DNA,增加洗涤沉淀的体积分数为70%乙醇用量和洗涤时间等措施,有效地去除了酚类、多糖、色素等物质的干扰,减少了褐化现象的发生.样品检测所得DNA片段均在48 kb左右,电泳谱带呈线状,无拖尾现象;紫外分光光度计检测,A260nm/A280nm值在1.7~1.9之间.RAPD扩增结果表明,此方法提取的DNA无论在质量和纯度上都较理想.     

p21对DNA聚合酶δ表达的抑制及其对MCF7细胞增殖和恶性表型的影响

细胞周期抑制因子p21能影响G1/S期转换和G2/M期进程，进而抑制细胞增殖．p21表达增高可以抑制多个DNA复制相关基因表达．DNA聚合酶δ是DNA复制中最为重要的复制酶，p21是否抑制它的表达，并通过这种作用影响细胞增殖及细胞恶性表型的变化，至今还没有报道．本研究观察到p21表达增强的MCF7p21细胞生长速率变慢，血清依赖性增强，细胞的锚定和非锚定依赖性增殖都受到抑制，表明p21表达增加对细胞增殖和细胞恶性表型的产生有重要作用．而Western blot检测发现在p21表达增高的MCF7p21细胞中，聚合酶δ（p125亚基）表达下降．p21高表达抑制POLD1启动子活性，这种抑制作用具有p21剂量依赖效应．这表明p21表达增高对细胞增殖的抑制和细胞恶性表型的影响可能是通过抑制在DNA复制中最重要的聚合酶δ（p125）的表达来实现的．这可能是p21对细胞增殖及恶性表型影响的一个新的调控机制．