蛋白质与蛋白质组学的研究进展

介绍了蛋白质、蛋白质组和蛋白质组学的基本概念，蛋白质组学的研究内容、方法技术、形成与发展。     

硼酸缓冲液应用于电泳实验的效果分析

血清蛋白醋酸纤维薄膜电泳是医学院校生物化学实验中的重要实验,传统巴比妥缓冲液具有毒性且不经济,该文旨在研究硼酸缓冲液的效果。采用DY—l型电泳仪配套水平电泳槽进行醋酸纤维薄膜电泳,控制电流时间和室内温度。显示硼酸缓冲液电泳可以分离出5条清晰的蛋白区带,并且电泳10次后仍然效果良好。由此得出离子强度为0.08的硼酸缓冲液完全可以替代巴比妥,无毒且经济,值得推广应用。     

EM发酵豆渣、鱼杂、鸡血及其粗蛋白含量测定分析

生产生活中产生的农副产品,如豆渣、鱼杂、鸡血等,含有大量的粗蛋白,可以作为一种物美价廉的饲料.本实验在已有研究基础上,利用环境微生物(environment microbe,EM)菌种对其进行发酵处理,采用凯氏定氮法(GB/T6432-94)检测其粗蛋白质含量.发酵结果表明:处理后的豆渣+麦麸、玉米粉+鱼杂、玉米粉+鸡血、玉米粉+豆渣4组材料的粗蛋白含量分别提高2.63、2.62、2.71和2.07个百分点,其营养价值得到有效提高;其中残留的有害物质如重金属、抗生素等能够得以降解消除;病原微生物如某些致病厌氧细菌和大肠杆菌等能得到很好的抑制;同时,饲料的适口性大大提高.     

蛋白质拓扑结构Alignment与相似性打分的算法

蛋白质结构分类是当今“后基因组”研究的热点 ,是探索蛋白质折叠 /功能关系的有效方法 .创立一种新型的分类体系就意味着对复杂的蛋白质结构的有了进一步的理解 .本文基于蛋白质结构域的拓扑结构 ,将拓扑量化 ,以Alignment矩阵方法对结构域进行比较 ,并按拓扑结构相似性对任意 2个蛋白质进行打分 .上述算法已经实现了程序化 .依此算法可将一组蛋白质进行新的分类 ,并可望将结构分类与生物功能的关系进行分析 .     

重组人骨形态发生蛋白-2和-6对人骨肉瘤细胞株MG63和U2OS的作用

为研究重组人骨形态发生蛋白rhBMP-2和rhBMP-6对人骨肉瘤细胞株MG63和U20S的作用,分别用含rhBMP-2和rhBMP-6及重组绿色荧光蛋白的条件培养液干预人骨肉瘤细胞MG63和U2OS,利用台盼蓝拒染法、TUNEL法、吖啶橙/溴乙啶(AO/EB)荧光双染法、Transwell小窒和碱性磷酸酶活性测定法分别检测细胞增殖、凋亡、迁移以及成骨分化能力的变化.结果显示与未实施任何千预的空白对照组和用rGFP干预实验对照组相比.rhBMP-2和rhBMP-6的干预致两种骨肉瘤细胞株:细胞存活率均随时间逐渐降低;凋亡率呈时间依赖性增加;穿膜数明显减低;碱性磷酸酶(ALP)活性逐渐增加.以上差异均有统计学意义(P＜0.01).表明rhBMP-2和rhBMP-6可抑制人骨肉瘤细胞株MG63和U2OS的增殖和迁移、诱导其凋亡和向成骨细胞分化.     

成都麻羊与四川肉用黑山羊地方品种产乳性能研究

测定成都麻羊和四川肉用黑山羊地方品种羔羊哺乳期母羊的产乳量、乳常规营养成分、乳蛋白组分和乳酪蛋白遗传多态性.结果表明,母羊哺乳期的产乳量(kg)成都麻羊、金堂黑山羊、乐至黑山羊、自贡黑山羊和建昌黑山羊相应分别为46.15±1.78,101.67±4.93,85.76±3.36,54.32±6.64和36.65±2.65,成都麻羊极显著低于金堂黑山羊、乐至黑山羊(P<0.01),而极显著高于建昌黑山羊P<0.01)与自贡黑山羊差异不显著(P>0.05);乳中常规营养成分含量(g/L)均较高,范围乳脂为58.59～60.52、乳蛋白为44.18～46.37和乳糖为44.00～47.30;经产母羊常乳主要蛋白组分的相对含量(%)范围α-La为5.35～5.80,β-Lg为14.46～15.18,CN为70.04～71.01,IgG为7.04～7.31,SA为2.02～2.15,品种间差异不显著(P>0.05);酪蛋白电泳染色显示出α-CN和β-CN图带,α-CN均呈现4种不同的带型αS1-CN(H),αS1-CN(L)、αS2-CN(CC)型和αS2CN(CD),其中均以αS2-CN(CD)占优势.β-CN呈现单态,带型为β-CN(AB).     

荒漠沙蜥血清蛋白含量的年周期变动

对荒漠沙蜥（Phrynocphalus przewalskii)血清蛋白仿及血清蛋白组分的周期变化进行了测定,测定时间为4－10月的每月中旬及1月中旬（进行人工冬眠的蜥蜴）,血清总蛋白含量采用紫外分光光度法测定,血清蛋白组合组分采用醋酸纤维素薄膜电泳分离,然后用双波长色谱扫描仪扫描,计算相对含量,测定结果表明,荒漠沙蜥的血清总蛋白含量在深冬眠期的1月最高,为81．45g/L,4月出 一进入繁殖季节,其含量开始下降,夏季（6－8月）降为43．81g/L,其中7月最低,为38．07g／L,秋季的含量略低于春季的含量,但差异不显著（P＞0．05）,在冬 眠前（10月下旬）及冬眠期（1月中旬）,雌性的含量高于雄性,且差异显著（P＜0．05）,在出眠后的繁殖季节雄性的含量高于雌性,在冬眠季节清蛋白的比例相对增加,而球蛋白的比例相对减少。     

芜菁皱缩病毒P38蛋白的原核表达及抗血清的制备

从感染芜菁皱缩病毒(TCV)的拟南芥中提取总RNA,通过反转录PCR(RT-PCR)扩增得到TCV的外壳蛋白基因P38.在目的基因ORF框两边引入酶切位点BamHⅠ和SacⅠ,并连接到表达载体pET30-a上,导入大肠杆菌BL21(DE3)中,37℃经0.5mM/L IPTG诱导6h后获得了分子量约为48kD的融合蛋白.经Ni-NTA纯化目的蛋白,注射大白兔制备抗血清.Western blot结果表明制备好的抗血清能成功检测感染TCV的拟南芥.     

近红外光谱技术对液态奶制品中乳糖、脂肪及蛋白质的定量检测

用InfraXact多功能近红外分析仪和正交实验设计,研究了不同预处理和校正方法对建模效果的影响,建立了液态奶制嘉中脂肪、乳糖和蛋白质质量含量的定标模型。利用目标函数法对模型进行评定,并对选出的最优模型的适用性进行验证．结果表明,最优模型对糖、脂肪和蛋白质的相对标准偏差分别为4．12％,7．04％,9．61％,相对误差分别为2．82,6．28,2．72．正交实验方法能综合考虑不同预处理方法和校正方法对模型建立的影响．近红外光谱分析法能够实现对牛奶中脂肪、乳糖和蛋白质质量含量进行快速、无损的定量检测．     

基于Attention Bi-LSTM模型构建蛋白质诱饵序列库

利用计算机技术在海量质谱数据中鉴定蛋白质序列是蛋白质组学研究最基本且重要的任务之一,诱饵序列库构建的好坏是蛋白质鉴定质量控制成功的关键之一。发展了基于注意力机制-双向长短期记忆神经网络(Attention Bi-LSTM)的诱饵序列构建方法,整体研究基于编码-解码框架,采用双向长短期记忆神经网络在解决传统循环神经网络梯度消失问题的同时,可以捕获前向后向更多依赖信息对处理序列数据更加有优势;引入注意力机制提高模型对目标序列库和诱饵序列库相关程度的关注度;并与目前常用的随机和反转算法进行比较。结果显示,基于Attention Bi-LSTM模型构建的诱饵序列库能满足理想诱饵序列库的各项特征要求;在不同大小实验数据集以及谱图、肽段、蛋白3个层面对比分析,显示构建的诱饵序列库与其他方法比具有更好的灵敏性。因此,Attention Bi-LSTM是一种很有潜力的诱饵序列库构建方法。