胰岛素受体底物1和2的氨基酸网络特征研究

在胰岛素对脂质代谢的调控作用中,胰岛素受体底物2(IRS2)比胰岛素受体底物1(IRS1)发挥了更加重要的作用。为研究两者发挥作用的差异,分别选择IRS1、IRS2的4个结构数据,构建氨基酸相互作用网络,计算整体拓扑特征,分析网络的hub氨基酸差异,计算7种中心性特征。实验表明,IRS2氨基酸相互作用网络的平均度及聚类系数高于IRS1的1QQG、5U1M、6BNT;IRS2中的hub氨基酸ATP、LYS、ILE是IRS1所没有的;除子图中心性和特征向量中心性外,IRS2网络中节点的其他中心性特征均优于IRS1。结果表明,IRS2的氨基酸相互作用网络中,节点聚集程度较高,更容易形成模块,更容易到达其他节点,与其他节点发生通讯。可以推测:IRS2在胰岛素对肝脏的代谢调控中比IRS1发挥着更加重要的作用。     

基于 LibSVM 的 CKSAAP 蛋白特征提取预测水稻蛋白质磷酸化位点

本文从swiss-prot中选取经过试验验证的水稻蛋白质磷酸化位点数据作为训练集合，应用蛋白质序列特征提取方法Composition of k-spaced residues pairs （CKSAAP），为利用SVM算法构建专门针对水稻蛋白质磷酸化位点的预测工具做准备。 CKSAAP方法利用在序列片断中残基的K个间隔距离的组成，进一步反映了残基之间的相关性。本文利用LibSVM软件包对已通过改进过得CKSAAP方法特征提取出来的数值特征对磷酸化位点进行预测，从而为之后构建水稻蛋白质磷酸化位点的预测工具做准备。结果表明，本文基于SVM和CKSAAP方法的水稻蛋白质磷酸化位点预测在丝氨酸，苏氨酸和酪氨酸的平均预测准确性为80．638％，马修斯系数为0．611。与PlantPhos和Musite的预测性能的对比结果显示，在磷酸化各氨基酸位点的预测性能高于PlantPhos及Musite。     

《厦门大学学报自然科学版》2014年第53卷(总第238～243期)总目次

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氨基酸的有关知识

氨基酸是蛋白质的组成单位,蛋白质是生命活动的物质基础。本文就氨基酸的性质进行了系统的介绍。     

糖类遗传与生命起源

从遗传学角度探讨了糖类与生命起源，讨论了遗传学上的再认识，提出糖类在遗传学上扮演着重要、核心的角色、糖类是生命起源物质，基因是糖类衍生物。生命诞生过程可能是：先有糖类、然后有氨基酸和碱基；磷酸及其盐类既是生命物质的组成部分、也是催化剂，阳光或地热为能源，于是诞生了基因。生命体是分子相互作用、有序组合、自我调控的耗散体系。     

对甲苯磺酰氨基酸甲醇或2,2-联吡啶混配Cu(Ⅱ)配合物的电化学合成及表征

采用金属Cu为"牺牲阳极", 在含配体对甲苯磺酰L-异亮氨基酸(H2L)的甲醇溶液中电解合成了[Cu(L) (2CH3OH)]配合物.当向含配体的甲醇溶液中加入2,2′-联吡啶时,电解合成了[Cu(L) (2,2'-bipy)]配合物.利用元素分析、红外光谱、紫外光谱、热分析对配合物进行了表征.测试了铜电极在溶液中的电化学行为和配合物的电化学性质.     

水溶性SalenMn(Ⅱ)的合成及其对氨基酸的分子识别研究

本文合成并表征了手性席夫碱配体(Salen H2)及其水溶性的锰配合物[Salen Mn(Ⅱ)].用紫外-可见光谱滴定技术测定了主体Salen Mn(Ⅱ)与客体氨基酸(苯丙氨酸和苏氨酸)对映异构体分子间进行识别作用的缔合常数.结果表明:SalenMn(Ⅱ)与系列客体氨基酸作用的配位比均为1∶2,主客体反应均为放热、熵减...     

地球生命或源自太空

美国航空航天局（NASA）戈达德宇航中心科学家不久前于小行星的陨石样本中发现了氨基酸异缬氨酸,且其在富碳样本中绝大多数以左旋形态存在。鉴于氨基酸对生物体的重要性和地球上的＂左型氨基酸之谜＂,该研究小组认为极可能是小行星岩石将生物原材料带到地球,成为了一项佐证＂地球生命起源于太空＂的新证据。生命的产生、存在和消亡无不与蛋白质有关系,而蛋白质的基本单位就是氨基酸。据领导此次研究的戈达德宇航中心科学家丹尼尔·格拉文于报告中描述,他们研究的着眼点是氨基酸的分子结构。     

冀东地区10个谷子品种籽粒矿质元素和氨基酸主成分及聚类分析

为确定冀东地区谷子籽粒中矿质元素和氨基酸的质量分数,选择河北、山东、河南等3个省份的10个谷子品种(冀科谷1号,济谷19,济谷20,冀谷41,济谷17,豫谷18,济谷18,济谷21,豫谷1号,冀谷19),采用全谱直读等离子发射光谱仪和氨基酸自动分析仪测定了籽粒中矿质元素和氨基酸的质量分数,采用IBM SPSS Stat...