p53基因在小鼠胚胎发育过程中的表达

以E9日龄至E14日龄昆明种正常小鼠胚胎为材料,利用质粒扩增的、地高辛标记的基因探针在组织切片上进行DNA-mRNA 分子原位杂交,研究了p53基因在小鼠胚胎发育过程中的表达.结果表明, p53基因不参与E9和E10日胚胎发育中的器官原基形成,参与器官的进一步分化成熟过程.这些器官主要有眼、脑、心、肺、脊柱和面颌骨,肝组织的发育与其无关; p53基因一方面参与胚胎发育中的细胞周期调控,另一方面也参与了某些与细胞周期无关的过程;不同的器官有不同的细胞周期调控机制.     

新型钙调蛋白拮抗剂(EBB、BB、B_0)对CaM基因表达的影响

本文初步探讨了小檗胺 ( B0 )及其衍生物 ( EBB胺 BB)对 Ca M基因表达的影响 .结果表明三种化合物不仅能拮抗 Ca M的调控功能 ,而且对 Ca M基因表达系统亦有抑制作用 .为进一步探讨 Ca M拮抗剂的分子机制具有一定的参考价值 .     

刚毛柽柳ThPCS 1基因克隆与镉胁迫应答分析

[目的]探究刚毛柽柳(Tamarix hispida)植物络合素合酶(phytochelatin synthase,PCS)基因ThPCS1的镉胁迫应答功能.[方法]通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)对刚毛柽柳ThPCS1基因进行克隆;通过BioEdit、MEGA 5.0等软件对ThPCS1蛋白进行生物信息学分析...     

一种改进的基因表达数据分类方法

从分类算法和特征基因选择两个方面研究基因表达数据的分类,将传统的Support Vector Machines(SVM)算法和K-nearest neighbor(KNN)算法两者结合成为一种应用于基因表达数据分类的算法,并针对基因表达数据分类数据集“样本少,维数高”的特点,提出了一种改进的基于相关性的递归特征消除算法(简称为C-RFE),消除了数据冗余．实验结果表明,新方法可有效提高分类准确率和特征选取的效率．     

一种基于基因表达式程序设计的新算法

基因表达式程序设计是一种基于基因组和表现型组的新型遗传算法,该算法在运行时具有很高的运行效率,实验表明在求解很多问题时比遗传程序设计优越两个数量级以上.通过对基因表达式程序设计的变异算子进行分析,发现在个体变异过程中存在着大量的基因漂移现象,这些漂移的基因一方面造就了种群的多样性,但是另一方面也降低了算法的效率,阻碍了算法精度的提高.为此,构造了一种新的算子--漂移抑制算子,通过在基因表达式程序设计方法中加入此漂移抑制算子构造出一种新的算法-基因漂移抑制算法(Gene Drifting Suppression Algorithm Based on Gene Expression Programming, GDSA-GEP),该算法在保持种群多样性的同时,能有效地控制基因的过度漂移.实验结果表明,新算法能有效地提高问题的求解精度.     

一种寻找最优尺度因子法在基因表达谱数据的SVM分类中的应用

基因表达谱数据分布不平衡、噪声巨大,当用σ值很小的二阶软间隔高斯核支持向量机分类的时候,容易使大多数训练数据被分到占统治地位的类中。因此,B rown等认为,为了分别控制两类错误数,可以在核矩阵K中增加对角矩阵λn+NI。通过选择合适的λ,可以使属于占统治地位的类的样本上产生较小的拉格朗日乘子;而处于次要地位的类的样本上产生较大的拉格朗日乘子。但是,目前没有统一的方法选择λ。因此,提出了一种根据b值确定λ的最优值的方法。实验表明,该方法的分类效果在同等条件下好于传统的方法。     

基于基因表达式编程的股票指数时间序列分析

基因表达式编程（GEP）是遗传算法研究的新分支．针对股票对象的特点,提出了适应股票规律的GEP—STOCK模型,包括n时段—STOCK—GENE,STOCK—fitness以及STOCK-GEP算法,并以上海证券交易指数时间序列数据为对象做了实验．进行了误差和指数涨跌分析．实验结果表明GEP—STOCK模型预测精度较高,20d的平均绝对误差为11．08,平均相对误差为0．64％．从涨跌情况预测来看,模型对6d后指数的涨跌判断,正确率高于80％以上．     

果蝇精子发生中CG15899的基因表达

为了检测在雄性果蝇中CG15899基因是否有特殊的表达,利用PCR的方法得到CG15899的基因片段,并用DIG标记PCR产物,将其与野生型雄性果蝇melanogaster的精巢进行原位杂交,最后在果蝇精巢的细胞质中产生了较强的信号．实验结果表明,CG15899基因在精原细胞和初级精母细胞中表达．     

IGF-1对绵羊皮肤中GHR、IGF-1、IGF-1R、kAP3.2和KAP6-1基因表达的影响

选取36只健康、体况一致的新疆细毛羊随机分成6组。在每只羊的左侧肩胛部皮下局部注射0．5mL（10ng／mL）的IGF-1,右侧肩胛部皮肤为未注射IGF-1的对照组,然后分别于第0、3、6、9、12、50d采集各皮肤样品,用反转录多聚酶链式反应（RT-PCR）方法,定量分析绵羊皮肤中生长激素受体（GHR）、胰岛素样生长因子1（IGF-1）和胰岛素样生长因子1型受体（IGF-1R）、角蛋白关联蛋白KAP3．2和KAP6-1mRNA的相对丰度。试验结果表明,IGF-1对GHR基因的表达有下调的作用,对IGF-1、IGF-1R基因的表达没有显著的影响,而对KAP3．2、KAP6—1基因的表达具有显著的促进作用。说明IGF-1促进绵羊角蛋白关联蛋白基因的表达可能是通过生长轴以外的其他途径实现的。     

基于转录因子信号识别基因的表达水平

真核生物的基因表达调控过程十分复杂,各种转录因子通过与基因上游特异性序列结合协同地对靶基因的表达水平进行调控.以人类GM12878细胞系为研究对象,基于表达谱RNA-seq数据构建了高低表达基因集合,利用74种转录因子(TF)的ChIP-seq峰值数据计算了转录因子和靶基因的关联分数(TFAS),进而根据转录因子间的相...