BTEX污染物的厌氧降解机制及微生物特性分析

近十多年来国外研究者对单环芳烃苯系物(主要包括苯、甲苯、乙苯及二甲苯,合称为BTEX)的微生物厌氧降解研究做了大量工作,发现BTEX在NO3-,Mn4+,Fe3+,SO42-,CO2等电子受体条件下能够进行降解,已陆续分离到许多BTEX厌氧降解菌,并对其相应降解酶的生化性质进行了鉴定,相关的基因被克隆、鉴定和改造.通过对BTEX化合物的厌氧生物降解过程、代谢机制与途径、参与降解的主要微生物、相关降解酶及基因等进行综述与分析,提出了BTEX污染物厌氧降解研究中尚需进一步研究的问题.     

Expanded flux variability analysis on metabolic network of Escherichia coli

Flux balance analysis, based on the mass conservation law in a cellular organism, has been extensively employed to study the interplay between structures and functions of cellular metabolic networks. Consequently, the phenotypes of the metabolism can be well elucidated. In this paper, we introduce the Expanded Flux Variability Analysis （EFVA） to characterize the intrinsic nature of metabolic reactions, such as flexibility, modularity and essentiality, by exploring the trend of the range, the maximum and the minimum flux of reactions. We took the metabolic network of Escherichia coli as an example and analyzed the variability of reaction fluxes under different growth rate constraints. The average variability of all reactions decreases dramatically when the growth rate increases. Consider the noise effect on the metabolic system, we thus argue that the microorganism may practically grow under a suboptimal state. Besides, under the EFVA framework, the reactions are easily to be grouped into catabolic and anabolic groups. And the anabolic groups can be further assigned to specific biomass constitute. We also discovered the growth rate dependent essentiality of reactions.     

Ca^2＋对番红花叶片中活性氧代谢的影响

以单子叶植物番红花为材料,研究了钙离子对其活性氧代谢的影响.随钙水平降低,除SOD外,膜保护酶(POD,CAT)和抗氧化剂(AsA)均一直下降,导致O-2.产生速率、膜脂过氧化作用、质膜透性增加.说明钙离子对番红花活性氧代谢有明显的影响.     

极低频磁场对两种瘤细胞代谢活力的影响

采用ＭＴＴ比色分析法研究低频磁场对ＳＨ－ＳＹ５Ｙ和ＰＣ－１２瘤细胞代谢活力的影响,实验结果表明：在相同参数的磁场作用下一种不同类型细胞代谢活力的变化不同,ＳＨ＿ＳＹ５Ｙ和ＰＣ－１２两种瘤细胞都对磁场振幅和频率敏感,在某些磁场参数下磁场照射能够使细胞代谢活力有明显降低或升高;振幅和频率不同的磁场,即使都对细胞代谢活力有影响,磁场作用的大小也存在差异,本研究证实极低频磁场在某上可能抑制或增强瘤细胞线粒     

替硝唑在唾液和血浆中浓度的相关性探讨

目的：探讨替硝唑在唾液浓度和血浆浓度的相关性。方法：８ 名健康男性志愿者交叉口服２ ｇ 的替硝唑胶囊和片剂,用 Ｈ Ｐ Ｌ Ｃ 法测定其在血浆中浓度经时过程及相应时间点的唾液中浓度。结果：替硝唑胶囊的血浆及唾液中的ｔ１／２ｋａ 分别为（０４７ ±０２４） 、（０６３ ±０３８）ｈ ,ｔ１／２ｋｅ 分别为（１３７１ ±１５２） 、（１３７８ ±３３７）ｈ , ρｍａｘ 分别为（５２０７ ±９１１） 、（４８１０ ±８０１） μｇ／ｍ Ｌ, Ａ Ｕ Ｃ 分别为（１ ０９２９８ ±１１１８３） 、（１ ０１１２８ ±１１５２０）μｇ·ｈ／ｍ Ｌ;替硝唑片剂的血浆及唾液中的ｔ１／２ｋａ 分别为（０８６±０６７） 、（０７８ ±０５２）ｈ ,ｔ１／２ｋｅ 分别为（１４１９ ±１９５） 、（１３００ ±２０７）ｈ ,ρｍａｘ 分别为（５１０７ ±１０３２） 、（４９０９ ±９２７）μｇ／ｍ Ｌ, Ａ Ｕ Ｃ 分别为（１ １２３００ ±１２８２５） 、（１ ０４４１５ ±１７９５４）μｇ·ｈ／ｍ Ｌ。结论：替硝唑在唾液和血浆中的药代动力学参数相似,均无显著性差异,替硝唑唾液与血浆浓度呈显著正相     

蓝藻水华与淡水鱼类的生态相互作用研究进展

鱼类是淡水生态系统的重要组成部分.近年来水体富营养化和蓝藻水华暴发导致的水环境恶化、适宜栖息地丧失等生态问题,对鱼类生存及渔业经济带来巨大威胁和影响.蓝藻和鱼类的生态作用是相互的,利用鱼类调控蓝藻过度增长的生物操纵技术在某些富营养化水体治理过程中取得了一定效果.在此背景下,全面评估蓝藻水华对淡水鱼类种群的影响,以及鱼类...     

整合组学数据的代谢网络模型研究进展

基因组规模代谢网络模型(genome-scale metabolic model,GEM)是根据化学计量平衡原理,基于基因-蛋白-反应三者关联,建立包含细胞生长必需的生化反应数学模型.细胞代谢网络存在复杂的调控,通过基因和蛋白表达量及代谢物浓度变化调节代谢反应通量,而这些数据无法直接反映代谢反应的通量.GEM研究面临的...     

乳酸菌基因组代谢网络模型的研究进展

基因组代谢网络模型(genome-scale metabolic models,GEMs/GSMM)是基因组规模的细胞生化反应网络,可以定量描述基因与表型的关系,广泛应用于系统生物学、代谢工程、环境科学等领域。微生物基因组代谢网络模型是基于微生物基因组构建的生理生化知识库,通过数学模型实现对目标微生物生理生化反应的模拟,已成为研究微生物代谢调控的重要工具。基因组代谢网络模型的构建步骤通常包括构建模型草图、人工精炼、模型转换、验证评估4个阶段。在介绍以模式微生物(大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、酿酒酵母)为代表的微生物基因组代谢网络模型发展过程基础上,重点聚焦乳酸菌基因组代谢网络模型的研究现状,系统介绍了已构建的乳酸菌基因组代谢网络模型及其应用。对乳酸菌基因组代谢网络模型的发展方向进行了展望,提出未来乳酸菌基因组代谢网络模型的研究应在现有模型的基础上构建更高质量的代谢与大分子表达模型和泛基因组模型,为乳酸菌的研究提供更高效的工具。     

NaCl处理下全缘冬青和红果冬青根系的转录组活性比较

【目的】研究全缘冬青(Ilex integra)和红果冬青(I. purpurea)的根系在NaCl胁迫处理中的转录组活性差异,为进一步研究二者耐盐性差异的生理学机理奠定基础。【方法】以内含250 mmol/L NaCl的1/2浓度霍格兰德溶液对全缘冬青和红果冬青的两年生扦插苗进行盐胁迫处理,采集经0(盐处理前)、6和72 h盐处理的根系样品,提取总RNA,进行转录组测序,组装转录本,筛选差异表达基因,分析两种冬青根系中的功能富集通路和特定代谢途径的基因表达变化。【结果】全缘冬青根系盐处理6 h的差异表达基因数量为2 616,盐处理72 h为1 802;而红果冬青根系盐处理6 h的差异表达基因数量为1 831,盐处理72 h为3 490。全缘冬青盐处理6和72 h根系中共同的KEGG富集途径为植物激素信号转导、亚油酸代谢、类胡萝卜素生物合成和甜菜红素生物合成,红果冬青根系6和72 h盐处理共同的KEGG富集途径为植物激素信号转导、苯丙烷生物合成和类胡萝卜素生物合成。甜菜红素生物合成和亚油酸/花生四烯酸代谢为盐胁迫处理全缘冬青根系中特有的富集代谢通路。全缘冬青中受盐胁迫正调控的过氧化氢酶基因数多于红果冬青的,并且在盐处理下其表达水平远高于红果冬青的。【结论】全缘冬青根系较强的耐盐性可能与植物激素信号转导、类胡萝卜素生物合成、甜菜红素生物合成和脂肪酸脂类代谢等生理过程相关联;盐处理下过氧化氢酶基因的高效表达也可能是全缘冬青根系具较强耐盐性的因素之一。     

木栓质的结构组分、生物合成及其功能的研究进展

木栓质是一种主要由含氧脂肪酸和芳香族化合物组成的疏水性生物聚合物.木栓质聚合物的合成起始于多种C16～C24链长度的脂肪酸,通过脂肪酸伸长和氧化还原过程,形成木栓质单体,经过内质网和质膜的运输,在细胞壁内侧沉积形成木栓层.木栓质主要沉积在根部的内皮层和周皮内,通过形成重要的机械屏障,控制根部水分和营养物质的运输,防止病原体的入侵和有毒气体的扩散等.木栓质的沉积可以帮助植物抵御各种胁迫,提高根系的保水能力,对植物适应复杂多样的外界环境从而保证其正常的生长发育等具有重要作用.本文系统综述了木栓质的沉积定位、化学成分分析与检测、生物合成及其调控的相关动态,重点总结了木栓质的生物功能,可为木栓质的深层次研究和开发应用提供重要的理论基础.