微生物多样性研究技术进展

微生物资源丰富,开发潜力巨大,是生命科学发展的主要动力之一.本文介绍了几种常用的研究微生物多样性的分子生物学技术,主要包括:16S rDNA测序、DGGE/TGGE/TTGE、T-RFLP、SSCP、FISH、印记杂交、定量PCR、基因芯片等,并对微生物多样性研究技术的未来发展进行了展望.     

基因芯片癌与癌旁组织分析中药品混合对结果的影响

基因芯片技术已经广泛地应用到生物科学与医学研究的多个领域中.由于实验费用的制约,在使用芯片数目较少的情况下,一些研究者倾向于把经过同一种处理的多个个体的RNA进行混合,希望能消除个体差异.但应用一个研究肿瘤的具体例子,比较单个个体与多个个体的RNA混合后得到的基因芯片的结果表明,多个样品的RNA混合后得到的结果和单个样品得到的结果,无论从正确率、假阳性、假阴性来比较,在统计学上都没有明显差异,因此：结合多个因素考虑,建议进行基因芯片分析的RNA样品不用进行混合.     

纳米膜与硅烷化表面修饰相结合制备基因芯片载体

将洁净的玻片,在以溶胶-凝胶法制备的TiO2胶体溶液中浸渍提拉成膜,再将组装纳米薄膜的玻片进行硅烷化处理.用傅里叶变换红外光谱、扫描电镜、荧光显微镜对样品进行表征.结果表明,带氨基或醛基的“手臂分子“可以固定在纳米薄膜组装的玻片上,并且荧光信号强于仅用硅烷化处理的玻片.本研究建立的芯片载体表面化学修饰方法有较高的效率,操作简便易行,具备广阔的应用前景.     

用基因芯片研究苦丁茶甙对K562细胞基因表达的影响

以人红白血病K562细胞株为材料，应用基因芯片技术研究苦丁茶甙对人红白血病K562细胞作用前后基因表达的差异，以诱导分化药物羟基脲处理作为正对照，分别提取药物处理前后细胞RNA进行逆转录cDNA，使获得的cDNA分别标记上Cy3和Cy5两种荧光物质；然后与由1632条cDNA片段制作的基因表达谱芯片杂交，经扫描及对获得的数据用相关软件分析，确定K562细胞经苦丁茶甙处理前后差异表达基因48条，有41条与羧基脲处理相同，其中上调表达的基因有32条，下调表达的基因有16条，这将为进一步建立基因芯片技术药物筛选模型奠定基础。     

基因芯片技术在环境微生物分子生态学研究中的应用

基因芯片技术是20世纪90年代发展起来的一门高新技术,其作为不依赖于微生物培养、高通量和高灵敏度的新技术在环境微生物分子生态学研究中得到广泛的应用。环境微生物生态学研究主要包括环境中微生物的种类、数量、功能、动态变化规律以及环境因子、微生物种群和数量对微生物及环境的影响。探讨了基因芯片技术在微生物群落和多样性、微生物功能基因以及微生物群落动态变化和相互作用关系等环境微生物分子生态学研究中的应用。     

基因芯片设计及数据分析软件系统

基因芯片是提取生物分子信息的一种新技术,该技术是分子生物学与电子信息科学交叉的产物。基因芯片在基因型分析、基因表达监控和疾病检测方面有着重要的应用。本论分析基因芯片中的信息处理问题,介绍一个高密度基因芯片设计及数据分析软件系统,该系统包括基因芯片探针设计、芯片优化、杂交图像处理和检测结果分析等功能。     

当代生命科学及其相关学科的研究

介绍了超快速冷冻胚胎移植试管婴儿、世界首只克隆狗、组织工程再造技术、使植物不产生花粉的生物技术、基因芯片的开发以及试管卵巢研究的新进展,并展望了它们的应用前景。     

基因芯片对胃癌和食管癌基因表达谱的对比研究

目的 对比研究胃癌和食管癌的基因表达谱,筛选各自特异性基因.方法 利用基因芯片技术对两种上消化道常见肿瘤胃癌和食管癌的基因表达谱进行分析.结果 筛选出在胃癌中差异表达的基因34个.和21个在食管癌中发生差异表达的基因,最后发现在两种肿瘤组织中都发生显著变化的基因有4个.另外,对这些肿瘤相关基因的表达水平进行聚类分析,可以很清楚地将两种肿瘤组织及正常组织区分开来.结论 利用基因芯片技术可以高通量地筛选出肿瘤组织差异表达基因.通过少量特异性基因的表达水平,可以用来区分不同的肿瘤组织,对将来的基因诊断和基因治疗有一定的参考价值.     

2008基因芯片、计算机和作物国际学术会议

2008基因芯片、计算机和作物国际学术会议于2008年9月26～27日在浙江大学紫金港校区生命科学院召开,会议主办方为浙江大学和英国艾塞克斯（Essex）大学。会议共邀请来自英国艾塞克斯大学、诺丁汉（Nottingham）大学、利兹（Leeds）大学、沃里克（Warwick）大学、布里斯托尔（Bristol）大学、伦敦（London）大学,美国伊利诺斯（Illinois）大学,     

建立基因协同作用算法解析大鼠肝再生中基因表达丰度预示的细胞增殖活动

随着生物高通量分析技术的发展,获得基因组／蛋白组数据已较易实现．然而解析这些数据的生物学意义尚有不少困难,亟待克服．从生理反应的多样性、多步骤性、可逆性、循环性、重复性、网络性、可控性、适应性等特点入手,以基因表达丰度为基础,根据时间序列分析原理,应用皮尔森相关系数建立了两种描述基因协同作用的谱函数E。（￡）和巨,用它们分析基因表达丰度、表达变化预示的大鼠肝再生中肝细胞的增殖活动．结果显示,大鼠肝再生的进展阶段,即PH后12～72h肝细胞的增殖活动显著强于对照．进一步分析相关文献资料发现,上述结果与文献报道一致,表明在解析生物高通量分析数据的生物学意义方面,基因协同作用算法有一定应用价值．