上海交大发现中国人2种糖尿病易感基因

近日，上海交大附属第六人民医院贾伟平教授课题组运用基因芯片技术，发现了两种中国人群Ⅱ型糖尿病易感基因。该项研究成果最近先后被国际糖尿病界两大权威杂志——欧洲糖尿病学会官方月刊《糖尿病学》（Diabetoloqia）和美国糖尿病学会官方月刊《糖尿病》（Diabetes）在线发布。     

占领生命科学制高点——我市启动基因芯片专项研究

基因芯片是九十年代初发展起来的一项新技术,是生物学和电子学交叉领域中的一个新概念.基因芯片技术是基因组学发展的产物,与基因组学、生物信息学存在着相互依赖、相辅相成的关系.     

基因芯片技术在现代教育中的应用——儿童个性化教育

随着现代生物技术的进一步发展,我国科学家已经可以利用尖端的基因芯片技术,对影响人取得重大成就最为密切的八个方面、四十项基因进行检测;通过芯片检测结果,让家长能及时了解孩子的基因信息,预测儿童最初的性格和天赋,根据儿童所具有的遗传特性,创造合适的生活环境,制定针对性的教育计划,充分发挥儿童的优势天赋,取长补短,因材施教,培养儿童健康成长,为儿童的个性化化教育提供科学的理论依据.     

全内反射式基因芯片荧光检测系统的研制

荧光信号的检测是基因芯片技术环节中的一个关键．目前，商业化的检测设备价格昂贵，限制了基因芯片技术的推广和普及．本实验组在开发廉价、便携式检测设备的过程中，设计出全内反射式基因芯片荧光检测系统，该系统与传统的落射和透射式激发方式不同，采用全内反射式激发光路，同时改造了柯勒照明，实现了激发光路和荧光采集成像光路的完全分离，有效提高了荧光图像的对比度和系统的灵敏度，降低了对元器件性能的要求．该系统设计新颖、结构紧凑，将具有广阔的市场前景．     

广义预测控制在基因芯片微点阵仪环境控制中的应用

给出了基因芯片微点阵仪控制系统的设计、硬件结构及软件实现,并用自适应广义预测控制(GPC)对基因芯片微点阵仪的温、湿度进行高精度控制,取得了很好的控制效果.     

低功率毫米波辐射对HL60细胞基因表达谱的影响

摘要：研究低功率毫米波辐射对HL60白血病细胞基因表达谱的影响。应用基因芯片检测频率41.32GHz的毫米波辐射HL60白血病细胞和未辐射毫米波HL60白血病细胞组基因表达差异,并进行RT-PCR方法验证IL-7、EGF和LGALS3基因变化。 结果与对照组比较,毫米波辐射60min后,HL60细胞增殖,基因芯片检出基因表达上调18个和下调306个,在下调的基因中,RT-PCR 检出IL-7、EGF和LGALS3基因下调与基因芯片结果一致。表明低功率毫米波可导致HL60细胞基因表达谱发生变化,这些变化的基因与HL60细胞增殖功能相关。提示基因表达变化是低功率毫米波辐射HL60细胞所致生物学反应的重要因素。     

用于SARS冠状病毒检测的60 mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用

设计并应用60 mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测. 根据寡核苷酸基因芯片的原则设计出30条60 mer的寡核苷酸片段, 覆盖SARS冠状病毒(以最先提交全序列的TOR2株作为参考, GenBank登录号: AY274119)全基因组, 点样制备成12×12的寡核苷酸基因芯片, 从临床诊断SARS患者痰液标本抽提病毒RNA, 采用限制性显示技术进行标记, 将标记好的样品与芯片杂交, 洗脱, 扫描. 初步探索寡核苷酸芯片诊断SARS冠状病毒的可行性. 杂交结果表明, 来自SARS患者样品与芯片上的多个SARS探针杂交, 出现了明显的荧光信号; 阴性和空白对照探针上没有杂交信号, 而对照样品仅与3个SARS探针有杂交. 由此可知, 采用60 mer寡核苷酸基因芯片可以从基因水平实现对SARS冠状病毒多段序列的平行检测, 对于提高检出率有一定意义, 此外, 尚可用于监测在发病过程的各个阶段中病毒基因的活动状况.     

主分量分析法和K-近邻法应用于基因芯片数据分析

应用主分量分析法和K-近邻法对基因芯片(微阵列)数据进行分析.主分量分析法是一种提取海量数据有效特征的有效方法 ,可以获得与原来基因芯片数据更为接近的成分的提取特征的效果.实验结果 表明,用主分量分析法预先对数据处理可以提高基因芯片数据分析的准确性.     

基因芯片图像高亮噪声处理算法研究

基因芯片图像噪声处理决定了后续处理与分析的精度和准确性.高亮斑点噪声是一种亮度很高、成块状的特殊噪声,应用传统噪声处理方法无法滤除.针对高亮噪声的特点,首先利用形态学碟形结构元素进行开运算来评价图像是否含有噪声,然后利用阈值分割去除噪声.提出两种阈值获取方法,一种是基于最大类间方差的自适应获取方法,一种是固定阈值法.通过大量定性和定量实验比较分析,结果表明,两种方法都可以有效除高亮斑点噪声.     

锌指结构基因ZNF302序列的克隆与表达谱分析

从人脑脑cDNA文库中克隆到1条1685nt的锌指蛋白新基因cDNAycb gq ,命名为ZNF302,生物信息学分析表明,ZNF302的C末端含有13个保守的C2H2锌指结构;Northern-blot结果提示这一基因可能存在3．0kb和4.2kb的2种转录本。Unigene软件包分析,该基因定位于19号染色体19q13.2-13.3;cDNA基因芯片检测显示疤痕成纤维细胞经TGFβ1刺激和ECV304细胞经PMA,LPS刺激后,ZNF302基因表达明显升高,提示其与细胞增殖的正调控有关。