Finding finer functions for partially characterized proteins by protein-protein interaction networks

Based on high-throughput data, numerous algorithms have been designed to find functions of novel proteins. However, the effectiveness of such algorithms is currently limited by some fundamental factors, including (1) the low a-priori probability of novel proteins participating in a detailed function; (2) the huge false data present in high-throughput datasets; (3) the incomplete data coverage of functional classes; (4) the abundant but heterogeneous negative samples for training the algorithms; and (5) the lack of detailed functional knowledge for training algorithms. Here, for partially characterized proteins, we suggest an approach to finding their finer functions based on protein interaction sub-networks or gene expression patterns, defined in function-specific subspaces. The proposed approach can lessen the above-mentioned problems by properly defining the prediction range and functionally filtering the noisy data, and thus can efficiently find proteins’ novel functions. For thousands of yeast and human proteins partially characterized, it is able to reliably find their finer functions (e.g., the translational functions) with more than 90% precision. The predicted finer functions are highly valuable both for guiding the follow-up wet-lab validation and for providing the necessary data for training algorithms to learn other proteins.     

第三部门青年组织的社会功能研究

第三部门在公共领域所扮演的特殊角色引起了公众与学术界的广泛关注。采用个案研究的方法,借鉴西方女童子军个案来探讨第三部门青年组织的现实意义和特点,主要从教育功能和社会文明营造两个方面研究了第三部门青年组织的社会功能,并进一步探讨了中国和西方国家第三部门青年组织在社会功能发挥上的差异以及西方第三部门青年组织给国内第三部门青年组织发展带来的启示。     

浅谈网络环境下高校图书馆信息资源建设

阐述了网络环境下高校图书馆信息资源建设存在的主要问题,探讨了网络环境对信息资源建设的影响,提出了信息资源建设的具体措施。     

图书馆在技校教育中的作用

介绍了图书馆教育职能的特点和图书馆发挥教育职能的前提,阐述了技校图书馆发挥教育职能的主要途径。     

开源软件在网络教育中的应用

论述了在教育领域中使用开源软件的必要性,介绍了几种应用于网络教育的开源软件,主要包括服务器软件、工作站软件和课程管理系统。     

新农村职业教育与新农村文化建设

文化功能是教育的基本功能，农村职业教育在新农村文化建设中大有作为。依靠农村职业教育建设农村物质文化、精神文化和制度文化，充分发挥农村文化在新农村建设中的作用。     

一种新的基于Kohonen网络的图像矢量量化

矢量量化是一种重要的数据压缩方法.本文利用Kohonen自组织映射神经网络进行矢量量化,首次较为详细地讨论了具体实现的步骤与细节,并在此基础上为改善边缘质量,提出一种基于Laplas算子检测边缘弓引导神经网络训练的方法,并通过实验证明其效果是明显的.     

亚纯函数与其导数的公共Julia方向

本文研究不指定级的亚纯函数与其导函数的公共Julia方向的存在性问题。     

螺旋霉素发酵过程动态建模的神经网络方法

对文题所述方法,根据实验数据进行仿真研究,获得了满意的结果。为高度复杂的非线性生化过程的模型化提供了一条新的途径。     

特征结构提取的高阶Hopfield神经网络实现

本文首先建立了特征结构提取问题的罚函数表示，通过对罚函数求极小可以求得原始协方差矩阵的主特征向量及其对应的特征值。为了求得其他特征结构，特构造了一个协方差矩阵序列。如果将罚函数展开并进行整理，高阶Ｈｏｐｆｉｅｌｄ神经网络可被引入到特征结构提取中。这种方法比较直观，它将网络稳定时的输出与所求协方差矩阵的主特征向量的各个分量相对应，而网络稳定时的能量则对应于协方差矩阵的迹与所求特征值之差，计算机仿真结果验证了这种方法的正确性。