研究开发出DNA序列并行比对新工具

中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员，带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具-ParaAT（Parallel Alignment and back—Translation）”。该研究成果发表在《生物医药与生物物理研究通讯》期刊上。     

多核处理器的发展历程及其发展趋势

文章从计算机相关技术发展的角度分析了多核处理器的发展历程，根据现今人们对计算机性能、系统优化方面的高要求，分析提出了多核处理器发展的必然趋势。     

全局轮廓形状特征保持的CAD网格模型简化思路分析

本文对机械CAD网络模型进行探究,在该基础上深入分析了全局轮廓形状特征保持的CAD网格模型的简化途径,从点和边混合方法、改进QEM算法、保持全局形状、多边形逼近结果 4方面构建了对应简化框架。本文对CAD网络模型在机械中的运用具有一定的贡献性作用。     

量子并行运算加速能力的研究

本文对量子并行运算和经典并行运算的机理与加速能力进行了分析和对比。     

并行管道阴极保护干扰分析

为了研究土壤电阻率、涂层面电阻、管道间距对并行管道阴极保护干扰的影响,建立了并行管道阴极保护数值模型,通过对数据的分析得出土壤电阻率越大,干扰越严重。管道涂层面电阻越小,干扰越严重。两管道间距越小,干扰越严重。     

基于LMS的多参考通道噪声抵消系统研究

生活中存在的各种噪声严重影响着我们的生活质量,因此对于噪声的消除和抑制一直是一项重要的工作.本文在并行多参考通道降噪系统(PMCS)和矩阵多参考通道降噪系统(MCMS)基础上,提出了串行多参考通道降噪系统(SMCS),并针对两种混合噪声,利用三种多参考通道的方法进行仿真比较.仿真实验结果表明,这三种系统对均能有效的抑制噪声.相比之下,并行多参考通道降噪系统用时较多,而且降噪效果不如另外两种;矩阵多参考通道降噪系统所需设备简单并且具有较好的可扩展性;串行多参考通道降噪系统运行速度最快.     

一种新的基于HPM并行计算性能数据采集方法

针对传统数据采集方法不足和Vtune的局限性,介绍了一种在多处理器环境下基于硬件性能监视器(hardware performance monitor,HPM)的并行计算性能数据采集方法,该方法基于集群和消息传递接口(message passing interface,MPI)环境,利用应用程序性能接口(performa...     

基于多GPU的三维Kirchhoff积分法体偏移

提出3种策略挖掘三维Kirchhoff积分法体偏移在众核GPU(图形处理器)上的并行性.首先,使用数据传输线程和GPU计算线程构造流水线并行框架,基于此框架直接实现异步输入输出(I/O)以减少GPU和网络存储之间数据传输所需的时间;其次,使用GPU的线程满载策略以使指令吞吐量最大化;最后,应用纹理缓存和常量缓存来减少片外存储器访问,并使用固定功能单元计算超越函数.实验结果表明:相比于IntelXeon E5430CPU上的算法串行版本,在nVidia Tesla C1060GPU上的优化算法实现了约20倍的加速比.比较了算法在3种不同GPU架构上的性能,并给出了CPU与GPU结果在0.5×10-4误差限下仅0.3×10-5的浮点数绝对误差.     

基于预算的资源管理模型

针对现有批作业系统中的资源管理方式在资源使用公平性和合理性、作业服务质量(QoS)与实际需求存在较大差距的问题,提出一种基于经济学原理的资源管理模型——BB-RAM模型.模型通过预算机制来实现对计算资源管理和使用的宏观控制,最终达到资源使用最优化和保证作业服务质量的目的.基于实际作业流的仿真结果表明该模型的作业调度的作业延误率、效益值等QoS指标,以及平均响应时间等传统评价指标都优于传统调度策略.     

沉降梁回转机构的分析与仿真

介绍了转向架分离装置总体结构及沉降梁回转机构的工作原理,为了便于分析回转机构的运动特性和动力特性,对该回转机构进行了简化,给出了简化模型的方程和求解过程,对部分方程进行了基于Mathematica软件的仿真分析,结果表明该简化模型有利于直观的分析机构特性,为同类系统分析提供了一定的理论依据。