Finding finer functions for partially characterized proteins by protein-protein interaction networks

Based on high-throughput data, numerous algorithms have been designed to find functions of novel proteins. However, the effectiveness of such algorithms is currently limited by some fundamental factors, including (1) the low a-priori probability of novel proteins participating in a detailed function; (2) the huge false data present in high-throughput datasets; (3) the incomplete data coverage of functional classes; (4) the abundant but heterogeneous negative samples for training the algorithms; and (5) the lack of detailed functional knowledge for training algorithms. Here, for partially characterized proteins, we suggest an approach to finding their finer functions based on protein interaction sub-networks or gene expression patterns, defined in function-specific subspaces. The proposed approach can lessen the above-mentioned problems by properly defining the prediction range and functionally filtering the noisy data, and thus can efficiently find proteins’ novel functions. For thousands of yeast and human proteins partially characterized, it is able to reliably find their finer functions (e.g., the translational functions) with more than 90% precision. The predicted finer functions are highly valuable both for guiding the follow-up wet-lab validation and for providing the necessary data for training algorithms to learn other proteins.     

绿洲-荒漠生态系统演化因素及其非线性探讨——以新疆为例

对立统一于干旱区的绿洲—荒漠生态系统在降水等自然因素和人类活动等人为因素的影响下不断进行着演化.从长期看,这一演化过程具有不可预测性,短期内却有细微可预见性.现如今在绿洲扩展同时,荒漠也在扩展,整体趋势仍是荒漠在扩展.为维持绿洲的稳定性,促使绿洲—荒漠系统处于一种稳定的发展趋势,本文从分析绿洲-荒漠这对对立统一的生态系统入手,在探讨引起这对生态系统演化的自然因素和人为因素的基础上,确定了自然因素中的降水和人为因素中的政府调控行为为演化的主导因素,初步探索了促使这对生态系统统演化的主导因素作用所具有的非线性关系,这对维持绿洲的稳定性,抑制荒漠扩展有一定的实际意义.     

一种新的基于Kohonen网络的图像矢量量化

矢量量化是一种重要的数据压缩方法.本文利用Kohonen自组织映射神经网络进行矢量量化,首次较为详细地讨论了具体实现的步骤与细节,并在此基础上为改善边缘质量,提出一种基于Laplas算子检测边缘弓引导神经网络训练的方法,并通过实验证明其效果是明显的.     

复合氧化物晶体晶格能的近似计算

本文以 Born-Harb 循环为依据,推导了复合晶体晶格能和与其相应的各二元化合物晶体晶格能之间的关系,并由此给出了复合氧化物晶体晶格能近似计算的新公式。对20种复合氧化物晶体晶格能计算结果的分析表明:用本文所给公式对复合氧化物晶体晶格能进行近似计算是可行的。     

C~3I系统理论评述

本文综述了C~3I系统研究中的主要问题与现状,讨论了该系统的建模、效能分析以及影响理论研究的几个因素,并对未来C~3I系统理论的主要问题、难点以及解决手段等进行了探讨。     

边界拟合坐标系中的流动方程

本文提出了流体力学解析边界拟合坐标系方法，及建立在这种坐标系基础上对流动方程进行摄动处理的方法，并列举几种流动建立了解析边界拟合坐标系中的方程。     

Cu基形状记忆合金中析出相的研究

本文利用 X 射线衍射分析、透射电镜等技术,研究了几种热处理制度下 Cu—27.84 Al—3.82 Ni(at%)合金中析出相;用会聚束(CBED)技术测定了析出相与马氏体的取向关系。结果表明:分级处理试样中析出相 r_2是复杂立方结构,晶格参数 a=0.87nm;大量弥散的折出相引起共格应变场,从而使分极处理试样 X 射线衍射峰型宽化;r_2与2H 马氏体的取向关系为;[00]2H‖[001]_r_2,(10)_(2H)‖(300)_r_2。     

气囊式蓄能器在煤矿采掘机械上应用的研究

本文探讨了气囊式蓄能器的工作原理和特性.并就蓄能器在煤矿采掘机械上的应用作了研究和探讨     

正交拉丁矩阵的上下界

引进了一般形式的拉丁矩阵,并讨论了相互正交的拉丁矩阵个数的上下界。     

翅茎香青精油的化学成分

从江西省武功山采集的翅茎香青「Ａｎａｐｈａｌｉｓ ｐｔｅｒｏｃａｕｌａ（Ｆｒａｎｃｄ。ｅｔ Ｓａｖａｔ。）Ｍａｘｉｍ」其精油通过ＧＣ及ＧＣ／ＭＳ分析，共鉴定了３１个化合物，占总量的９０．９１％。其中主要成分为β－丁香烯，含量达４０％以上，为翅茎香青精油的主体成分。油样经轻工业部上海香料研究所评定，认定它与山Ｑｉｕ油的主体成分。油样经轻工业部上海香料研究所评定，认为它与山Ｑｉｕ油的香气相似，可用于调