Structure of epsilon15 bacteriophage reveals genome organization and DNA packaging/injection apparatus

The critical viral components for packaging DNA, recognizing and binding to host cells, and injecting the condensed DNA into the host are organized at a single vertex of many icosahedral viruses. These component structures do not share icosahedral symmetry and cannot be resolved using a conventional icosahedral averaging method. Here we report the structure of the entire infectious Salmonella bacteriophage epsilon15 (ref. 1) determined from single-particle cryo-electron microscopy, without icosahedral averaging. This structure displays not only the icosahedral shell of 60 hexamers and 11 pentamers, but also the non-icosahedral components at one pentameric vertex. The densities at this vertex can be identified as the 12-subunit portal complex sandwiched between an internal cylindrical core and an external tail hub connecting to six projecting trimeric tailspikes. The viral genome is packed as coaxial coils in at least three outer layers with approximately 90 terminal nucleotides extending through the protein core and the portal complex and poised for injection. The shell protein from icosahedral reconstruction at higher resolution exhibits a similar fold to that of other double-stranded DNA viruses including herpesvirus, suggesting a common ancestor among these diverse viruses. The image reconstruction approach should be applicable to studying other biological nanomachines with components of mixed symmetries.     

一种基于事件相关电位的时频表示方法

生物信号的非平稳特性使得经典的时域分析方法和频域分析方法不能更好地描述信号的局部特征,而联合时频表示可以有效地反映信号的瞬时频率特性.事件相关电位(ERP)是指在特定认知任务下获取的脑电信号,它与刺激所引起的皮层电位直接相关,ERP信号的时频分析将有助于从更深层次上解读其中蕴涵的丰富信息.本文在对几种典型时频表示方法的比较基础上,提出了一种基于滤波器组-Hilbert变换的信号时频表示方法,将这几种方法应用到模拟信号的结果表明,该方法可以更好地保留信号时频特征的细节.因此通过将滤波器组-Hilbert变换方法应用到心理学经典Stroop任务的ERP信号分析中,除了可以得到与心理学传统ERP分析一致的结果外,还可以获取比之更为丰富的信息.     

蔗糖、甜蜜素与白酒对白蚁引诱效应的分析

本文研究了蔗糖、甜蜜素和白酒对台湾乳白蚁和黄肢散白蚁的引诱效果.结果表明50%的蔗糖和酒精含量为40%的白酒对台湾乳白蚁具有较强的引诱效果,20%的甜蜜素对台湾乳白蚁具有轻微的引诱效果; 15%的蔗糖和酒精含量为50%的白酒对黄肢散白蚁具有一定的引诱效果,而甜蜜素对黄肢散白蚁基本没有引诱效果.     

双向零知识证明与初等函数两方保密计算

提出了双向零知识证明的概念,研究了双向零知识证明与传统的零知识证明之间的关系,设计了两个最基本的双向零知识证明协议。提出并研究双向零知识证明的目的是希望用双向零知识的思想,研究多方安全计算问题。将双向零知识证明协议用于构造两方保密计算协议,取得了一些结果：设计了容忍恶意行为的指数函数,幂函数,对数函数,三角函数的两方安全计算协议：研究了健忘计算多项式的协议。     

融合多传感器信息的移动机器人自定位方法

提出一种给定环境模型下移动机器人全局自定位算法,通过融合声纳传感器和视觉传感器的异质传感信息把具有多模态、鲁棒性强的Markov方法和单模态、高效准确的EKF方法组合应用并加以改进,来实现准确和快速的全局定位,同时提高位姿跟踪的准确性.Markov方法中位姿空间的低分辨率离散减小了存储需求,声纳感知模型对位姿空间分布进行初始化并提供了全局的位姿假设,视觉感知模型实现了位姿分布更新,而基于视觉特征的EKF方法则提高了定位的精度.实验结果验证了本方法的有效性.     

复发事件数据在含治愈个体的半参数比率模型下的经验似然推断

随着医学的发展,某些无法治愈的疾病能够被治愈,并且在一段时间内不复发,从而导致在复发事件数据中出现治愈个体.本文针对复发事件数据基于含治愈个体的半参数比率模型提出一种经验似然方法,建立经验对数似然比函数,并证明Wilk's定理.通过数值模拟将所提出的经验似然方法与正态逼近方法进行比较,得到在样本量较小时,所提出的经验似...     

基于IPA的服务质量测评

针对服务质量测评问题,构建了服务质量测评指标体系,并基于重要性-绩效分析(IPA)的方法与思想进行了服务质量测评.在测评过程中,首先,采用问卷调查的方式获取顾客的相关评价信息,并通过对评价信息的处理来计算各指标的绩效,然后,考虑到服务质量测评中指标重要性与指标绩效之间具有的因果关系,通过构建BP神经网络来计算指标的重要...     

青岛中港微型生物膜中污损细菌群落初探

本研究拟通过揭示微型生物膜中的细菌群落特征,为污损生物学和海洋腐蚀学的微观研究提供参考和启示。试验采用3种方法:传统稀释涂布法、流式细胞仪计数法以及16srDNA扩增子高通量测序对青岛中港冬季海水以及玻璃板中微型生物膜中的污损细菌群落结构进行分析。试验结果表明冬季海水表层和底层中细菌的浓度分别为3.0×10~8 CFU/L和6.9×10~7 CFU/L,表层和底层玻璃板微型生物膜中的细菌浓度分别为7.2×10~7 CFU/L和2.1×10~7 CFU/L,海水和玻璃板中的细菌以Proteobacteria和Bacteroidetes为主。另外,海水中细菌群落结构组成与玻璃板微型生物膜中细菌具有较高的一致性。本研究利用不同的试验方法揭示微型生物膜中的细菌群落特征,对深入研究生物污损,从根本上解决海洋生物污损问题、制定绿色防污措施具有重要的现实意义。     

基于高斯混合模型的敞开式质谱重叠峰解析方法

针对敞开式质谱重叠峰影响待测物特征峰识别的问题,提出了基于高斯混合模型的重叠峰解析方法.根据手肘法和质谱图中各参数意义有效选取模型初始参数,然后研究了该方法在重叠峰不同幅值比、分离度和噪声下的解析效果,并对敞开式质谱实测冰毒碎片离子的重叠峰进行解析.结果 表明,模拟数据的各个参数在解析后变化较小,均值和标准偏差的最大相...     

高温高密度无黏土相钻开液室内研究

传统的高密度钻井液采用膨润土来配制,高温下膨润土含量过高会过度分散,导致钻井液黏度和切力增大,膨润土含量过低会导致膨润土聚集,破坏钻井液稳定性,导致加重剂沉降,引发钻井事故。本文通过室内研究,建立了一套抗高温无黏土相甲酸盐钻开液体系,该体系具有黏度切力适中、高温稳定、抗污染能力强,有良好的抑制性等特点,酸化完井后渗透率恢复值可达94%,储层保护效果良好。