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71.
Finding finer functions for partially characterized proteins by protein-protein interaction networks
LI YanHui GUO Zheng MA WenCai YANG Da WANG Dong ZHANG Min ZHU ding ZHONG GuoCai LI YongJin YAO Chen WANG Jing 《科学通报(英文版)》2007,52(24):3363-3370
Based on high-throughput data, numerous algorithms have been designed to find functions of novel proteins. However, the effectiveness of such algorithms is currently limited by some fundamental factors, including (1) the low a-priori probability of novel proteins participating in a detailed function; (2) the huge false data present in high-throughput datasets; (3) the incomplete data coverage of functional classes; (4) the abundant but heterogeneous negative samples for training the algorithms; and (5) the lack of detailed functional knowledge for training algorithms. Here, for partially characterized proteins, we suggest an approach to finding their finer functions based on protein interaction sub-networks or gene expression patterns, defined in function-specific subspaces. The proposed approach can lessen the above-mentioned problems by properly defining the prediction range and functionally filtering the noisy data, and thus can efficiently find proteins’ novel functions. For thousands of yeast and human proteins partially characterized, it is able to reliably find their finer functions (e.g., the translational functions) with more than 90% precision. The predicted finer functions are highly valuable both for guiding the follow-up wet-lab validation and for providing the necessary data for training algorithms to learn other proteins. 相似文献
72.
DRM是频率在30MHz以下的数字广播系统,抗多径衰弱和干扰强,适合实现单频网,本文在DRM单频网仿真分析的基础提出了网络规划策略,描述了实现发射机时延校正方法. 相似文献
73.
工程中常用的几种氧化沟及其发展 总被引:2,自引:0,他引:2
简要介绍了当今工程中常用的几种氧化沟技术的特点及其发展历程,主要包括Carrousel氧化沟、Orbal氧化沟、交替式氧化沟以及一体化氧化沟。 相似文献
74.
75.
20世纪90年代中期以来,知识分子民间立场、民间文化形态、民间审美形态、民间隐形结构等一系列学术范畴的建立,突破了文学史叙述在知识分子/政治意识形态、传统/现代等二元结构上的局限,拓展了文学研究的多维文化空间. 相似文献
76.
77.
曾净 《陕西师范大学学报(自然科学版)》2006,(Z2)
编程是指用程序设计语言来生成能够被计算机识别的系统过程.在编程过程中,随着计算机的发展,人们采用过各种各样的方法,过去基本上采用的是面向过程的程序设计方法,而现在采用的是面向对象的程序设计方法.文中就面向对象程序设计方法中类的概念和应用做了一些讨论. 相似文献
78.
79.
杨泽民 《山西大同大学学报(自然科学版)》2007,23(1)
增量式更新算法能充分利用已挖掘出的知识来提高挖掘效率,是数据挖掘高效算法研究中一个主要方向.本文首先分析了经典的关联规则增量式更新算法FUP(Fast Updating algorithm)算法的不足,提出了一种改进的关联规则增量式更新算法IIUA(Improved Incremental Updating Algorithm),极大地降低了存储空间和挖掘时间需求,从而提高了整个关联规则挖掘的效率. 相似文献
80.
针对认知无线电(CR)系统中频谱感知技术能量效率低的问题,提出了一种基于二分法迭代寻优的联合优化算法。该算法通过联合传输功率与感知时隙进行优化,最大化地提高了CR系统的能量效率,并且在针对优化参数ξ的寻优过程中,使用了二分法与迭代算法结合的寻优方法。通过理论分析,与其他类似算法相比,该算法的寻优速度更快,算法复杂度更低,函数收敛速度更快,实际应用的可扩展性更强。数值仿真分析结果表明,在保证检测性能的前提下,提出的算法能够很好地解决能效的最优化问题,在恒定检测概率Pd=0.9和Pd=0.7条件下,所提出算法的能耗开销均低于其他算法,在系统吞吐量中所提出算法均优于其他算法,为CR系统的发展提供了理论支撑,更加符合未来CR系统的节能发展方向。 相似文献