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21.
Genome-wide association studies of 14 agronomic traits in rice landraces   总被引:20,自引:0,他引:20  
Huang X  Wei X  Sang T  Zhao Q  Feng Q  Zhao Y  Li C  Zhu C  Lu T  Zhang Z  Li M  Fan D  Guo Y  Wang A  Wang L  Deng L  Li W  Lu Y  Weng Q  Liu K  Huang T  Zhou T  Jing Y  Li W  Lin Z  Buckler ES  Qian Q  Zhang QF  Li J  Han B 《Nature genetics》2010,42(11):961-967
Uncovering the genetic basis of agronomic traits in crop landraces that have adapted to various agro-climatic conditions is important to world food security. Here we have identified ~ 3.6 million SNPs by sequencing 517 rice landraces and constructed a high-density haplotype map of the rice genome using a novel data-imputation method. We performed genome-wide association studies (GWAS) for 14 agronomic traits in the population of Oryza sativa indica subspecies. The loci identified through GWAS explained ~ 36% of the phenotypic variance, on average. The peak signals at six loci were tied closely to previously identified genes. This study provides a fundamental resource for rice genetics research and breeding, and demonstrates that an approach integrating second-generation genome sequencing and GWAS can be used as a powerful complementary strategy to classical biparental cross-mapping for dissecting complex traits in rice.  相似文献   
22.
Huang X  Zhao Y  Wei X  Li C  Wang A  Zhao Q  Li W  Guo Y  Deng L  Zhu C  Fan D  Lu Y  Weng Q  Liu K  Zhou T  Jing Y  Si L  Dong G  Huang T  Lu T  Feng Q  Qian Q  Li J  Han B 《Nature genetics》2012,44(1):32-39
A high-density haplotype map recently enabled a genome-wide association study (GWAS) in a population of indica subspecies of Chinese rice landraces. Here we extend this methodology to a larger and more diverse sample of 950 worldwide rice varieties, including the Oryza sativa indica and Oryza sativa japonica subspecies, to perform an additional GWAS. We identified a total of 32 new loci associated with flowering time and with ten grain-related traits, indicating that the larger sample increased the power to detect trait-associated variants using GWAS. To characterize various alleles and complex genetic variation, we developed an analytical framework for haplotype-based de novo assembly of the low-coverage sequencing data in rice. We identified candidate genes for 18 associated loci through detailed annotation. This study shows that the integrated approach of sequence-based GWAS and functional genome annotation has the potential to match complex traits to their causal polymorphisms in rice.  相似文献   
23.
提出了连续系统的部分异步并行仿真算法及其在多计算机系统上的实现方法。为保证仿真结果的正确和提高仿真速率 ,所提出的连续系统的高效的部分异步并行仿真方案和适应消息传递的星型虚拟拓扑结构方案可有效地解决连续系统仿真的“算法 -结构匹配问题”。多计算机系统上连续系统仿真的特点之一是处理器间的通信非常频繁且消息很短 (一般为数个或数十个浮点数 ) ,因而在实现部分异步并行仿真时采用了异步传输方式来减少通信开销在仿真计算中的比例。实验结果表明 ,所提出的部分异步并行仿真比其对应的同步仿真具有更高的并行计算效率。  相似文献   
24.
地铁开挖对邻近管线的影响已成为地铁工程中的重点问题.文章结合西安地铁二号线,模拟了CD、CRD法开挖对既有给水管影响变形的全过程,通过计算分析比较得出了较为合理的开挖和支护方法,供类似工程参考.  相似文献   
25.
采用X光衍射、程序升温脱附、扫描电镜、微活性测试及表面结构测试等方法,对不同热载体的性能与结构进行了考察。结果表明,热载体是一种具有低比表面、低催化活性的情性物质,孔径范围大多在15~60nm,热载体的孔结构类似于平行壁的狭缝状毛细孔结构。用胜利常压渣油作原料,在固定流化床反应器中考察不同热载体的反应性能,发现热载体结构对反应结果有很大影响,同时,热载体还有较强的抗重金属的污染能力。  相似文献   
26.
以添加不同数量胶质或沥青质的胜利减二线为原料油,采用2~#热载体,在固定流化床反应装置上考察了胶质、沥青质的转化。结果表明,在通常的反应条件下,胶质大部分转化为液体,沥青质大部分转化为焦炭。采用热接触改质,可脱除渣油中40~60%的S、N,90%左右重金属Ni以及85%以上的残炭,约90%的胶质和近乎100%的沥青质。  相似文献   
27.
28.
人工引入核电站排放的关键核素 ̄(131)I,采用γ能谱和总β计数两种方法确定核素在土壤-蔬菜系统中的转移系数。测得核素不同迁移时间、不同生长期的蔬菜、以及土壤中不同核素浓度等各种情况下的转移系数。给出转移系数的频数分布及变异性。γ能谱法测得的 ̄(131)I在广东土壤-蔬菜系统中转移系数的观察值范围为1.28×10 ̄(-2)~2.10×10 ̄(-1),几何平均值为5.05×10 ̄(-2),几何标准偏差为1.96.实验中观察到蔬菜棵株大小、不同气候条件等因素对转移系数的影响。  相似文献   
29.
本文介绍的活性二氧化硅的制备及性质实验是为化学专业无机化学实验课而设计的一个综合性实验。本实验具有综合性强,制备条件温和,时间短,实验耗费低及原料易得等优点。  相似文献   
30.
本文描述了工程数据库管理系统(EDBMS)的主要任务及其特点,分析了工程数据库系统的可靠性相关因素,提出了工程数据库管理系统对工程数据库的两种不同操作方式下系统的可靠性设计方法,重点阐述了事务管理的可靠性设计、设计版本管理及其控制的可靠性设计.  相似文献   
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