The medaka draft genome and insights into vertebrate genome evolution

Teleosts comprise more than half of all vertebrate species and have adapted to a variety of marine and freshwater habitats. Their genome evolution and diversification are important subjects for the understanding of vertebrate evolution. Although draft genome sequences of two pufferfishes have been published, analysis of more fish genomes is desirable. Here we report a high-quality draft genome sequence of a small egg-laying freshwater teleost, medaka (Oryzias latipes). Medaka is native to East Asia and an excellent model system for a wide range of biology, including ecotoxicology, carcinogenesis, sex determination and developmental genetics. In the assembled medaka genome (700 megabases), which is less than half of the zebrafish genome, we predicted 20,141 genes, including approximately 2,900 new genes, using 5'-end serial analysis of gene expression tag information. We found single nucleotide polymorphisms (SNPs) at an average rate of 3.42% between the two inbred strains derived from two regional populations; this is the highest SNP rate seen in any vertebrate species. Analyses based on the dense SNP information show a strict genetic separation of 4 million years (Myr) between the two populations, and suggest that differential selective pressures acted on specific gene categories. Four-way comparisons with the human, pufferfish (Tetraodon), zebrafish and medaka genomes revealed that eight major interchromosomal rearrangements took place in a remarkably short period of approximately 50 Myr after the whole-genome duplication event in the teleost ancestor and afterwards, intriguingly, the medaka genome preserved its ancestral karyotype for more than 300 Myr.     

雷洛昔芬通过调节端粒酶活性抑制Aβ所致神经细胞凋亡

目的:探讨雷洛昔芬是否具有类似于雌激素对转染了雌激素受体estrogen receptor(ER)α的PC12细胞有保护作用,即对抗淀粉样蛋白AB所致细胞凋亡及活化端粒酶活性.方法:在转染了雌激素受体ERα的PC12细胞(PCER)及转染了对照基因质粒的PC12细胞(PCCON)中分别添加不同的药物.用TUNEL染色法观察细胞凋亡情况;stretch PCR试剂盒分析端粒酶的活性.结果:在经过Aβ处理后的PCER中添加10-8 M雷洛昔芬与10-8雌激素后细胞凋亡数显著减少,而在PCCON中则无明显差异;雌激素和雷洛昔芬对PCER细胞显著促进其端粒酶活性,对PCCON 细胞无此作用.结论:雷洛昔芬与雌激素对有雌激素受体表达的PC12细胞均有活化端粒酶活性,抑制淀粉样蛋白Aβ诱发的细胞凋亡作用,表明雌激素和雷洛昔芬抑制Aβ所致细胞凋亡的作用是通过雌激素受体ER α来实现的.     

Copula函数在金融市场上的应用

文章根据非参数蒙特卡罗检验法,选择合适的Copula函数将其应用于我国基金市场的风险度量,进行Monte Carlo模拟计算投资组合的VaR;并将Copula方法的计算结果与传统的正态假设模拟结果进行比较,表明Copula方法对金融风险的度量要明显优于正态方法。     

智能自校正多模态轨迹跟踪控制

对于类似于机械手的运动轨迹跟踪和定位控制,为了获得良好的跟踪性能和定位精度,针对复杂多变的被控对象,运用智能控制理论,引入对象过程特征和行为特征的概念,以对象的过程特征状态和行为特征状态为条件元素,构造了1个分层递阶高阶产生式跟踪控制系统结构.系统在运行过程中通过对对象的过程特征和行为特征辨识,实现控制器参数的自动调节和多模态控制.为了具体实现该系统结构的应用,建立用于过程特征辨识、参数校正和控制决策的特征模型,以及从过程特征状态集、行为特征状态集到参数校正模态集和控制决策模态集的映射关系.针对机械手的运动特性进行了仿真研究,仿真结果表明,该系统结构具有较强的鲁棒性,是一种行之有效的方法.     

长波和甚长波及其双色InAs/GaSb二类超晶格红外探测器的研究进展

本文报道了基于InAs/GaSb二类超晶格实现长波、甚长波及窄带长波/甚长波双色红外探测器的研究,生长的材料具有极高的材料质量.长波探测器单管器件在77 K条件下50%截止波长为9.6μm,峰值响应为3.2 A/W,峰值量子效率为51.6%;甚长波红外探测器单管器件在77 K条件下50%截止波长为14.5μm,量子效率为14%,热噪声限制的探测率为4.3×109 cm Hz1/2 W-1.通过改变偏压极性实现双色探测的窄带型长波/甚长波InAs/GaSb二类超晶格红外探测器两端器件,偏压小于0 V时在长波区工作,偏压大于40 mV时,在甚长波区工作.具体来说,偏压为-0.1 V时,器件光响应50%截止波长为10μm;而偏压为40 mV时,器件光响应50%截止波长为16μm.对于长波光响应,δλ/λ为44%,对于甚长波响应,δλ/λ为46%.甚长波对长波的串音为9.9%,长波对甚长波的串音为11.8%.     

断陷盆地“不对称”火山岩喷发特征与有利储层主控因素探讨

通过大量钻井资料及地震资料的对比研究, 建立松辽盆地不对称火山岩喷发模式, 指出火山岩在断层高部位向低洼区流动, 高部位一翼延伸规模小, 低洼区延伸规模大。在对全区257口钻遇火山岩探井统计的基础上, 明确了火石岭组和营城组火山岩的分布规律, 认为酸性火山岩是优势储层岩类; 火山岩岩相控制优质储层的分布, 近火山口不对称的酸性爆发相为火山岩有利储层发育相带; 裂缝是深部流体运移的重要通道, 能改善渗透条件, 促使次生孔隙发育, 是高产气藏形成的关键, 高角度裂缝和溶蚀孔隙组合带是火山岩储层发育的有利区带。此外, 建设性的成岩表生作用是优质储层形成不可忽视的因素。     

德国入境松木中锥尾伞滑刃线虫新纪录

宁波出入境检验检疫局植检实验室在1份来自德国的松木质包装材料中截获一种伞滑刃线虫,经形态学观察、测量,以及ITS-RFLP图谱比对,鉴定为锥尾伞滑刃线虫（Bursaphelenchus conicaudatus Kanzaki,Tsuda ＆ Futai,2000）.该线虫属松材线虫组,与松材线虫（B.xylophilus）、拟松材线虫（B.mucronatus）、伪伞滑刃线虫（B.fraudulentus）、豆伞滑刃线虫（B.doui）等比较接近,但其雌虫尾较上述线虫更细长（c′=4.5）,并且明显向腹面弯曲,尾尖突位于腹面,长约2～3μm;雄虫交和伞一般呈卵圆形或铲形.目前该线虫仅日本有报道,在德国尚无记载.作者对其形态特征作了描述,并与4个近似种作了比较.     

绘平面控制网图和误差椭圆图程序

本程序采用ＢＡＳＩＣ语言编制，用于ＰＣ－Ｅ５００袖珍计算机和ＮＦ－ＰＰ４０精密四色绘图仪。该程序适用于绘制各种平面控制网图和各点上的误差椭圆图。本程序使用键盘输入语句和置数语句、读数语句，计算机根据输入的数据，逐一打印，以便查对，然后绘出平面控制网图。根据使用者的需要，是否绘出各未知点上的误差椭圆图。最后打印出绘图比例尺。     

潜艇水下定位合作声信号的低截获性分析

为了适应水声对抗演习中实时监控潜艇的位置,从检测能力和声呐方程2方面分析了合作声信号的低截获特性.对比研究了扩频信号与常规的CW信号和线性调频信号的低截获性能,并进行了计算机仿真验证.仿真结果表明:采用扩频信号具有较低的截获性能和较好的检测能力.     

内燃机车喷雾冷却的模拟研究

针对机车在夏季通过长隧道时,冷却系统散热能力降低,易造成机车因冷却水温过高达到设定温度而卸载的问题,在不改变原有冷却系统的基础上,增加喷淋雾化冷却装置.采用CFD软件进行仿真计算,模拟喷淋雾化前后的温度场,并对温度场进行对比.模拟结果表明,增加喷淋雾化装置后冷却系统散热能力得到提高.