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Finding finer functions for partially characterized proteins by protein-protein interaction networks
LI YanHui GUO Zheng MA WenCai YANG Da WANG Dong ZHANG Min ZHU ding ZHONG GuoCai LI YongJin YAO Chen WANG Jing 《科学通报(英文版)》2007,52(24):3363-3370
Based on high-throughput data, numerous algorithms have been designed to find functions of novel proteins. However, the effectiveness of such algorithms is currently limited by some fundamental factors, including (1) the low a-priori probability of novel proteins participating in a detailed function; (2) the huge false data present in high-throughput datasets; (3) the incomplete data coverage of functional classes; (4) the abundant but heterogeneous negative samples for training the algorithms; and (5) the lack of detailed functional knowledge for training algorithms. Here, for partially characterized proteins, we suggest an approach to finding their finer functions based on protein interaction sub-networks or gene expression patterns, defined in function-specific subspaces. The proposed approach can lessen the above-mentioned problems by properly defining the prediction range and functionally filtering the noisy data, and thus can efficiently find proteins’ novel functions. For thousands of yeast and human proteins partially characterized, it is able to reliably find their finer functions (e.g., the translational functions) with more than 90% precision. The predicted finer functions are highly valuable both for guiding the follow-up wet-lab validation and for providing the necessary data for training algorithms to learn other proteins. 相似文献
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郎炜 《科技情报开发与经济》2007,17(13):259-260
介绍了热量计量的基本原理和热费确定的基本原则,阐述了供热总费用的构成与计算原理以及用户热费的构成与计算原理。 相似文献
105.
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本文详细地叙述了“医院门诊部为门诊病人服务的CGPSS-F仿真系统”数据采集与分析的方法.利用CGPSS-F仿真系统的驻留在队列中的实体数和资源处于繁忙状态的单元数,合理调整实体在系统的时间.根据资源容量的利用,实体排队的长度和实体在系统的时间,确定实用的系统参数. 相似文献
107.
108.
汪火云 《江西师范大学学报(自然科学版)》1993,17(2):131-132
本文引进了θ-聚点,II-列闭空间与II-序列闭空间的概念,并对II-可数闭空间、II-列闭空间、II-序列闭空间建立了一些关系. 相似文献
109.
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用程序降温法生长了SrFCl:Eu~(2+)晶体,并测量了它的电子自旋共振谱。应用最小二乘法拟合技术对g因子及自旋哈密顿参数进行了精确拟合。报道了各向异性的g因子及有关自旋哈密顿参量。发现并归属了Eu~(2+)的高阶禁阻跃迁。 相似文献