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Linux平台下EST序列分析系统的构建应用实例 总被引:2,自引:0,他引:2
利用抑制削减杂交和基因芯片技术获得一批黄孢原毛平革菌特异表达的SET序列,使用Phrap、EMBOSS、B1ast、GENSCAN、MZEF软件,基于Linux操作系统,构建EST序列分析系统,完成了从EST和基因组Blast数据库的构建,载体序列的去除,EST序列的分类和组装,EST序列在基因组上的定位,外显子和内含子的识别以及基因预测,并通过使用perl语言结合bioperl模块写的脚本程序使分析过程自动化,从而可以快速地对大批EST序列进行分析,为克隆相关基因及研究黄孢原毛平革菌功能基因组学提供有用的信息。 相似文献
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从正常人外周血中分离中性粒白细胞(WBC),提取总RNA,用RT—PCR的方法扩增人乳铁蛋白(hLF)cDNA.cDNA分hLF1.5、hLF0.8两段扩增并连入pMD18-T载体上,再利用限制酶连入巴氏毕赤酵母表达载体pPICZα—A中,构成完整的hLF基因.序列测定表明,所克隆的hLF基因序列全长为2,136bp,与Gene Bank中登录的序列相比,同源性达99%以上. 相似文献
113.
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设计了外观缺陷识别与剔除试验系统,利用产品图像的颜色特征和形状特征,可实现油炸鱼豆腐外观质量的在线检测、识别与自动剔除.在产品外观颜色检测中利用RGB颜色空间中的B分量阈值作为特征;在产品外形缺陷检测中采用目标面积和边缘形状矩形度实现特征识别.经排序机构将产品有序排列后,根据各列缺陷识别结果,由单片机控制剔除装置完成相应动作,剔除不合格品.实验表明:该试验系统可有效完成油炸鱼豆腐产品的在线外观检测及残次品的剔除,提升生产线成套装备的技术水平. 相似文献
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本文采集了皖西地区340例汉族学生的趾纹学标本,统计出各趾在左右各趾中的分布规律,男女各趾纹的分布差别,计算出趾嵴纹数,并利用上述数据,初步分析了趾纹的遗传力 相似文献
120.
降水时间序列的聚类分析和预测 总被引:8,自引:0,他引:8
本文阐述了对160个中国大陆降雨序列进行同步预测的完整方法。预测模型是用多元分析和随机序列等方法综合建立的, 预测结果较好。文中重点研究能用个人计算机可方便地同时预测这160个点的方法。因此, 首先采用聚类方法将160个点的降水序列分成若干个局部特征相似的几个子类。采用该法的分类结果与国内大多数着名专家的分类结果相似。采用数据压缩法求出每个子类周期性特征的主成分序列, 计算中在精度损失不大情况下尽量压缩计算量。该模型预测一年后的降雨量, 获得令人满意的结果。 相似文献