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【目的】基因复制及随后的功能分化是基因组和物种演化的重要驱动力。植物特有的转录因子家族SPL(SQUAMOSA-promoter binding protein like)广泛参与调控植物生长发育及响应逆境胁迫,为研究重复基因的起源方式和进化命运提供了良好的研究系统。本研究对葡萄(Vitis vinifera)、番木瓜(Carica papaya)、毛果杨(Populus trichocarpa)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)4种模式植物的SPL基因家族开展基因复制及功能分化分析,为进一步研究SPL基因功能、预测种属特异性的功能基因提供系统进化角度的参考。【方法】利用SBP特征结构域,鉴定葡萄、番木瓜、毛果杨和拟南芥4种模式植物中SPL基因家族成员,并利用最大似然法构建系统进化树。基于物种内、物种间基因组共线性,分析SPL基因家族发生基因复制的方式及差异保留情况,并计算保留的SPL直系和旁系同源基因的同义、非同义替换率,分析功能分化情况。【结果】在4种模式植物中共鉴定出SPL基因73个,其中42个是miR156的靶基因。系统进化分析显示:73个SPL基因聚类为9个主要分支,miR156靶向SPL基因成簇聚集在6个主要分支;Clade I中SPL基因编码的2个锌指结构基序为C4和C2HC,而其余8个分支中SPL基因的锌指结构基序由C3H和C2HC组成。大规模基因组复制事件(片段复制或全基因组复制)是SPL基因家族发生基因重复的主要方式。根据基因组复制事件推算,15个古基因位点理论上应复制出的360个位点中,83.6%的重复位点发生丢失或演化成非SPL基因。本研究鉴定出旁系同源基因17对,直系同源基因27对,且所有旁系和直系同源基因的Ka/Ks(非同义替换率和同义替换率之比)值均小于1。【结论】在不同物种中保留下来的SPL直系同源基因受到较强的纯化选择,在功能上具有保守性;同一物种中保留下来的SPL旁系同源基因在进化过程中维持部分功能冗余,但在组织表达偏好性和蛋白功能上已呈现出不同形式的分化。 相似文献
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43.
自由曲面检测中点云偏差色斑图的显示 总被引:1,自引:0,他引:1
针对基于实体CAD模型的数字化检测过程中可视化偏差表示的效率问题,提出了一种采用K-D树的近似偏差可视化表达方法.与点到自由曲面精确偏差表达不同,首先对待测CAD模型曲面进行指定尺度的离散,形成CAD模型点云数据.然后,利用K-D树的分治搜索策略,使点与面距离计算近似地表达成点与点的距离计算,使算法的运算复杂度由O(N3)降低为O(N2logN),其表达精度达到全局性观测的目的,并在ACISRⅡ与HOOPS800图形平台上通过结点颜色插值实现点云色斑图的显示.最后,以某型号车灯零件为例进行验证,取得了较好的效果. 相似文献
44.
使用仿射变换内点回代技术的不定dogleg算法解线性不等式约束的非线性优化问题.通过对构造的仿射不定dogleg路径进行搜索得到迭代方向,结合线搜索内点回代技术获得可接受的步长因子,产生保证目标函数值单调下降的严格内点可行迭代序列.在合理的假设条件下。给出了不定dogleg路径的良好性质,从而证明了算法不仅具有整体收敛性,而且保持超线性收敛速率.数值计算结果表明了算法的有效性. 相似文献
45.
46.
从矿床地质特征、成矿时代、岩石地球化学、大地构造背景、火山喷发模式及岩浆来源、水的赋存形式及来源、水化蚀变、矿床成因等方面对世界珍珠岩地质背景进行了综述.结果表明珍珠岩的形成过程和成矿物化条件方面尚有许多具体问题未进行合理的解释,限制了珍珠岩成岩-成矿理论和找矿实践的深入研究.最后,对今后珍珠岩研究中存在问题和发展趋势给出了具体建议. 相似文献
47.
地理知识来源于生活,也将用之于生活。即使初中地理知识以理论的形式出现在学生的面前,但是只要教师合理地引导,相信学生能够感受到地理与生活的密切联系。作为初中的地理教师,当初中地理以崭新的面孔树立在小升初的学生面前时,教师必须做好充分的教学准备,陪伴学生接受并理解初中三年的地理教学。总结个人的教学经验,我觉得在地理教学的过程中需要注重累积。 相似文献
48.
49.
网络学习方式以其特有的优势为任职教育提供便利的同时,也对任职教育的教学观念、教学方法和管理体制提出了新的要求。该文阐述了网络学习方式对任职教育产生的影响,并就如何更好地开展网络学习提出了应对措施。 相似文献
50.