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基因序列的真实EST匹配识别与外显子区鉴定 总被引:2,自引:0,他引:2
迄今已巨量积累的EST(表达序列标签)数据在寻找新基因、疾病相关基因以及识别选择性剪接与SNP位点等方面均具有重要应用价值,正确确定与基因序列真正相关的EST是有效开展这些应用研究的基础。本研究在对部分已知基因序列与EST数据库比对搜索的匹配结果进行深入分析的基础上,总结出了匹配程度检验、Gap检验、包含性检验、长度检验等多种措施对EST匹配结果的真假进行判别,并研制出了相应的分析软件EDSAc1.0,用于从基因序列的众多EST匹配中尽可能地筛选出真正相关的匹配。在此基础上,该软件可进一步鉴定出基因序列中的外显子区域。用标准测试数据集HMR195中的人类基因序列对其性能进行测试时,EDSAc1.0鉴定出的蛋白编码区在核苷酸水平上的专一性Sp达到了0.997,敏感度Sn达到了0.88,优于对国际同类软件TAP的对比测试结果。EDSAc1.0已提供网上服务(http://infosci.hust.edu.cn)。 相似文献
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分析了JobShop作业计划中两个比较困难的约束条件,即缓冲区容量与刀具容量的限制,得出了通用型的刀具容量计算公式和调度系统的目标函数,并据此提出了一种全局动态调度算法.仿真模拟结果表明这种算法具有较好的全局性和实时性. 相似文献
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作文教学是语文教学的主要内容,是提高学生语言文学素养的重要途径,也是提高学生基本素质的重要载体。做好作文教学,必须处理好作文教学与阅读的关系、作文教学与育人的关系、作文教学的目的与作文教学的过程的关系。 相似文献
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社会服务承诺制、是在社会主义市场经济条件下出现的将自我约束与社会监督相结合的新型管理机制。在法制经济的时代背景中,社会服务承诺制有着十分重要的法律意义。服务承诺是一项民事要约行为,受到我国民事法律的调整与规约,同时,也受相关经济法律、法规的规范与制约。社会服务承诺制是一项既符合市场经济的时代要求,又符合社会主义伦理道德要求的管理机制,同时也是将服务行业导向法制化管理的最佳形式。 相似文献
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采用第一性原理非平衡格林函数方法研究了有机物分子HOOCC6H4(CH2)n置于2个铝电极之间时的导电性质.随着CH2数目n的增加,体系的平衡电导成指数减少.当n≥2时,体系的I-V曲线出现了很大的不对称性:加负电压时,通过分子的电流非常小;而加正电压时,电流随着电压的升高而急剧增大且在特定的电压处出现了很大的负微分电阻;当n=5时,得到了一个很好的整流系数为38. 相似文献
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该文用第一性原理非平衡格林函数方法研究了掺杂对7个碳原子组成的一维原子链的输运性质的影响.碳原子链放在具有有限截面的Al(100)电极中.特别地,我们选取了7种常见的气体分子(H2、O2、CO2、HCl、NO、NO2、SO2)作为研究对象,研究发现,气体分子的介入不但改变了碳链上电荷的分布,而且不同程度地减少了从电极转移到碳链和气体上的电荷数目,对体系输运性质产生很大的影响.特别地:放置H2时,使碳链体系的平衡电导由1.06 G0降为1.01 G0;而放置SO2时,使其平衡电导竟降到了0.1 G0.此外,研究放置各种气体分子时,体系的电流-电压(I-V)特性,在0~1.0 V的电压范围内,放置NO、HCl、NO2时出现了很大的负微分电阻,而放置O2、CO2时没有出现负微分电阻. 相似文献
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将水稻基因结构预测问题划分为基因级、元件级和特征级等多个层次上的一系列较简单子问题,分析了各特征与序列C G含量之间的依赖关系,通过采用从简单到复杂逐级优化的策略建立了不同序列C G含量的水稻基因结构模型,设计了基因结构寻优的动态规划算法,开发了水稻基因结构预测软件Rice-GenePRE.采用测试数据集OsSNG550对该软件进行测试的结果显示:RiceGenePRE在核苷酸、外显子和基因水平上的预测效果均优于水稻基因结构预测系统FGENESH. 相似文献